MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017268	AC	3	6	620688	620693	50 %	0 %	0 %	50 %	384422079
11002	NC_017268	CAG	2	6	620699	620704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422079
11003	NC_017268	T	7	7	620804	620810	0 %	100 %	0 %	0 %	384422080
11004	NC_017268	ACG	2	6	620880	620885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422080
11005	NC_017268	ATT	2	6	620905	620910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422080
11006	NC_017268	GGCA	2	8	620934	620941	25 %	0 %	50 %	25 %	384422080
11007	NC_017268	CGC	2	6	620980	620985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422080
11008	NC_017268	CA	3	6	621034	621039	50 %	0 %	0 %	50 %	384422080
11009	NC_017268	CG	4	8	621063	621070	0 %	0 %	50 %	50 %	384422080
11010	NC_017268	TGC	2	6	621082	621087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422080
11011	NC_017268	GC	3	6	621107	621112	0 %	0 %	50 %	50 %	384422080
11012	NC_017268	CCAC	2	8	621116	621123	25 %	0 %	0 %	75 %	384422080
11013	NC_017268	A	7	7	621142	621148	100 %	0 %	0 %	0 %	384422080
11014	NC_017268	AC	3	6	621151	621156	50 %	0 %	0 %	50 %	384422080
11015	NC_017268	GGC	2	6	621202	621207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422080
11016	NC_017268	AGCG	2	8	621339	621346	25 %	0 %	50 %	25 %	384422080
11017	NC_017268	GT	3	6	621361	621366	0 %	50 %	50 %	0 %	384422080
11018	NC_017268	GCA	2	6	621398	621403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422080
11019	NC_017268	AGTCC	2	10	621413	621422	20 %	20 %	20 %	40 %	384422080
11020	NC_017268	AGC	2	6	621429	621434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422080
11021	NC_017268	TCC	3	9	621466	621474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422080
11022	NC_017268	GC	3	6	621497	621502	0 %	0 %	50 %	50 %	384422080
11023	NC_017268	GA	3	6	621568	621573	50 %	0 %	50 %	0 %	384422080
11024	NC_017268	GCA	2	6	621651	621656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422081
11025	NC_017268	CGGG	2	8	621683	621690	0 %	0 %	75 %	25 %	384422081
11026	NC_017268	GC	3	6	621846	621851	0 %	0 %	50 %	50 %	384422081
11027	NC_017268	CAA	2	6	621878	621883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422081
11028	NC_017268	AG	3	6	621947	621952	50 %	0 %	50 %	0 %	384422081
11029	NC_017268	CACC	2	8	621961	621968	25 %	0 %	0 %	75 %	384422081
11030	NC_017268	TCA	2	6	622128	622133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422081
11031	NC_017268	ACC	2	6	622176	622181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422081
11032	NC_017268	AC	3	6	622243	622248	50 %	0 %	0 %	50 %	384422081
11033	NC_017268	ACAA	2	8	622279	622286	75 %	0 %	0 %	25 %	384422081
11034	NC_017268	CCG	2	6	622297	622302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422081
11035	NC_017268	CGGTTG	2	12	622318	622329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384422082
11036	NC_017268	ATT	2	6	622355	622360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422082
11037	NC_017268	CTCA	2	8	622381	622388	25 %	25 %	0 %	50 %	384422082
11038	NC_017268	GCC	2	6	622424	622429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422082
11039	NC_017268	AGG	2	6	622449	622454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422082
11040	NC_017268	ATC	2	6	622462	622467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422082
11041	NC_017268	ACG	2	6	622481	622486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422082
11042	NC_017268	GC	3	6	622551	622556	0 %	0 %	50 %	50 %	384422082
11043	NC_017268	CCG	2	6	622698	622703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422082
11044	NC_017268	GCA	2	6	622755	622760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422082
11045	NC_017268	ACA	2	6	622788	622793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422082
11046	NC_017268	GAC	2	6	622801	622806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422082
11047	NC_017268	CGGT	2	8	622830	622837	0 %	25 %	50 %	25 %	384422082
11048	NC_017268	AGG	2	6	622838	622843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422082
11049	NC_017268	AAAGG	2	10	622846	622855	60 %	0 %	40 %	0 %	384422082
11050	NC_017268	TCA	2	6	622965	622970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422082
11051	NC_017268	CGC	2	6	623095	623100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422082
11052	NC_017268	CGCA	2	8	623116	623123	25 %	0 %	25 %	50 %	384422082
11053	NC_017268	GCT	2	6	623136	623141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422082
11054	NC_017268	TTC	2	6	623153	623158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422082
11055	NC_017268	CACG	2	8	623232	623239	25 %	0 %	25 %	50 %	384422082
11056	NC_017268	AC	3	6	623294	623299	50 %	0 %	0 %	50 %	384422082
11057	NC_017268	CAGA	2	8	623315	623322	50 %	0 %	25 %	25 %	384422082
11058	NC_017268	GC	3	6	623349	623354	0 %	0 %	50 %	50 %	384422082
11059	NC_017268	CGCA	2	8	623525	623532	25 %	0 %	25 %	50 %	384422083
11060	NC_017268	AACCT	2	10	623550	623559	40 %	20 %	0 %	40 %	384422083
11061	NC_017268	AG	3	6	623594	623599	50 %	0 %	50 %	0 %	384422083
11062	NC_017268	GCA	2	6	623670	623675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422083
11063	NC_017268	TCCGCG	2	12	623688	623699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384422083
11064	NC_017268	GAAG	2	8	623758	623765	50 %	0 %	50 %	0 %	384422083
11065	NC_017268	GTA	2	6	623816	623821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422083
11066	NC_017268	CCA	2	6	623897	623902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422083
11067	NC_017268	CAG	2	6	623908	623913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422083
