MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016848	CAA	2	6	730241	730246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982150
14503	NC_016848	AGA	2	6	730286	730291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982150
14504	NC_016848	CAT	2	6	730361	730366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982150
14505	NC_016848	GCAC	2	8	730410	730417	25 %	0 %	25 %	50 %	378982150
14506	NC_016848	T	6	6	730438	730443	0 %	100 %	0 %	0 %	378982150
14507	NC_016848	CAA	2	6	730487	730492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982150
14508	NC_016848	TCA	2	6	730582	730587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982150
14509	NC_016848	AAT	2	6	730625	730630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982150
14510	NC_016848	AGC	2	6	730632	730637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982150
14511	NC_016848	GAAG	2	8	730701	730708	50 %	0 %	50 %	0 %	378982150
14512	NC_016848	TTA	2	6	730746	730751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982150
14513	NC_016848	ATC	2	6	730838	730843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982150
14514	NC_016848	T	7	7	730895	730901	0 %	100 %	0 %	0 %	378982150
14515	NC_016848	GCC	2	6	731007	731012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982150
14516	NC_016848	TTC	2	6	731093	731098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982150
14517	NC_016848	TGC	2	6	731100	731105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982150
14518	NC_016848	ATG	2	6	731157	731162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982150
14519	NC_016848	CA	3	6	731206	731211	50 %	0 %	0 %	50 %	378982150
14520	NC_016848	A	6	6	731261	731266	100 %	0 %	0 %	0 %	378982150
14521	NC_016848	ATG	2	6	731330	731335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982150
14522	NC_016848	GCAC	2	8	731471	731478	25 %	0 %	25 %	50 %	378982150
14523	NC_016848	CGGTA	2	10	731482	731491	20 %	20 %	40 %	20 %	378982150
14524	NC_016848	C	6	6	731499	731504	0 %	0 %	0 %	100 %	378982150
14525	NC_016848	TGGCA	2	10	731655	731664	20 %	20 %	40 %	20 %	378982150
14526	NC_016848	A	6	6	731714	731719	100 %	0 %	0 %	0 %	378982150
14527	NC_016848	CG	3	6	731734	731739	0 %	0 %	50 %	50 %	378982150
14528	NC_016848	CCA	2	6	731772	731777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982150
14529	NC_016848	CAC	2	6	732088	732093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982151
14530	NC_016848	A	7	7	732103	732109	100 %	0 %	0 %	0 %	378982151
14531	NC_016848	CG	3	6	732122	732127	0 %	0 %	50 %	50 %	378982151
14532	NC_016848	AC	3	6	732143	732148	50 %	0 %	0 %	50 %	378982151
14533	NC_016848	CAT	2	6	732232	732237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982151
14534	NC_016848	A	6	6	732241	732246	100 %	0 %	0 %	0 %	378982151
14535	NC_016848	CAGCAT	2	12	732346	732357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378982151
14536	NC_016848	GCA	2	6	732360	732365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982151
14537	NC_016848	ACCGA	2	10	732383	732392	40 %	0 %	20 %	40 %	378982151
14538	NC_016848	GA	3	6	732572	732577	50 %	0 %	50 %	0 %	378982151
14539	NC_016848	AAT	2	6	732614	732619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982151
14540	NC_016848	TAGA	2	8	732630	732637	50 %	25 %	25 %	0 %	378982151
14541	NC_016848	GCAC	2	8	732650	732657	25 %	0 %	25 %	50 %	378982152
14542	NC_016848	TGC	2	6	732697	732702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14543	NC_016848	ACGT	2	8	732748	732755	25 %	25 %	25 %	25 %	378982152
14544	NC_016848	CATG	2	8	732767	732774	25 %	25 %	25 %	25 %	378982152
14545	NC_016848	GAA	2	6	732776	732781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982152
14546	NC_016848	CCT	2	6	732796	732801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982152
14547	NC_016848	TC	3	6	732914	732919	0 %	50 %	0 %	50 %	378982152
14548	NC_016848	CCAG	2	8	732946	732953	25 %	0 %	25 %	50 %	378982152
14549	NC_016848	CCA	2	6	733046	733051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982152
14550	NC_016848	ATA	2	6	733057	733062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982152
14551	NC_016848	GC	3	6	733079	733084	0 %	0 %	50 %	50 %	378982152
14552	NC_016848	CTC	2	6	733089	733094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982152
14553	NC_016848	CACAG	2	10	733096	733105	40 %	0 %	20 %	40 %	378982152
14554	NC_016848	TATT	2	8	733219	733226	25 %	75 %	0 %	0 %	378982152
14555	NC_016848	TCA	2	6	733294	733299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982152
14556	NC_016848	ATA	2	6	733317	733322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982152
14557	NC_016848	TC	3	6	733350	733355	0 %	50 %	0 %	50 %	378982152
