MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017268	AG	3	6	568969	568974	50 %	0 %	50 %	0 %	384422036
10002	NC_017268	CCA	2	6	569045	569050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422036
10003	NC_017268	CA	3	6	569069	569074	50 %	0 %	0 %	50 %	384422036
10004	NC_017268	CAAG	2	8	569166	569173	50 %	0 %	25 %	25 %	384422036
10005	NC_017268	GA	3	6	569174	569179	50 %	0 %	50 %	0 %	384422036
10006	NC_017268	GAAT	2	8	569202	569209	50 %	25 %	25 %	0 %	384422036
10007	NC_017268	CAC	2	6	569311	569316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422037
10008	NC_017268	T	6	6	569332	569337	0 %	100 %	0 %	0 %	384422037
10009	NC_017268	GC	3	6	569432	569437	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
10010	NC_017268	TTG	2	6	569456	569461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422038
10011	NC_017268	TTC	2	6	569507	569512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422038
10012	NC_017268	GGT	2	6	569533	569538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422038
10013	NC_017268	CT	3	6	569575	569580	0 %	50 %	0 %	50 %	384422038
10014	NC_017268	CA	3	6	569656	569661	50 %	0 %	0 %	50 %	384422038
10015	NC_017268	CTC	2	6	569728	569733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038
10016	NC_017268	CAT	3	9	569745	569753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422038
10017	NC_017268	ATTTT	2	10	569789	569798	20 %	80 %	0 %	0 %	384422038
10018	NC_017268	TCA	2	6	569906	569911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422038
10019	NC_017268	TCC	2	6	569952	569957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038
10020	NC_017268	GCC	2	6	569995	570000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422038
10021	NC_017268	CTTT	2	8	570141	570148	0 %	75 %	0 %	25 %	384422038
10022	NC_017268	AGA	2	6	570174	570179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10023	NC_017268	CG	3	6	570199	570204	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
10024	NC_017268	GTC	2	6	570223	570228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422038
10025	NC_017268	CATC	2	8	570251	570258	25 %	25 %	0 %	50 %	384422038
10026	NC_017268	GCG	2	6	570378	570383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
10027	NC_017268	GCAG	2	8	570391	570398	25 %	0 %	50 %	25 %	384422038
10028	NC_017268	CG	3	6	570431	570436	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
10029	NC_017268	AGC	2	6	570446	570451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422038
10030	NC_017268	GAA	2	6	570469	570474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10031	NC_017268	TCC	2	6	570558	570563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038
10032	NC_017268	TAT	2	6	570576	570581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422038
10033	NC_017268	AGA	2	6	570588	570593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10034	NC_017268	AGA	2	6	570618	570623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10035	NC_017268	ATG	2	6	570652	570657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422038
10036	NC_017268	GAT	2	6	570690	570695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422038
10037	NC_017268	GCG	2	6	570708	570713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
10038	NC_017268	GCG	2	6	570748	570753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
10039	NC_017268	TCTG	2	8	570756	570763	0 %	50 %	25 %	25 %	384422038
10040	NC_017268	GAA	2	6	570796	570801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10041	NC_017268	A	6	6	570800	570805	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
10042	NC_017268	A	6	6	570807	570812	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
10043	NC_017268	T	6	6	570855	570860	0 %	100 %	0 %	0 %	384422038
10044	NC_017268	CG	3	6	570871	570876	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
10045	NC_017268	AACA	2	8	570892	570899	75 %	0 %	0 %	25 %	384422038
10046	NC_017268	AGC	2	6	570962	570967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422038
10047	NC_017268	CGGG	2	8	571007	571014	0 %	0 %	75 %	25 %	384422038
10048	NC_017268	GAA	2	6	571021	571026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10049	NC_017268	GTGC	2	8	571065	571072	0 %	25 %	50 %	25 %	384422038
10050	NC_017268	TCGC	2	8	571092	571099	0 %	25 %	25 %	50 %	384422038
10051	NC_017268	TG	3	6	571135	571140	0 %	50 %	50 %	0 %	384422038
10052	NC_017268	GTAT	2	8	571193	571200	25 %	50 %	25 %	0 %	384422038
10053	NC_017268	A	7	7	571225	571231	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
