MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16503	NC_016848	AGC	2	6	831955	831960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982249
16504	NC_016848	CG	3	6	832001	832006	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
16505	NC_016848	ACC	2	6	832021	832026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982249
16506	NC_016848	TAGG	2	8	832081	832088	25 %	25 %	50 %	0 %	378982249
16507	NC_016848	AG	3	6	832101	832106	50 %	0 %	50 %	0 %	378982249
16508	NC_016848	GC	3	6	832137	832142	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
16509	NC_016848	ACA	2	6	832174	832179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982249
16510	NC_016848	GAT	2	6	832230	832235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982249
16511	NC_016848	AGCA	2	8	832272	832279	50 %	0 %	25 %	25 %	378982249
16512	NC_016848	CGAG	2	8	832301	832308	25 %	0 %	50 %	25 %	378982249
16513	NC_016848	GAC	2	6	832348	832353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982249
16514	NC_016848	G	6	6	832373	832378	0 %	0 %	100 %	0 %	378982249
16515	NC_016848	A	6	6	832386	832391	100 %	0 %	0 %	0 %	378982249
16516	NC_016848	GAA	2	6	832405	832410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982249
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16518	NC_016848	AAG	2	6	832497	832502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982249
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16520	NC_016848	TGC	2	6	832575	832580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982249
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16522	NC_016848	CG	4	8	832592	832599	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
16523	NC_016848	ACCT	2	8	832649	832656	25 %	25 %	0 %	50 %	378982250
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16526	NC_016848	GCAC	2	8	832815	832822	25 %	0 %	25 %	50 %	378982250
16527	NC_016848	CGA	2	6	832877	832882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982250
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16531	NC_016848	GCCC	2	8	832969	832976	0 %	0 %	25 %	75 %	378982250
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16537	NC_016848	GCA	2	6	833249	833254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982250
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16539	NC_016848	TCAT	2	8	833287	833294	25 %	50 %	0 %	25 %	378982250
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16543	NC_016848	CTCA	2	8	833453	833460	25 %	25 %	0 %	50 %	378982250
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16551	NC_016848	CCAT	2	8	833845	833852	25 %	25 %	0 %	50 %	378982252
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16555	NC_016848	CCAGTC	2	12	834074	834085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378982252
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16558	NC_016848	CGTG	2	8	834317	834324	0 %	25 %	50 %	25 %	378982252
16559	NC_016848	GCG	2	6	834387	834392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982252
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16564	NC_016848	CG	4	8	834762	834769	0 %	0 %	50 %	50 %	378982252
16565	NC_016848	TGTT	2	8	834928	834935	0 %	75 %	25 %	0 %	378982252
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16579	NC_016848	CAT	2	6	835958	835963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982253
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16602	NC_016848	GC	3	6	837260	837265	0 %	0 %	50 %	50 %	378982254
16603	NC_016848	ATCG	2	8	837296	837303	25 %	25 %	25 %	25 %	378982254
16604	NC_016848	CCGA	2	8	837311	837318	25 %	0 %	25 %	50 %	378982254
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16606	NC_016848	ACG	2	6	837378	837383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982254
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