MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016848	TGA	2	6	881227	881232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982299
17503	NC_016848	GC	3	6	881250	881255	0 %	0 %	50 %	50 %	378982299
17504	NC_016848	GAG	2	6	881313	881318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982299
17505	NC_016848	AGC	2	6	881386	881391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982299
17506	NC_016848	TCGC	2	8	881399	881406	0 %	25 %	25 %	50 %	378982299
17507	NC_016848	TGCA	2	8	881414	881421	25 %	25 %	25 %	25 %	378982299
17508	NC_016848	CG	3	6	881428	881433	0 %	0 %	50 %	50 %	378982299
17509	NC_016848	CAA	2	6	881504	881509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982299
17510	NC_016848	A	7	7	883514	883520	100 %	0 %	0 %	0 %	378982300
17511	NC_016848	TTC	2	6	883537	883542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982300
17512	NC_016848	TGCG	2	8	883651	883658	0 %	25 %	50 %	25 %	378982300
17513	NC_016848	CTC	2	6	883792	883797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982300
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17515	NC_016848	CACAC	2	10	883935	883944	40 %	0 %	0 %	60 %	378982300
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17517	NC_016848	CAG	2	6	884022	884027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982300
17518	NC_016848	CG	3	6	884036	884041	0 %	0 %	50 %	50 %	378982300
17519	NC_016848	TGCTCC	2	12	884048	884059	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378982300
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17521	NC_016848	AC	3	6	884095	884100	50 %	0 %	0 %	50 %	378982300
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17525	NC_016848	GC	4	8	884412	884419	0 %	0 %	50 %	50 %	378982300
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17544	NC_016848	TTA	2	6	885578	885583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982301
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17551	NC_016848	GCTG	2	8	885758	885765	0 %	25 %	50 %	25 %	378982302
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17553	NC_016848	CGT	2	6	885874	885879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982302
17554	NC_016848	GTCTC	2	10	885892	885901	0 %	40 %	20 %	40 %	378982303
17555	NC_016848	TGA	2	6	885928	885933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982304
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17557	NC_016848	CG	3	6	886095	886100	0 %	0 %	50 %	50 %	378982304
17558	NC_016848	CAAACA	2	12	886128	886139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982304
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17561	NC_016848	TGC	2	6	886284	886289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982304
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17564	NC_016848	GAA	2	6	886403	886408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982304
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17569	NC_016848	GCGCG	2	10	886691	886700	0 %	0 %	60 %	40 %	378982304
17570	NC_016848	A	6	6	886837	886842	100 %	0 %	0 %	0 %	378982305
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17575	NC_016848	CTGA	2	8	887110	887117	25 %	25 %	25 %	25 %	378982305
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17604	NC_016848	AC	3	6	888820	888825	50 %	0 %	0 %	50 %	378982306
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17607	NC_016848	ATGC	2	8	888910	888917	25 %	25 %	25 %	25 %	378982306
17608	NC_016848	TCAC	2	8	888922	888929	25 %	25 %	0 %	50 %	378982306
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