10054	NC_017268	GCACG	2	10	571284	571293	20 %	0 %	40 %	40 %	384422038
10055	NC_017268	CG	3	6	571301	571306	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
10056	NC_017268	GAA	2	6	571317	571322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10057	NC_017268	AGA	2	6	571351	571356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
10058	NC_017268	GGT	2	6	571440	571445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422039
10059	NC_017268	GC	3	6	571458	571463	0 %	0 %	50 %	50 %	384422039
10060	NC_017268	CTC	2	6	571503	571508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
10061	NC_017268	TGCT	2	8	571558	571565	0 %	50 %	25 %	25 %	384422039
10062	NC_017268	TCC	2	6	571672	571677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
10063	NC_017268	GCA	2	6	571711	571716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422039
10064	NC_017268	CCT	2	6	571784	571789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
10065	NC_017268	GCA	2	6	571828	571833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422039
10066	NC_017268	ATC	2	6	571836	571841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422039
10067	NC_017268	AAG	2	6	571854	571859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422039
10068	NC_017268	AGA	2	6	571915	571920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422039
10069	NC_017268	AG	3	6	571934	571939	50 %	0 %	50 %	0 %	384422039
10070	NC_017268	CAAG	2	8	571976	571983	50 %	0 %	25 %	25 %	384422039
10071	NC_017268	TGG	2	6	572039	572044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422039
10072	NC_017268	CCT	2	6	572184	572189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422040
10073	NC_017268	TCAC	2	8	572210	572217	25 %	25 %	0 %	50 %	384422040
10074	NC_017268	CGATA	2	10	572262	572271	40 %	20 %	20 %	20 %	384422040
10075	NC_017268	CTGA	2	8	572323	572330	25 %	25 %	25 %	25 %	384422040
10076	NC_017268	GGTCA	2	10	572641	572650	20 %	20 %	40 %	20 %	384422040
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10079	NC_017268	CTGC	2	8	572729	572736	0 %	25 %	25 %	50 %	384422040
10080	NC_017268	GC	3	6	572735	572740	0 %	0 %	50 %	50 %	384422040
10081	NC_017268	GTG	2	6	572810	572815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422040
10082	NC_017268	AGT	2	6	572838	572843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422040
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10088	NC_017268	A	6	6	573016	573021	100 %	0 %	0 %	0 %	384422040
10089	NC_017268	ATACCC	2	12	573041	573052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384422040
10090	NC_017268	GCT	2	6	573113	573118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422040
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10092	NC_017268	TGAA	2	8	573212	573219	50 %	25 %	25 %	0 %	384422040
10093	NC_017268	CG	4	8	573234	573241	0 %	0 %	50 %	50 %	384422040
10094	NC_017268	GATAG	2	10	573250	573259	40 %	20 %	40 %	0 %	384422040
10095	NC_017268	AG	3	6	573283	573288	50 %	0 %	50 %	0 %	384422040
10096	NC_017268	AGGC	2	8	573389	573396	25 %	0 %	50 %	25 %	384422040
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10100	NC_017268	C	7	7	573611	573617	0 %	0 %	0 %	100 %	384422041
10101	NC_017268	TG	3	6	573619	573624	0 %	50 %	50 %	0 %	384422041
10102	NC_017268	CG	3	6	573625	573630	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
10103	NC_017268	GCA	2	6	573631	573636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
10104	NC_017268	CA	4	8	573635	573642	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
10105	NC_017268	CGTA	2	8	573710	573717	25 %	25 %	25 %	25 %	384422041
10106	NC_017268	TACG	2	8	573725	573732	25 %	25 %	25 %	25 %	384422041
10107	NC_017268	GCA	3	9	573785	573793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
10108	NC_017268	CTG	2	6	573885	573890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422041
10109	NC_017268	CA	3	6	573914	573919	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
10110	NC_017268	TCT	2	6	573937	573942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
10111	NC_017268	GCG	2	6	574018	574023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422041
10112	NC_017268	GC	3	6	574036	574041	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
10113	NC_017268	TACT	2	8	574048	574055	25 %	50 %	0 %	25 %	384422041
10114	NC_017268	CCA	2	6	574056	574061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422041
10115	NC_017268	ACTT	2	8	574065	574072	25 %	50 %	0 %	25 %	384422041
