MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016848	CAA	2	6	80552	80557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981549
1503	NC_016848	CA	3	6	80570	80575	50 %	0 %	0 %	50 %	378981549
1504	NC_016848	ACA	2	6	80608	80613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981549
1505	NC_016848	CG	3	6	80614	80619	0 %	0 %	50 %	50 %	378981549
1506	NC_016848	TTG	2	6	80677	80682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981550
1507	NC_016848	GTT	2	6	80952	80957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981551
1508	NC_016848	GTG	2	6	80963	80968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981551
1509	NC_016848	TGC	2	6	80983	80988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981551
1510	NC_016848	TGT	2	6	80993	80998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981551
1511	NC_016848	CGTGT	2	10	81005	81014	0 %	40 %	40 %	20 %	378981551
1512	NC_016848	CTT	2	6	81023	81028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981551
1513	NC_016848	GGC	2	6	81089	81094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981551
1514	NC_016848	GT	3	6	81118	81123	0 %	50 %	50 %	0 %	378981551
1515	NC_016848	CTT	2	6	81137	81142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981551
1516	NC_016848	GC	3	6	81220	81225	0 %	0 %	50 %	50 %	378981551
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1518	NC_016848	CG	3	6	81317	81322	0 %	0 %	50 %	50 %	378981551
1519	NC_016848	T	6	6	81346	81351	0 %	100 %	0 %	0 %	378981551
1520	NC_016848	ATG	2	6	81560	81565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981551
1521	NC_016848	CG	3	6	81598	81603	0 %	0 %	50 %	50 %	378981551
1522	NC_016848	CAG	2	6	81640	81645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981551
1523	NC_016848	TAC	2	6	81662	81667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981551
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1526	NC_016848	GGC	2	6	81964	81969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981551
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1528	NC_016848	TGC	2	6	81996	82001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981551
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1530	NC_016848	GTG	2	6	82060	82065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981551
1531	NC_016848	G	6	6	82199	82204	0 %	0 %	100 %	0 %	378981551
1532	NC_016848	GTGA	2	8	82252	82259	25 %	25 %	50 %	0 %	378981551
1533	NC_016848	TGC	2	6	82286	82291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981551
1534	NC_016848	CGT	2	6	82297	82302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981551
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1536	NC_016848	CGCA	2	8	82319	82326	25 %	0 %	25 %	50 %	378981551
1537	NC_016848	T	7	7	82579	82585	0 %	100 %	0 %	0 %	378981552
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1542	NC_016848	GTG	3	9	82823	82831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981552
1543	NC_016848	TG	3	6	82963	82968	0 %	50 %	50 %	0 %	378981552
1544	NC_016848	TTGC	2	8	82997	83004	0 %	50 %	25 %	25 %	378981552
1545	NC_016848	GCG	2	6	83039	83044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981552
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1549	NC_016848	T	7	7	83400	83406	0 %	100 %	0 %	0 %	378981553
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1551	NC_016848	CTT	2	6	83490	83495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981553
1552	NC_016848	GCC	2	6	83524	83529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981553
1553	NC_016848	T	6	6	83537	83542	0 %	100 %	0 %	0 %	378981553
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1558	NC_016848	GCA	2	6	83660	83665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981553
1559	NC_016848	ATGCA	2	10	83670	83679	40 %	20 %	20 %	20 %	378981553
1560	NC_016848	GTT	2	6	83719	83724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981553
1561	NC_016848	CCG	2	6	83741	83746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981553
1562	NC_016848	TG	3	6	83770	83775	0 %	50 %	50 %	0 %	378981553
1563	NC_016848	TG	3	6	83851	83856	0 %	50 %	50 %	0 %	378981553
1564	NC_016848	TTG	2	6	83871	83876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981553
1565	NC_016848	TGGA	2	8	83913	83920	25 %	25 %	50 %	0 %	378981553
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1576	NC_016848	GGGT	2	8	84326	84333	0 %	25 %	75 %	0 %	378981554
1577	NC_016848	GA	4	8	84369	84376	50 %	0 %	50 %	0 %	378981554
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1585	NC_016848	GA	3	6	84908	84913	50 %	0 %	50 %	0 %	378981554
1586	NC_016848	A	7	7	84934	84940	100 %	0 %	0 %	0 %	378981554
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1591	NC_016848	AAT	2	6	85123	85128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981554
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1594	NC_016848	TGC	2	6	85269	85274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981554
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1596	NC_016848	G	6	6	85387	85392	0 %	0 %	100 %	0 %	378981554
1597	NC_016848	GGAGTA	2	12	85474	85485	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378981554
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1599	NC_016848	GCA	2	6	85542	85547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981554
1600	NC_016848	CAGA	2	8	85574	85581	50 %	0 %	25 %	25 %	378981554
1601	NC_016848	CGTGAA	2	12	85693	85704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378981554
1602	NC_016848	AAG	2	6	85793	85798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981554
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1604	NC_016848	TGA	2	6	85912	85917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981555
1605	NC_016848	GCA	2	6	85924	85929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981555
1606	NC_016848	CAA	2	6	85939	85944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981555
1607	NC_016848	T	6	6	85955	85960	0 %	100 %	0 %	0 %	378981555
1608	NC_016848	GC	3	6	85987	85992	0 %	0 %	50 %	50 %	378981555
1609	NC_016848	GGAT	2	8	86015	86022	25 %	25 %	50 %	0 %	378981555
1610	NC_016848	ACG	2	6	86024	86029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981555
1611	NC_016848	GGT	2	6	86224	86229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981555
1612	NC_016848	GT	3	6	86272	86277	0 %	50 %	50 %	0 %	378981555
1613	NC_016848	A	6	6	86290	86295	100 %	0 %	0 %	0 %	378981555
1614	NC_016848	GC	3	6	86300	86305	0 %	0 %	50 %	50 %	378981555
1615	NC_016848	CCAT	2	8	86322	86329	25 %	25 %	0 %	50 %	378981555
1616	NC_016848	GTG	2	6	86393	86398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981555
1617	NC_016848	GCA	2	6	86405	86410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981555
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1619	NC_016848	ACC	2	6	86498	86503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981555
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1621	NC_016848	ATG	2	6	86529	86534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981555
1622	NC_016848	GCACC	2	10	86610	86619	20 %	0 %	20 %	60 %	378981555
1623	NC_016848	AGC	2	6	86674	86679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981555
1624	NC_016848	GGC	2	6	86704	86709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981555
1625	NC_016848	CG	4	8	86726	86733	0 %	0 %	50 %	50 %	378981555
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1999	NC_016848	CTT	2	6	105254	105259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981573
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