11068	NC_017268	TCA	2	6	623958	623963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422083
11069	NC_017268	GTA	2	6	623966	623971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422083
11070	NC_017268	TCA	2	6	623995	624000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422083
11071	NC_017268	TGC	2	6	624139	624144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422083
11072	NC_017268	CG	3	6	624350	624355	0 %	0 %	50 %	50 %	384422083
11073	NC_017268	GCAC	2	8	624435	624442	25 %	0 %	25 %	50 %	384422083
11074	NC_017268	T	6	6	624480	624485	0 %	100 %	0 %	0 %	384422083
11075	NC_017268	CTG	2	6	624492	624497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422083
11076	NC_017268	GA	3	6	624516	624521	50 %	0 %	50 %	0 %	384422083
11077	NC_017268	CG	3	6	624629	624634	0 %	0 %	50 %	50 %	384422083
11078	NC_017268	AGT	2	6	624694	624699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422083
11079	NC_017268	ATG	2	6	624737	624742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422083
11080	NC_017268	CAAC	2	8	624760	624767	50 %	0 %	0 %	50 %	384422083
11081	NC_017268	AGT	2	6	624789	624794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422083
11082	NC_017268	TTTCAC	2	12	624800	624811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384422083
11083	NC_017268	CA	4	8	624882	624889	50 %	0 %	0 %	50 %	384422084
11084	NC_017268	TCCT	2	8	624896	624903	0 %	50 %	0 %	50 %	384422084
11085	NC_017268	GGA	2	6	624911	624916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422084
11086	NC_017268	ATT	2	6	624962	624967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422084
11087	NC_017268	CAG	2	6	624972	624977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422084
11088	NC_017268	CTAC	2	8	625016	625023	25 %	25 %	0 %	50 %	384422085
11089	NC_017268	C	6	6	625054	625059	0 %	0 %	0 %	100 %	384422085
11090	NC_017268	GC	4	8	625100	625107	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11091	NC_017268	GC	3	6	625135	625140	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11092	NC_017268	CT	3	6	625307	625312	0 %	50 %	0 %	50 %	384422085
11093	NC_017268	ACACC	2	10	625395	625404	40 %	0 %	0 %	60 %	384422085
11094	NC_017268	GCAC	2	8	625528	625535	25 %	0 %	25 %	50 %	384422085
11095	NC_017268	CAT	2	6	625603	625608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422085
11096	NC_017268	GC	4	8	625610	625617	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11097	NC_017268	GC	3	6	625717	625722	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11098	NC_017268	CTC	2	6	625724	625729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422085
11099	NC_017268	GC	4	8	625792	625799	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11100	NC_017268	AC	3	6	625837	625842	50 %	0 %	0 %	50 %	384422085
11101	NC_017268	GCC	2	6	625868	625873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422085
11102	NC_017268	TG	3	6	625874	625879	0 %	50 %	50 %	0 %	384422085
11103	NC_017268	GCT	2	6	625967	625972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11104	NC_017268	AGC	2	6	625981	625986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11105	NC_017268	CG	4	8	626070	626077	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11106	NC_017268	CGT	2	6	626101	626106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11107	NC_017268	GCT	2	6	626177	626182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11108	NC_017268	CA	3	6	626193	626198	50 %	0 %	0 %	50 %	384422085
11109	NC_017268	GAA	2	6	626363	626368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422085
11110	NC_017268	CGA	2	6	626404	626409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11111	NC_017268	CG	3	6	626417	626422	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
11112	NC_017268	GCA	2	6	626489	626494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11113	NC_017268	T	8	8	626515	626522	0 %	100 %	0 %	0 %	384422085
11114	NC_017268	ACGA	2	8	626531	626538	50 %	0 %	25 %	25 %	384422085
11115	NC_017268	CGC	2	6	626557	626562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422085
11116	NC_017268	CAG	2	6	626584	626589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422085
11117	NC_017268	CTC	2	6	626615	626620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422085
11118	NC_017268	GCG	2	6	626715	626720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422085
11119	NC_017268	TCT	2	6	626749	626754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422085
11120	NC_017268	CTT	2	6	626787	626792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422085
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11122	NC_017268	GAA	2	6	626906	626911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422085
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11368	NC_017268	TTG	2	6	639474	639479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422096
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11488	NC_017268	CGA	2	6	646961	646966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422101
11489	NC_017268	GGA	2	6	647042	647047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422101
11490	NC_017268	CTG	2	6	647068	647073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422101
11491	NC_017268	CTC	2	6	647112	647117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422101
11492	NC_017268	CGT	2	6	647204	647209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422101
11493	NC_017268	CAG	2	6	647218	647223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422101
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11495	NC_017268	CTG	2	6	647261	647266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422101
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