MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016848	GTT	2	6	181579	181584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981645
3503	NC_016848	T	6	6	181593	181598	0 %	100 %	0 %	0 %	378981645
3504	NC_016848	GCA	2	6	181627	181632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981645
3505	NC_016848	GC	4	8	181657	181664	0 %	0 %	50 %	50 %	378981645
3506	NC_016848	GAAA	2	8	181704	181711	75 %	0 %	25 %	0 %	378981645
3507	NC_016848	CGTG	2	8	181778	181785	0 %	25 %	50 %	25 %	378981645
3508	NC_016848	AAG	2	6	181854	181859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981645
3509	NC_016848	GCT	3	9	181915	181923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981645
3510	NC_016848	AAG	2	6	181960	181965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981645
3511	NC_016848	TG	3	6	181995	182000	0 %	50 %	50 %	0 %	378981645
3512	NC_016848	CAA	2	6	182029	182034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981645
3513	NC_016848	GT	4	8	182037	182044	0 %	50 %	50 %	0 %	378981645
3514	NC_016848	GGTGA	2	10	182130	182139	20 %	20 %	60 %	0 %	378981645
3515	NC_016848	CAG	2	6	182225	182230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981645
3516	NC_016848	GT	3	6	182241	182246	0 %	50 %	50 %	0 %	378981645
3517	NC_016848	CGT	2	6	182248	182253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981645
3518	NC_016848	AC	3	6	182372	182377	50 %	0 %	0 %	50 %	378981645
3519	NC_016848	GTT	2	6	182537	182542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981646
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3521	NC_016848	A	7	7	182583	182589	100 %	0 %	0 %	0 %	378981646
3522	NC_016848	CAC	2	6	182600	182605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981646
3523	NC_016848	CG	3	6	182624	182629	0 %	0 %	50 %	50 %	378981646
3524	NC_016848	ATC	2	6	182715	182720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981646
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3532	NC_016848	GC	3	6	183067	183072	0 %	0 %	50 %	50 %	378981646
3533	NC_016848	A	7	7	183206	183212	100 %	0 %	0 %	0 %	378981646
3534	NC_016848	CAG	2	6	183242	183247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981646
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3544	NC_016848	GC	3	6	183858	183863	0 %	0 %	50 %	50 %	378981646
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3546	NC_016848	CG	5	10	183914	183923	0 %	0 %	50 %	50 %	378981646
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3554	NC_016848	GC	3	6	184288	184293	0 %	0 %	50 %	50 %	378981646
3555	NC_016848	AGC	2	6	184297	184302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981646
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3562	NC_016848	G	6	6	184583	184588	0 %	0 %	100 %	0 %	378981647
3563	NC_016848	GTA	2	6	184626	184631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981647
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3581	NC_016848	TGAA	2	8	185392	185399	50 %	25 %	25 %	0 %	378981647
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3593	NC_016848	AC	3	6	186592	186597	50 %	0 %	0 %	50 %	378981648
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3597	NC_016848	ACG	2	6	186699	186704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981649
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3603	NC_016848	TCT	2	6	186954	186959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981650
3604	NC_016848	GCG	3	9	187011	187019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981650
3605	NC_016848	CGCAG	2	10	187034	187043	20 %	0 %	40 %	40 %	378981650
3606	NC_016848	CTA	2	6	187064	187069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981650
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3608	NC_016848	CAG	3	9	187222	187230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981650
3609	NC_016848	CG	3	6	187242	187247	0 %	0 %	50 %	50 %	378981650
3610	NC_016848	TTG	2	6	187370	187375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981650
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3623	NC_016848	GGC	2	6	187918	187923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981651
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3995	NC_016848	GTG	2	6	206187	206192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981670
3996	NC_016848	GAA	2	6	206255	206260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981670
3997	NC_016848	CCG	2	6	206307	206312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981670
3998	NC_016848	TG	4	8	206408	206415	0 %	50 %	50 %	0 %	378981670
3999	NC_016848	CT	3	6	206416	206421	0 %	50 %	0 %	50 %	378981670
4000	NC_016848	AAAAGG	2	12	206423	206434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981670

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