MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017268	CG	4	8	597180	597187	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
10503	NC_017268	GC	3	6	597196	597201	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
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10505	NC_017268	AC	3	6	597244	597249	50 %	0 %	0 %	50 %	384422061
10506	NC_017268	AGACAT	2	12	597262	597273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384422061
10507	NC_017268	ACTACC	2	12	597290	597301	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384422061
10508	NC_017268	GAAA	2	8	597320	597327	75 %	0 %	25 %	0 %	384422061
10509	NC_017268	TAA	2	6	597363	597368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422061
10510	NC_017268	A	6	6	597372	597377	100 %	0 %	0 %	0 %	384422061
10511	NC_017268	CA	3	6	597465	597470	50 %	0 %	0 %	50 %	384422061
10512	NC_017268	CG	3	6	597516	597521	0 %	0 %	50 %	50 %	384422061
10513	NC_017268	GAT	2	6	597581	597586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422061
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10516	NC_017268	ATATCG	2	12	597704	597715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384422061
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10519	NC_017268	CTG	2	6	597808	597813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422061
10520	NC_017268	TGC	3	9	597842	597850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422061
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10529	NC_017268	A	7	7	598167	598173	100 %	0 %	0 %	0 %	384422061
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10552	NC_017268	CGCC	2	8	598899	598906	0 %	0 %	25 %	75 %	384422062
10553	NC_017268	GC	3	6	598924	598929	0 %	0 %	50 %	50 %	384422062
10554	NC_017268	GAC	2	6	598955	598960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422062
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10556	NC_017268	ACAA	2	8	599060	599067	75 %	0 %	0 %	25 %	384422062
10557	NC_017268	CAC	2	6	599243	599248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422062
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10604	NC_017268	TGC	2	6	601338	601343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422064
10605	NC_017268	A	7	7	601377	601383	100 %	0 %	0 %	0 %	384422064
10606	NC_017268	TGC	2	6	601395	601400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422065
10607	NC_017268	TTA	2	6	601413	601418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422065
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10610	NC_017268	TGCT	2	8	601596	601603	0 %	50 %	25 %	25 %	384422065
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10622	NC_017268	CGCC	2	8	602055	602062	0 %	0 %	25 %	75 %	384422065
10623	NC_017268	CTTT	2	8	602078	602085	0 %	75 %	0 %	25 %	384422065
10624	NC_017268	GCA	2	6	602207	602212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422066
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10631	NC_017268	GCAG	2	8	602545	602552	25 %	0 %	50 %	25 %	384422066
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10990	NC_017268	CA	3	6	620050	620055	50 %	0 %	0 %	50 %	384422079
10991	NC_017268	ACA	2	6	620069	620074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422079
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