10116	NC_017268	CG	3	6	574123	574128	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
10117	NC_017268	TG	3	6	574176	574181	0 %	50 %	50 %	0 %	384422041
10118	NC_017268	ATG	2	6	574231	574236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
10119	NC_017268	CG	3	6	574250	574255	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
10120	NC_017268	CA	3	6	574257	574262	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
10121	NC_017268	GC	3	6	574279	574284	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
10122	NC_017268	CTC	2	6	574329	574334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422041
10123	NC_017268	TTC	2	6	574344	574349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
10124	NC_017268	ATG	2	6	574405	574410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
10125	NC_017268	GTA	2	6	574434	574439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
10126	NC_017268	AG	3	6	574531	574536	50 %	0 %	50 %	0 %	384422041
10127	NC_017268	AG	3	6	574572	574577	50 %	0 %	50 %	0 %	384422041
10128	NC_017268	ATA	2	6	574624	574629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422041
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10132	NC_017268	TCC	2	6	574707	574712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422041
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10136	NC_017268	ACG	2	6	574800	574805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
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10143	NC_017268	GC	3	6	575476	575481	0 %	0 %	50 %	50 %	384422042
10144	NC_017268	CGTCC	2	10	575513	575522	0 %	20 %	20 %	60 %	384422042
10145	NC_017268	CACTG	2	10	575545	575554	20 %	20 %	20 %	40 %	384422042
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10147	NC_017268	GA	3	6	575588	575593	50 %	0 %	50 %	0 %	384422042
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10152	NC_017268	AT	4	8	575993	576000	50 %	50 %	0 %	0 %	384422042
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10156	NC_017268	GC	3	6	576191	576196	0 %	0 %	50 %	50 %	384422043
10157	NC_017268	G	6	6	576235	576240	0 %	0 %	100 %	0 %	384422043
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10188	NC_017268	CA	3	6	579324	579329	50 %	0 %	0 %	50 %	384422044
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10226	NC_017268	TCTT	2	8	582222	582229	0 %	75 %	0 %	25 %	384422048
10227	NC_017268	GAT	2	6	582311	582316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422048
10228	NC_017268	CTG	2	6	582334	582339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422048
10229	NC_017268	CG	3	6	582346	582351	0 %	0 %	50 %	50 %	384422048
10230	NC_017268	GTC	2	6	582353	582358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422048
10231	NC_017268	ACCAT	2	10	582363	582372	40 %	20 %	0 %	40 %	384422048
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10233	NC_017268	CAT	2	6	582449	582454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422048
10234	NC_017268	A	7	7	582521	582527	100 %	0 %	0 %	0 %	384422049
10235	NC_017268	TCGG	2	8	582543	582550	0 %	25 %	50 %	25 %	384422049
10236	NC_017268	CCTG	2	8	582571	582578	0 %	25 %	25 %	50 %	384422049
10237	NC_017268	TTG	2	6	582622	582627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422049
10238	NC_017268	GTT	2	6	583035	583040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422050
10239	NC_017268	ATCT	2	8	583117	583124	25 %	50 %	0 %	25 %	384422050
10240	NC_017268	CTT	2	6	583155	583160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422050
10241	NC_017268	AAAG	2	8	583185	583192	75 %	0 %	25 %	0 %	384422050
10242	NC_017268	GCT	2	6	583209	583214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422050
10243	NC_017268	ATT	2	6	583217	583222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422050
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10491	NC_017268	GC	4	8	596704	596711	0 %	0 %	50 %	50 %	384422060
10492	NC_017268	A	6	6	596728	596733	100 %	0 %	0 %	0 %	384422060
10493	NC_017268	CA	3	6	596815	596820	50 %	0 %	0 %	50 %	384422061
10494	NC_017268	CAC	2	6	596911	596916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422061
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10497	NC_017268	CTC	2	6	597019	597024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422061
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10500	NC_017268	AC	4	8	597104	597111	50 %	0 %	0 %	50 %	384422061

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