MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017268	GTACT	2	10	647442	647451	20 %	40 %	20 %	20 %	384422101
11502	NC_017268	GAA	2	6	647452	647457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422101
11503	NC_017268	CGG	2	6	648226	648231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422102
11504	NC_017268	GAA	2	6	648318	648323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422102
11505	NC_017268	TCC	2	6	648341	648346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422102
11506	NC_017268	CTC	2	6	648360	648365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422102
11507	NC_017268	CA	3	6	648377	648382	50 %	0 %	0 %	50 %	384422102
11508	NC_017268	CT	4	8	648385	648392	0 %	50 %	0 %	50 %	384422102
11509	NC_017268	AC	3	6	648436	648441	50 %	0 %	0 %	50 %	384422102
11510	NC_017268	CAA	2	6	648462	648467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422102
11511	NC_017268	TAC	2	6	648481	648486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422102
11512	NC_017268	TGAC	2	8	648590	648597	25 %	25 %	25 %	25 %	384422102
11513	NC_017268	GCC	2	6	648640	648645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422102
11514	NC_017268	ACT	2	6	648653	648658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422102
11515	NC_017268	T	6	6	648667	648672	0 %	100 %	0 %	0 %	384422102
11516	NC_017268	TGC	2	6	648697	648702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422102
11517	NC_017268	GAA	2	6	648705	648710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422102
11518	NC_017268	AGG	2	6	648784	648789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422102
11519	NC_017268	AAAC	2	8	648798	648805	75 %	0 %	0 %	25 %	384422102
11520	NC_017268	GAA	2	6	648841	648846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422103
11521	NC_017268	A	6	6	648845	648850	100 %	0 %	0 %	0 %	384422103
11522	NC_017268	TC	3	6	648866	648871	0 %	50 %	0 %	50 %	384422103
11523	NC_017268	CA	3	6	648875	648880	50 %	0 %	0 %	50 %	384422103
11524	NC_017268	CGC	2	6	648900	648905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422103
11525	NC_017268	GC	4	8	648904	648911	0 %	0 %	50 %	50 %	384422103
11526	NC_017268	GGA	2	6	648967	648972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422103
11527	NC_017268	GCA	2	6	649070	649075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422103
11528	NC_017268	CGTA	2	8	649076	649083	25 %	25 %	25 %	25 %	384422103
11529	NC_017268	A	7	7	649149	649155	100 %	0 %	0 %	0 %	384422103
11530	NC_017268	AGT	2	6	649187	649192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422103
11531	NC_017268	GC	3	6	649237	649242	0 %	0 %	50 %	50 %	384422103
11532	NC_017268	GCG	2	6	649249	649254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422103
11533	NC_017268	TCG	2	6	649285	649290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422103
11534	NC_017268	GGGA	2	8	649298	649305	25 %	0 %	75 %	0 %	384422103
11535	NC_017268	C	6	6	649311	649316	0 %	0 %	0 %	100 %	384422103
11536	NC_017268	AAG	2	6	649317	649322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422103
11537	NC_017268	GCG	2	6	649332	649337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422103
11538	NC_017268	GCG	2	6	649344	649349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422103
11539	NC_017268	CAC	2	6	649500	649505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422103
11540	NC_017268	TCC	2	6	649564	649569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422103
11541	NC_017268	AC	4	8	649582	649589	50 %	0 %	0 %	50 %	384422103
11542	NC_017268	AAC	2	6	649696	649701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422103
11543	NC_017268	CGA	2	6	649787	649792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422103
11544	NC_017268	CACC	2	8	649811	649818	25 %	0 %	0 %	75 %	384422103
11545	NC_017268	AAC	2	6	652213	652218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422104
11546	NC_017268	CTCGCT	2	12	652232	652243	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384422104
11547	NC_017268	TGT	2	6	652288	652293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422104
11548	NC_017268	CG	3	6	652325	652330	0 %	0 %	50 %	50 %	384422104
11549	NC_017268	A	7	7	652356	652362	100 %	0 %	0 %	0 %	384422104
11550	NC_017268	CT	3	6	652370	652375	0 %	50 %	0 %	50 %	384422104
11551	NC_017268	A	6	6	652407	652412	100 %	0 %	0 %	0 %	384422104
11552	NC_017268	CAA	2	6	652424	652429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422104
11553	NC_017268	TTC	2	6	652624	652629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422104
11554	NC_017268	CA	3	6	652636	652641	50 %	0 %	0 %	50 %	384422104
11555	NC_017268	CAC	2	6	652673	652678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422104
11556	NC_017268	A	6	6	652699	652704	100 %	0 %	0 %	0 %	384422104
11557	NC_017268	CTG	2	6	652710	652715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422104
11558	NC_017268	CAA	2	6	652724	652729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422104
11559	NC_017268	TCA	2	6	652741	652746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422104
11560	NC_017268	TCAC	2	8	652808	652815	25 %	25 %	0 %	50 %	384422104
11561	NC_017268	A	6	6	652828	652833	100 %	0 %	0 %	0 %	384422105
11562	NC_017268	CGT	2	6	652838	652843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422105
