MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017268	GTG	2	6	406090	406095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421902
7003	NC_017268	ACG	2	6	406147	406152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421902
7004	NC_017268	CG	3	6	406161	406166	0 %	0 %	50 %	50 %	384421902
7005	NC_017268	A	6	6	406187	406192	100 %	0 %	0 %	0 %	384421902
7006	NC_017268	T	6	6	406239	406244	0 %	100 %	0 %	0 %	384421902
7007	NC_017268	AGTGC	2	10	406361	406370	20 %	20 %	40 %	20 %	384421902
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7010	NC_017268	C	10	10	406441	406450	0 %	0 %	0 %	100 %	384421903
7011	NC_017268	CA	5	10	406452	406461	50 %	0 %	0 %	50 %	384421903
7012	NC_017268	GGA	2	6	406463	406468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421903
7013	NC_017268	TCT	2	6	406569	406574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421904
7014	NC_017268	TAAC	2	8	406591	406598	50 %	25 %	0 %	25 %	384421904
7015	NC_017268	CCT	3	9	406654	406662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421904
7016	NC_017268	CGC	2	6	406796	406801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421904
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7018	NC_017268	CTG	2	6	406859	406864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
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7021	NC_017268	ACC	2	6	406923	406928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421904
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7024	NC_017268	TCT	2	6	407133	407138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421904
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7030	NC_017268	CA	3	6	407401	407406	50 %	0 %	0 %	50 %	384421904
7031	NC_017268	TG	3	6	407547	407552	0 %	50 %	50 %	0 %	384421904
7032	NC_017268	CGA	2	6	407560	407565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421904
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7037	NC_017268	TCA	2	6	407718	407723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421904
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7041	NC_017268	CGT	2	6	407993	407998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
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7044	NC_017268	TGC	2	6	408224	408229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
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7048	NC_017268	TTGGC	2	10	408477	408486	0 %	40 %	40 %	20 %	384421905
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7058	NC_017268	A	7	7	408988	408994	100 %	0 %	0 %	0 %	384421905
7059	NC_017268	CG	4	8	409008	409015	0 %	0 %	50 %	50 %	384421905
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7089	NC_017268	T	6	6	410325	410330	0 %	100 %	0 %	0 %	384421908
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7095	NC_017268	GC	3	6	410516	410521	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
7096	NC_017268	GC	4	8	410548	410555	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
7097	NC_017268	GC	3	6	410572	410577	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
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7495	NC_017268	TCGA	2	8	429753	429760	25 %	25 %	25 %	25 %	384421927
7496	NC_017268	T	6	6	429815	429820	0 %	100 %	0 %	0 %	384421927
7497	NC_017268	CTG	2	6	429821	429826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421927
7498	NC_017268	GCT	2	6	429882	429887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421927
7499	NC_017268	CTTT	2	8	429904	429911	0 %	75 %	0 %	25 %	384421927
7500	NC_017268	ACGCGC	2	12	429938	429949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384421927

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