MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_016848	CGTAT	2	10	1110643	1110652	20 %	40 %	20 %	20 %	378982516
22003	NC_016848	ATC	2	6	1110710	1110715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982516
22004	NC_016848	CAC	2	6	1110841	1110846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982516
22005	NC_016848	GC	3	6	1110847	1110852	0 %	0 %	50 %	50 %	378982516
22006	NC_016848	GAGG	2	8	1110853	1110860	25 %	0 %	75 %	0 %	378982516
22007	NC_016848	CTTC	2	8	1110886	1110893	0 %	50 %	0 %	50 %	378982516
22008	NC_016848	CGT	2	6	1111026	1111031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982516
22009	NC_016848	CA	3	6	1111168	1111173	50 %	0 %	0 %	50 %	378982516
22010	NC_016848	GAC	2	6	1111272	1111277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982516
22011	NC_016848	AGG	2	6	1111291	1111296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982516
22012	NC_016848	CCA	2	6	1111360	1111365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982516
22013	NC_016848	A	6	6	1111382	1111387	100 %	0 %	0 %	0 %	378982516
22014	NC_016848	GC	3	6	1111399	1111404	0 %	0 %	50 %	50 %	378982516
22015	NC_016848	TCA	2	6	1111439	1111444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982516
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22017	NC_016848	ATGC	2	8	1111717	1111724	25 %	25 %	25 %	25 %	378982516
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22042	NC_016848	TAC	2	6	1112565	1112570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982518
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22057	NC_016848	ATGA	2	8	1113157	1113164	50 %	25 %	25 %	0 %	378982518
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22104	NC_016848	ATT	2	6	1115606	1115611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982521
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22119	NC_016848	CACT	2	8	1116407	1116414	25 %	25 %	0 %	50 %	378982521
22120	NC_016848	ACCTG	2	10	1116448	1116457	20 %	20 %	20 %	40 %	378982521
22121	NC_016848	TC	3	6	1116484	1116489	0 %	50 %	0 %	50 %	378982521
22122	NC_016848	GCG	2	6	1116517	1116522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982521
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22124	NC_016848	GTA	2	6	1116674	1116679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982521
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22150	NC_016848	A	6	6	1117986	1117991	100 %	0 %	0 %	0 %	378982522
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22476	NC_016848	ACA	2	6	1135414	1135419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982536
22477	NC_016848	AGC	2	6	1135436	1135441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982536
22478	NC_016848	CTT	2	6	1135457	1135462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982536
22479	NC_016848	GCA	3	9	1135488	1135496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982536
22480	NC_016848	TCA	2	6	1135560	1135565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982536
22481	NC_016848	A	8	8	1135681	1135688	100 %	0 %	0 %	0 %	378982537
22482	NC_016848	CCG	2	6	1135701	1135706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982537
22483	NC_016848	CAAC	2	8	1135767	1135774	50 %	0 %	0 %	50 %	378982537
22484	NC_016848	CCT	2	6	1135788	1135793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982537
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22486	NC_016848	GA	3	6	1135886	1135891	50 %	0 %	50 %	0 %	378982537
22487	NC_016848	ACA	2	6	1136042	1136047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982537
22488	NC_016848	TGAG	2	8	1136125	1136132	25 %	25 %	50 %	0 %	378982537
22489	NC_016848	CAA	2	6	1136152	1136157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982537
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22494	NC_016848	GTCA	2	8	1136608	1136615	25 %	25 %	25 %	25 %	378982538
22495	NC_016848	CG	3	6	1136691	1136696	0 %	0 %	50 %	50 %	378982538
22496	NC_016848	TCT	2	6	1136732	1136737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982538
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22498	NC_016848	AAC	2	6	1136798	1136803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982538
22499	NC_016848	ATA	2	6	1136842	1136847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982538
22500	NC_016848	AGC	2	6	1136968	1136973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982538

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