14558	NC_016848	TTC	2	6	733368	733373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982152
14559	NC_016848	GCTT	2	8	733428	733435	0 %	50 %	25 %	25 %	378982152
14560	NC_016848	T	6	6	733456	733461	0 %	100 %	0 %	0 %	378982152
14561	NC_016848	TCG	2	6	733483	733488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14562	NC_016848	ATT	2	6	733549	733554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982152
14563	NC_016848	T	8	8	733561	733568	0 %	100 %	0 %	0 %	378982152
14564	NC_016848	AGG	2	6	733610	733615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982152
14565	NC_016848	TCA	2	6	733639	733644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982152
14566	NC_016848	CAA	2	6	733686	733691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982152
14567	NC_016848	AATT	2	8	733814	733821	50 %	50 %	0 %	0 %	378982152
14568	NC_016848	CGG	2	6	733850	733855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982152
14569	NC_016848	TTA	2	6	733918	733923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982152
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14571	NC_016848	TTTC	2	8	734046	734053	0 %	75 %	0 %	25 %	378982152
14572	NC_016848	TATTT	2	10	734188	734197	20 %	80 %	0 %	0 %	378982152
14573	NC_016848	AT	3	6	734221	734226	50 %	50 %	0 %	0 %	378982152
14574	NC_016848	AATG	2	8	734232	734239	50 %	25 %	25 %	0 %	378982152
14575	NC_016848	TCC	2	6	734281	734286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982152
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14578	NC_016848	CGT	2	6	734443	734448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14579	NC_016848	CTG	2	6	734624	734629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14580	NC_016848	T	6	6	734739	734744	0 %	100 %	0 %	0 %	378982152
14581	NC_016848	ATC	2	6	734760	734765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982152
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14585	NC_016848	CGCA	2	8	734898	734905	25 %	0 %	25 %	50 %	378982152
14586	NC_016848	CTT	2	6	734918	734923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982152
14587	NC_016848	CAAAA	2	10	734933	734942	80 %	0 %	0 %	20 %	378982152
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14589	NC_016848	CCCCG	2	10	735070	735079	0 %	0 %	20 %	80 %	378982152
14590	NC_016848	TAA	2	6	735113	735118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982152
14591	NC_016848	CAA	2	6	735143	735148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982152
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14593	NC_016848	TTC	2	6	735198	735203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982152
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14597	NC_016848	AGA	2	6	735405	735410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982152
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14600	NC_016848	CGT	2	6	735530	735535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14601	NC_016848	ACC	2	6	735541	735546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982152
14602	NC_016848	TCAA	2	8	735574	735581	50 %	25 %	0 %	25 %	378982152
14603	NC_016848	TCT	2	6	735596	735601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982152
14604	NC_016848	TCA	2	6	735604	735609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982152
14605	NC_016848	GC	3	6	735669	735674	0 %	0 %	50 %	50 %	378982152
14606	NC_016848	TTC	2	6	735678	735683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982152
14607	NC_016848	CAAGA	2	10	735731	735740	60 %	0 %	20 %	20 %	378982152
14608	NC_016848	GTA	2	6	735801	735806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982152
14609	NC_016848	GGA	2	6	735828	735833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982152
14610	NC_016848	AGCA	2	8	735870	735877	50 %	0 %	25 %	25 %	378982152
14611	NC_016848	CAG	2	6	735980	735985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982152
14612	NC_016848	AAGCGC	2	12	736035	736046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982152
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14614	NC_016848	TCCA	2	8	736098	736105	25 %	25 %	0 %	50 %	378982152
14615	NC_016848	AAT	2	6	736112	736117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982152
14616	NC_016848	GC	3	6	736149	736154	0 %	0 %	50 %	50 %	378982152
14617	NC_016848	AGGG	2	8	736320	736327	25 %	0 %	75 %	0 %	378982153
14618	NC_016848	GTC	2	6	736350	736355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982153
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14620	NC_016848	CA	3	6	736397	736402	50 %	0 %	0 %	50 %	378982153
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