MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016848	CGT	2	6	806453	806458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982223
16003	NC_016848	CGT	2	6	806484	806489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982223
16004	NC_016848	GC	3	6	806490	806495	0 %	0 %	50 %	50 %	378982223
16005	NC_016848	AC	3	6	806537	806542	50 %	0 %	0 %	50 %	378982223
16006	NC_016848	T	6	6	806725	806730	0 %	100 %	0 %	0 %	378982223
16007	NC_016848	TGAA	2	8	806787	806794	50 %	25 %	25 %	0 %	378982223
16008	NC_016848	A	6	6	806796	806801	100 %	0 %	0 %	0 %	378982223
16009	NC_016848	CAA	2	6	806826	806831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982223
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16013	NC_016848	CGCT	2	8	807121	807128	0 %	25 %	25 %	50 %	378982223
16014	NC_016848	CG	3	6	807207	807212	0 %	0 %	50 %	50 %	378982223
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16017	NC_016848	ACAA	2	8	807274	807281	75 %	0 %	0 %	25 %	378982223
16018	NC_016848	AGA	2	6	807341	807346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982223
16019	NC_016848	A	8	8	807372	807379	100 %	0 %	0 %	0 %	378982223
16020	NC_016848	GAG	2	6	807381	807386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982223
16021	NC_016848	A	7	7	807388	807394	100 %	0 %	0 %	0 %	378982223
16022	NC_016848	CA	3	6	807584	807589	50 %	0 %	0 %	50 %	378982224
16023	NC_016848	CACT	2	8	807597	807604	25 %	25 %	0 %	50 %	378982224
16024	NC_016848	GCA	2	6	807611	807616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982224
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16030	NC_016848	GC	3	6	807812	807817	0 %	0 %	50 %	50 %	378982224
16031	NC_016848	CGCA	2	8	807870	807877	25 %	0 %	25 %	50 %	378982224
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16040	NC_016848	AAG	2	6	808179	808184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982224
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16042	NC_016848	ATA	2	6	808218	808223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982224
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16045	NC_016848	C	6	6	808379	808384	0 %	0 %	0 %	100 %	378982225
16046	NC_016848	GC	3	6	808403	808408	0 %	0 %	50 %	50 %	378982225
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16049	NC_016848	TGC	2	6	808539	808544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982225
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16054	NC_016848	CA	3	6	808919	808924	50 %	0 %	0 %	50 %	378982226
16055	NC_016848	AACGC	2	10	808929	808938	40 %	0 %	20 %	40 %	378982226
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16057	NC_016848	CCT	2	6	808971	808976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982226
16058	NC_016848	GCT	2	6	809049	809054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982226
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16061	NC_016848	GTAT	2	8	809161	809168	25 %	50 %	25 %	0 %	378982226
16062	NC_016848	GCA	2	6	809325	809330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982226
16063	NC_016848	CG	3	6	809373	809378	0 %	0 %	50 %	50 %	378982226
16064	NC_016848	CG	3	6	809381	809386	0 %	0 %	50 %	50 %	378982226
16065	NC_016848	A	7	7	809392	809398	100 %	0 %	0 %	0 %	378982226
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16069	NC_016848	CTG	2	6	809521	809526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982226
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16106	NC_016848	GC	3	6	811116	811121	0 %	0 %	50 %	50 %	378982231
16107	NC_016848	CCTT	2	8	811170	811177	0 %	50 %	0 %	50 %	378982231
16108	NC_016848	CA	3	6	811309	811314	50 %	0 %	0 %	50 %	378982231
16109	NC_016848	CG	3	6	811381	811386	0 %	0 %	50 %	50 %	378982231
16110	NC_016848	GC	3	6	811526	811531	0 %	0 %	50 %	50 %	378982231
16111	NC_016848	GCAG	2	8	811557	811564	25 %	0 %	50 %	25 %	378982231
16112	NC_016848	CACC	2	8	811576	811583	25 %	0 %	0 %	75 %	378982231
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16119	NC_016848	TCT	2	6	812139	812144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982231
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16123	NC_016848	GTA	2	6	812354	812359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982231
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16236	NC_016848	ATCC	2	8	818274	818281	25 %	25 %	0 %	50 %	378982236
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16239	NC_016848	GC	3	6	818359	818364	0 %	0 %	50 %	50 %	378982236
16240	NC_016848	AC	4	8	818365	818372	50 %	0 %	0 %	50 %	378982236
16241	NC_016848	CCG	3	9	818420	818428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982236
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16490	NC_016848	GGC	2	6	831494	831499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982249
16491	NC_016848	AAT	2	6	831531	831536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982249
16492	NC_016848	A	6	6	831633	831638	100 %	0 %	0 %	0 %	378982249
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