MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016848	AGT	2	6	206444	206449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981670
4002	NC_016848	GCGGT	2	10	206650	206659	0 %	20 %	60 %	20 %	378981670
4003	NC_016848	TGA	2	6	206784	206789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981671
4004	NC_016848	TTA	2	6	206826	206831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981671
4005	NC_016848	TGAGT	2	10	206844	206853	20 %	40 %	40 %	0 %	378981671
4006	NC_016848	CGC	2	6	206947	206952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981671
4007	NC_016848	AAG	2	6	206959	206964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981671
4008	NC_016848	TGG	2	6	206975	206980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981671
4009	NC_016848	G	6	6	206979	206984	0 %	0 %	100 %	0 %	378981671
4010	NC_016848	GAA	2	6	207033	207038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981671
4011	NC_016848	TC	3	6	207061	207066	0 %	50 %	0 %	50 %	378981671
4012	NC_016848	ATG	3	9	207200	207208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981671
4013	NC_016848	GTT	2	6	207210	207215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981671
4014	NC_016848	T	6	6	207249	207254	0 %	100 %	0 %	0 %	378981671
4015	NC_016848	GC	4	8	207270	207277	0 %	0 %	50 %	50 %	378981671
4016	NC_016848	TGC	2	6	207357	207362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981671
4017	NC_016848	AATG	2	8	207532	207539	50 %	25 %	25 %	0 %	378981672
4018	NC_016848	GAA	2	6	207547	207552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981672
4019	NC_016848	GAA	2	6	207592	207597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981672
4020	NC_016848	GCA	2	6	207614	207619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981672
4021	NC_016848	CGG	2	6	207736	207741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981673
4022	NC_016848	CG	3	6	207782	207787	0 %	0 %	50 %	50 %	378981673
4023	NC_016848	TA	3	6	208014	208019	50 %	50 %	0 %	0 %	378981673
4024	NC_016848	CAG	2	6	208047	208052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981673
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4027	NC_016848	CG	3	6	208169	208174	0 %	0 %	50 %	50 %	378981673
4028	NC_016848	GGT	3	9	208404	208412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981673
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4033	NC_016848	TGG	2	6	208680	208685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981674
4034	NC_016848	GGA	2	6	208738	208743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981674
4035	NC_016848	GT	3	6	208782	208787	0 %	50 %	50 %	0 %	378981674
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4037	NC_016848	TGA	2	6	208835	208840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981675
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4039	NC_016848	TGA	2	6	209043	209048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981675
4040	NC_016848	CGTG	2	8	209061	209068	0 %	25 %	50 %	25 %	378981675
4041	NC_016848	AGAT	2	8	209075	209082	50 %	25 %	25 %	0 %	378981675
4042	NC_016848	TGT	2	6	209163	209168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981675
4043	NC_016848	TCT	2	6	209249	209254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981676
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4045	NC_016848	TGC	2	6	209289	209294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981676
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4052	NC_016848	GAT	2	6	209815	209820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981676
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4056	NC_016848	GA	3	6	209927	209932	50 %	0 %	50 %	0 %	378981676
4057	NC_016848	GT	3	6	210047	210052	0 %	50 %	50 %	0 %	378981677
4058	NC_016848	AAG	2	6	210170	210175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981677
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4060	NC_016848	GTA	2	6	210230	210235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981677
4061	NC_016848	CTGTT	2	10	210246	210255	0 %	60 %	20 %	20 %	378981677
4062	NC_016848	GGGT	2	8	210384	210391	0 %	25 %	75 %	0 %	378981678
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4070	NC_016848	T	6	6	210540	210545	0 %	100 %	0 %	0 %	378981678
4071	NC_016848	AG	3	6	210575	210580	50 %	0 %	50 %	0 %	378981678
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4086	NC_016848	AAG	2	6	211484	211489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981681
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4088	NC_016848	CTGAA	2	10	211586	211595	40 %	20 %	20 %	20 %	378981682
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4092	NC_016848	GC	3	6	211789	211794	0 %	0 %	50 %	50 %	378981682
4093	NC_016848	GTA	2	6	211859	211864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981682
4094	NC_016848	TCA	2	6	211889	211894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981682
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4096	NC_016848	CAGA	2	8	212062	212069	50 %	0 %	25 %	25 %	378981682
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4100	NC_016848	TACGC	2	10	212178	212187	20 %	20 %	20 %	40 %	378981683
4101	NC_016848	GT	3	6	212208	212213	0 %	50 %	50 %	0 %	378981683
4102	NC_016848	GAG	2	6	212234	212239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981683
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4104	NC_016848	GCGA	2	8	212274	212281	25 %	0 %	50 %	25 %	378981683
4105	NC_016848	CTT	2	6	212416	212421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981684
4106	NC_016848	AT	3	6	212465	212470	50 %	50 %	0 %	0 %	378981684
4107	NC_016848	AGG	2	6	212491	212496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981684
4108	NC_016848	GT	3	6	212515	212520	0 %	50 %	50 %	0 %	378981684
4109	NC_016848	GCC	2	6	212584	212589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981684
4110	NC_016848	GT	3	6	212590	212595	0 %	50 %	50 %	0 %	378981684
4111	NC_016848	TCG	2	6	212615	212620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981684
4112	NC_016848	CT	3	6	212657	212662	0 %	50 %	0 %	50 %	378981684
4113	NC_016848	GGCA	2	8	212676	212683	25 %	0 %	50 %	25 %	378981684
4114	NC_016848	AGC	2	6	212692	212697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981684
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4118	NC_016848	TTG	2	6	212893	212898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981685
4119	NC_016848	TGA	2	6	212906	212911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981685
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4121	NC_016848	GTAA	2	8	213147	213154	50 %	25 %	25 %	0 %	378981685
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4123	NC_016848	CGG	2	6	213366	213371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981686
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4243	NC_016848	GAC	2	6	220131	220136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981698
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4245	NC_016848	GAA	2	6	220205	220210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981698
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4493	NC_016848	AGC	2	6	238052	238057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981711
4494	NC_016848	GTAT	2	8	238060	238067	25 %	50 %	25 %	0 %	378981711
4495	NC_016848	AGG	2	6	238071	238076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981711
4496	NC_016848	TCC	2	6	238079	238084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981711
4497	NC_016848	CCT	2	6	238119	238124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981711
4498	NC_016848	A	6	6	238126	238131	100 %	0 %	0 %	0 %	378981711
4499	NC_016848	CAA	2	6	238196	238201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981711
4500	NC_016848	CAA	2	6	238303	238308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981711

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