MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_016848	T	7	7	1137043	1137049	0 %	100 %	0 %	0 %	378982538
22502	NC_016848	TTCT	2	8	1137072	1137079	0 %	75 %	0 %	25 %	378982538
22503	NC_016848	CGTG	2	8	1137295	1137302	0 %	25 %	50 %	25 %	378982539
22504	NC_016848	GGAC	2	8	1137328	1137335	25 %	0 %	50 %	25 %	378982539
22505	NC_016848	GATT	2	8	1137367	1137374	25 %	50 %	25 %	0 %	378982539
22506	NC_016848	A	6	6	1137380	1137385	100 %	0 %	0 %	0 %	378982539
22507	NC_016848	CTA	2	6	1137394	1137399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982539
22508	NC_016848	TGA	2	6	1137417	1137422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982539
22509	NC_016848	TGG	2	6	1137456	1137461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982539
22510	NC_016848	GCA	2	6	1137494	1137499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982539
22511	NC_016848	GAC	2	6	1137689	1137694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982539
22512	NC_016848	GC	3	6	1137725	1137730	0 %	0 %	50 %	50 %	378982539
22513	NC_016848	GTG	2	6	1137758	1137763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982539
22514	NC_016848	CTT	2	6	1137766	1137771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982539
22515	NC_016848	AGC	2	6	1137934	1137939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982540
22516	NC_016848	TGC	2	6	1137963	1137968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982540
22517	NC_016848	TGCG	2	8	1137986	1137993	0 %	25 %	50 %	25 %	378982540
22518	NC_016848	TTC	2	6	1138059	1138064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982540
22519	NC_016848	GCT	2	6	1138097	1138102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982540
22520	NC_016848	ACC	2	6	1138159	1138164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982540
22521	NC_016848	GT	3	6	1138219	1138224	0 %	50 %	50 %	0 %	378982540
22522	NC_016848	CAGG	2	8	1138233	1138240	25 %	0 %	50 %	25 %	378982540
22523	NC_016848	ACG	2	6	1138267	1138272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982540
22524	NC_016848	CAA	2	6	1138304	1138309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982540
22525	NC_016848	ACT	2	6	1138425	1138430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982540
22526	NC_016848	TGC	2	6	1138574	1138579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982540
22527	NC_016848	GTA	2	6	1138617	1138622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982540
22528	NC_016848	GTG	2	6	1138875	1138880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982540
22529	NC_016848	A	6	6	1138888	1138893	100 %	0 %	0 %	0 %	378982540
22530	NC_016848	GC	3	6	1138916	1138921	0 %	0 %	50 %	50 %	378982540
22531	NC_016848	ATT	2	6	1138945	1138950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982540
22532	NC_016848	T	6	6	1138969	1138974	0 %	100 %	0 %	0 %	378982541
22533	NC_016848	AGT	2	6	1139026	1139031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982541
22534	NC_016848	CGTG	2	8	1139124	1139131	0 %	25 %	50 %	25 %	378982541
22535	NC_016848	TGTC	2	8	1139140	1139147	0 %	50 %	25 %	25 %	378982541
22536	NC_016848	T	6	6	1139220	1139225	0 %	100 %	0 %	0 %	378982541
22537	NC_016848	CAAC	2	8	1139257	1139264	50 %	0 %	0 %	50 %	378982541
22538	NC_016848	C	7	7	1139338	1139344	0 %	0 %	0 %	100 %	378982541
22539	NC_016848	A	7	7	1139484	1139490	100 %	0 %	0 %	0 %	378982541

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