11563	NC_017268	CAA	2	6	652871	652876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422105
11564	NC_017268	ACA	2	6	652904	652909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422105
11565	NC_017268	CTT	2	6	652924	652929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422105
11566	NC_017268	CCG	2	6	652966	652971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422105
11567	NC_017268	ATA	2	6	652999	653004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422105
11568	NC_017268	AG	4	8	653006	653013	50 %	0 %	50 %	0 %	384422105
11569	NC_017268	A	6	6	653059	653064	100 %	0 %	0 %	0 %	384422105
11570	NC_017268	CTG	2	6	653133	653138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422105
11571	NC_017268	AC	3	6	653185	653190	50 %	0 %	0 %	50 %	384422105
11572	NC_017268	A	7	7	653229	653235	100 %	0 %	0 %	0 %	384422105
11573	NC_017268	GCA	2	6	653345	653350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422105
11574	NC_017268	GACT	2	8	653361	653368	25 %	25 %	25 %	25 %	384422105
11575	NC_017268	T	6	6	653368	653373	0 %	100 %	0 %	0 %	384422105
11576	NC_017268	AGC	2	6	653386	653391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422105
11577	NC_017268	GCA	2	6	653473	653478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422105
11578	NC_017268	CCG	2	6	653492	653497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422105
11579	NC_017268	CAA	2	6	653498	653503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422105
11580	NC_017268	T	6	6	653642	653647	0 %	100 %	0 %	0 %	384422105
11581	NC_017268	TACA	2	8	653751	653758	50 %	25 %	0 %	25 %	384422105
11582	NC_017268	TG	3	6	653781	653786	0 %	50 %	50 %	0 %	384422105
11583	NC_017268	C	6	6	653982	653987	0 %	0 %	0 %	100 %	384422105
11584	NC_017268	TTTC	2	8	654027	654034	0 %	75 %	0 %	25 %	384422105
11585	NC_017268	GCG	2	6	654094	654099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422105
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11587	NC_017268	CAC	2	6	654141	654146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422105
11588	NC_017268	AAT	2	6	654153	654158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422105
11589	NC_017268	CT	4	8	654171	654178	0 %	50 %	0 %	50 %	384422106
11590	NC_017268	CA	3	6	654205	654210	50 %	0 %	0 %	50 %	384422106
11591	NC_017268	CTT	2	6	654238	654243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422106
11592	NC_017268	GC	3	6	654261	654266	0 %	0 %	50 %	50 %	384422106
11593	NC_017268	TCT	2	6	654270	654275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422106
11594	NC_017268	ACGC	2	8	654334	654341	25 %	0 %	25 %	50 %	384422106
11595	NC_017268	CCT	2	6	654346	654351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422106
11596	NC_017268	TGC	2	6	654356	654361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422106
11597	NC_017268	ACGC	2	8	654379	654386	25 %	0 %	25 %	50 %	384422106
11598	NC_017268	AGG	2	6	654497	654502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422106
11599	NC_017268	CAC	3	9	654620	654628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422106
11600	NC_017268	A	6	6	654653	654658	100 %	0 %	0 %	0 %	384422106
11601	NC_017268	TCT	2	6	654718	654723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422106
11602	NC_017268	ACC	2	6	654806	654811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422106
11603	NC_017268	GC	3	6	654844	654849	0 %	0 %	50 %	50 %	384422106
11604	NC_017268	AGC	2	6	654875	654880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422106
11605	NC_017268	TTG	2	6	654904	654909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422106
11606	NC_017268	GCA	2	6	654927	654932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422106
11607	NC_017268	CTTT	2	8	654960	654967	0 %	75 %	0 %	25 %	384422106
11608	NC_017268	AG	3	6	655008	655013	50 %	0 %	50 %	0 %	384422106
11609	NC_017268	CAG	2	6	655024	655029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422106
11610	NC_017268	ACC	3	9	655047	655055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422106
11611	NC_017268	GAA	2	6	655068	655073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422106
11612	NC_017268	TGCG	2	8	655087	655094	0 %	25 %	50 %	25 %	384422106
11613	NC_017268	CTT	2	6	655099	655104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422106
11614	NC_017268	CG	3	6	655150	655155	0 %	0 %	50 %	50 %	384422106
11615	NC_017268	CG	3	6	655164	655169	0 %	0 %	50 %	50 %	384422106
11616	NC_017268	CCA	2	6	655198	655203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422106
11617	NC_017268	TGC	2	6	655241	655246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422106
11618	NC_017268	CCGCC	2	10	655379	655388	0 %	0 %	20 %	80 %	384422107
11619	NC_017268	A	6	6	655396	655401	100 %	0 %	0 %	0 %	384422107
11620	NC_017268	TCA	2	6	655431	655436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422107
11621	NC_017268	CGACT	2	10	655438	655447	20 %	20 %	20 %	40 %	384422107
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11990	NC_017268	TCT	2	6	674311	674316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422125
11991	NC_017268	GCA	2	6	674397	674402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422125
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