MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_017268	GGCA	2	8	377735	377742	25 %	0 %	50 %	25 %	384421874
6503	NC_017268	CTTTTG	2	12	377746	377757	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384421874
6504	NC_017268	CA	4	8	377798	377805	50 %	0 %	0 %	50 %	384421874
6505	NC_017268	GCA	2	6	377811	377816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421874
6506	NC_017268	GACG	2	8	377829	377836	25 %	0 %	50 %	25 %	384421874
6507	NC_017268	TTC	2	6	377868	377873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421874
6508	NC_017268	TGC	2	6	377913	377918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421874
6509	NC_017268	GATCC	2	10	377974	377983	20 %	20 %	20 %	40 %	384421874
6510	NC_017268	AG	3	6	378035	378040	50 %	0 %	50 %	0 %	384421874
6511	NC_017268	AGGA	2	8	378178	378185	50 %	0 %	50 %	0 %	384421875
6512	NC_017268	GTG	2	6	378189	378194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421875
6513	NC_017268	ACG	2	6	378196	378201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421875
6514	NC_017268	GGCC	2	8	378291	378298	0 %	0 %	50 %	50 %	384421875
6515	NC_017268	CG	3	6	378315	378320	0 %	0 %	50 %	50 %	384421875
6516	NC_017268	GCGCG	2	10	378450	378459	0 %	0 %	60 %	40 %	384421876
6517	NC_017268	GTT	2	6	378592	378597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421876
6518	NC_017268	CGTA	2	8	378657	378664	25 %	25 %	25 %	25 %	384421876
6519	NC_017268	ACC	2	6	378684	378689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421876
6520	NC_017268	TGA	2	6	378727	378732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421876
6521	NC_017268	TTGT	2	8	378753	378760	0 %	75 %	25 %	0 %	384421876
6522	NC_017268	CCCG	2	8	378863	378870	0 %	0 %	25 %	75 %	384421876
6523	NC_017268	GC	3	6	379030	379035	0 %	0 %	50 %	50 %	384421877
6524	NC_017268	GAC	2	6	379065	379070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421877
6525	NC_017268	GGTTT	2	10	379071	379080	0 %	60 %	40 %	0 %	384421877
6526	NC_017268	TGC	2	6	379150	379155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421877
6527	NC_017268	TGT	2	6	379214	379219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421878
6528	NC_017268	TGCG	2	8	379258	379265	0 %	25 %	50 %	25 %	384421878
6529	NC_017268	TGC	2	6	379351	379356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421878
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6531	NC_017268	T	6	6	379489	379494	0 %	100 %	0 %	0 %	384421878
6532	NC_017268	TAAA	2	8	379546	379553	75 %	25 %	0 %	0 %	384421878
6533	NC_017268	GC	3	6	379674	379679	0 %	0 %	50 %	50 %	384421878
6534	NC_017268	CG	4	8	379748	379755	0 %	0 %	50 %	50 %	384421878
6535	NC_017268	TTC	2	6	379783	379788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421878
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6537	NC_017268	TGC	2	6	379913	379918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421879
6538	NC_017268	GCA	2	6	379925	379930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421879
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6540	NC_017268	GTC	2	6	379968	379973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421879
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6543	NC_017268	TTG	2	6	380565	380570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421880
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6545	NC_017268	GGA	2	6	380659	380664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421880
6546	NC_017268	TG	3	6	380793	380798	0 %	50 %	50 %	0 %	384421881
6547	NC_017268	GT	3	6	380806	380811	0 %	50 %	50 %	0 %	384421881
6548	NC_017268	GAG	2	6	380908	380913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421881
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6551	NC_017268	GT	3	6	381095	381100	0 %	50 %	50 %	0 %	384421881
6552	NC_017268	ACG	2	6	381125	381130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421881
6553	NC_017268	GC	3	6	381174	381179	0 %	0 %	50 %	50 %	384421881
6554	NC_017268	CCT	2	6	381210	381215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421881
6555	NC_017268	CT	3	6	381252	381257	0 %	50 %	0 %	50 %	384421881
6556	NC_017268	TCCT	2	8	381302	381309	0 %	50 %	0 %	50 %	384421881
6557	NC_017268	GCC	2	6	381345	381350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421881
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6559	NC_017268	GC	3	6	381467	381472	0 %	0 %	50 %	50 %	384421881
6560	NC_017268	ATAG	2	8	381478	381485	50 %	25 %	25 %	0 %	384421881
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6563	NC_017268	GCG	2	6	381690	381695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421882
6564	NC_017268	TGC	2	6	381764	381769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421882
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6566	NC_017268	TAA	2	6	381883	381888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421882
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6578	NC_017268	TAAT	2	8	382590	382597	50 %	50 %	0 %	0 %	384421882
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6589	NC_017268	CGCTG	2	10	383247	383256	0 %	20 %	40 %	40 %	384421883
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6591	NC_017268	TCG	2	6	383333	383338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421883
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6593	NC_017268	GCCA	2	8	383412	383419	25 %	0 %	25 %	50 %	384421883
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6603	NC_017268	GGT	2	6	384195	384200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421885
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6607	NC_017268	GCG	2	6	384433	384438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421885
6608	NC_017268	GTG	2	6	384516	384521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421885
6609	NC_017268	CTGA	2	8	384557	384564	25 %	25 %	25 %	25 %	384421885
6610	NC_017268	TGG	2	6	384602	384607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421885
6611	NC_017268	GC	3	6	384624	384629	0 %	0 %	50 %	50 %	384421885
6612	NC_017268	TGA	2	6	384715	384720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421885
6613	NC_017268	ACG	2	6	384928	384933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421885
6614	NC_017268	GA	3	6	384937	384942	50 %	0 %	50 %	0 %	384421885
6615	NC_017268	GC	3	6	385018	385023	0 %	0 %	50 %	50 %	384421886
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6620	NC_017268	CAC	2	6	385140	385145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421887
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6995	NC_017268	TGT	2	6	405807	405812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421902
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