MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14004	NC_016848	GCAG	2	8	703697	703704	25 %	0 %	50 %	25 %	378982124
14005	NC_016848	TCC	2	6	703705	703710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982124
14006	NC_016848	CAA	2	6	703730	703735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982124
14007	NC_016848	CTT	2	6	703755	703760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982124
14008	NC_016848	CTGCA	2	10	703821	703830	20 %	20 %	20 %	40 %	378982124
14009	NC_016848	AGA	2	6	703880	703885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982124
14010	NC_016848	AAAC	2	8	703900	703907	75 %	0 %	0 %	25 %	378982124
14011	NC_016848	CTG	2	6	703929	703934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982124
14012	NC_016848	CACC	2	8	703970	703977	25 %	0 %	0 %	75 %	378982124
14013	NC_016848	CACT	2	8	703979	703986	25 %	25 %	0 %	50 %	378982124
14014	NC_016848	ACCGA	2	10	704038	704047	40 %	0 %	20 %	40 %	378982124
14015	NC_016848	CA	3	6	704075	704080	50 %	0 %	0 %	50 %	378982124
14016	NC_016848	GTA	2	6	704091	704096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982124
14017	NC_016848	AT	3	6	704166	704171	50 %	50 %	0 %	0 %	378982124
14018	NC_016848	CT	3	6	704188	704193	0 %	50 %	0 %	50 %	378982124
14019	NC_016848	ATGT	2	8	704231	704238	25 %	50 %	25 %	0 %	378982124
14020	NC_016848	ACG	2	6	704243	704248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982124
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14023	NC_016848	A	6	6	704419	704424	100 %	0 %	0 %	0 %	378982124
14024	NC_016848	ACA	2	6	704483	704488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982124
14025	NC_016848	CA	3	6	704522	704527	50 %	0 %	0 %	50 %	378982124
14026	NC_016848	CGA	2	6	704540	704545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982124
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14033	NC_016848	CAG	2	6	705152	705157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982126
14034	NC_016848	TTG	2	6	705168	705173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982126
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14039	NC_016848	CACG	2	8	705298	705305	25 %	0 %	25 %	50 %	378982126
14040	NC_016848	GC	3	6	705347	705352	0 %	0 %	50 %	50 %	378982126
14041	NC_016848	GC	3	6	705354	705359	0 %	0 %	50 %	50 %	378982126
14042	NC_016848	CA	3	6	705408	705413	50 %	0 %	0 %	50 %	378982126
14043	NC_016848	CTG	2	6	705414	705419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982126
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14052	NC_016848	AACAA	2	10	706122	706131	80 %	0 %	0 %	20 %	378982126
14053	NC_016848	CG	3	6	706138	706143	0 %	0 %	50 %	50 %	378982126
14054	NC_016848	GTT	2	6	706163	706168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982126
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14057	NC_016848	GAA	2	6	706304	706309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982126
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14059	NC_016848	CGC	2	6	706360	706365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982126
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14061	NC_016848	GATC	2	8	706417	706424	25 %	25 %	25 %	25 %	378982126
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14065	NC_016848	CTTT	2	8	706640	706647	0 %	75 %	0 %	25 %	378982126
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14093	NC_016848	CGG	2	6	707949	707954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982128
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14101	NC_016848	AGCCA	2	10	709105	709114	40 %	0 %	20 %	40 %	378982129
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14103	NC_016848	TGCG	2	8	709252	709259	0 %	25 %	50 %	25 %	378982129
14104	NC_016848	CG	3	6	709269	709274	0 %	0 %	50 %	50 %	378982129
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14123	NC_016848	TGC	2	6	710102	710107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982130
14124	NC_016848	CTA	2	6	710130	710135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982130
14125	NC_016848	GCACG	2	10	710193	710202	20 %	0 %	40 %	40 %	378982130
14126	NC_016848	GTA	2	6	710207	710212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982130
14127	NC_016848	TGC	2	6	710215	710220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982130
14128	NC_016848	GAG	2	6	710244	710249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982130
14129	NC_016848	GCA	2	6	710327	710332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982130
14130	NC_016848	A	6	6	710525	710530	100 %	0 %	0 %	0 %	378982130
14131	NC_016848	A	6	6	710533	710538	100 %	0 %	0 %	0 %	378982130
14132	NC_016848	AGC	2	6	710664	710669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982131
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14134	NC_016848	GCGCC	2	10	710762	710771	0 %	0 %	40 %	60 %	378982131
14135	NC_016848	ACC	2	6	710816	710821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982131
14136	NC_016848	CA	3	6	710887	710892	50 %	0 %	0 %	50 %	378982131
14137	NC_016848	CCA	2	6	710896	710901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982131
14138	NC_016848	GCA	2	6	711054	711059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982131
14139	NC_016848	CTA	2	6	711169	711174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982131
14140	NC_016848	GATA	2	8	711199	711206	50 %	25 %	25 %	0 %	378982131
14141	NC_016848	CA	3	6	711241	711246	50 %	0 %	0 %	50 %	378982131
14142	NC_016848	CAAAC	2	10	711311	711320	60 %	0 %	0 %	40 %	378982131
14143	NC_016848	AGC	2	6	711339	711344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982131
14144	NC_016848	ATA	2	6	711362	711367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982131
14145	NC_016848	GC	3	6	711422	711427	0 %	0 %	50 %	50 %	378982131
14146	NC_016848	CGCT	2	8	711594	711601	0 %	25 %	25 %	50 %	378982131
14147	NC_016848	AC	3	6	711639	711644	50 %	0 %	0 %	50 %	378982131
14148	NC_016848	TGCA	2	8	711776	711783	25 %	25 %	25 %	25 %	378982131
14149	NC_016848	TC	3	6	711823	711828	0 %	50 %	0 %	50 %	378982131
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14154	NC_016848	CTT	2	6	712136	712141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982132
14155	NC_016848	GA	3	6	712176	712181	50 %	0 %	50 %	0 %	378982132
14156	NC_016848	ATCA	2	8	712215	712222	50 %	25 %	0 %	25 %	378982132
14157	NC_016848	AC	3	6	712301	712306	50 %	0 %	0 %	50 %	378982132
14158	NC_016848	GT	3	6	712345	712350	0 %	50 %	50 %	0 %	378982132
14159	NC_016848	ACGC	2	8	712386	712393	25 %	0 %	25 %	50 %	378982132
14160	NC_016848	TGA	2	6	712421	712426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982132
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14163	NC_016848	AGAA	2	8	712552	712559	75 %	0 %	25 %	0 %	378982132
14164	NC_016848	ATGCA	2	10	712575	712584	40 %	20 %	20 %	20 %	378982132
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14179	NC_016848	ACGT	2	8	713338	713345	25 %	25 %	25 %	25 %	378982132
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14230	NC_016848	GAAA	2	8	716331	716338	75 %	0 %	25 %	0 %	378982135
14231	NC_016848	AGG	2	6	716402	716407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982135
14232	NC_016848	AAG	2	6	716433	716438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982135
14233	NC_016848	GACA	2	8	716495	716502	50 %	0 %	25 %	25 %	378982135
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14241	NC_016848	AGG	2	6	717051	717056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982135
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14245	NC_016848	GCT	2	6	717198	717203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982135
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14485	NC_016848	CGCT	2	8	729546	729553	0 %	25 %	25 %	50 %	378982148
14486	NC_016848	ACC	2	6	729603	729608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982148
14487	NC_016848	TGG	2	6	729615	729620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982148
14488	NC_016848	GAG	2	6	729626	729631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982148
14489	NC_016848	CTT	2	6	729632	729637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982148
14490	NC_016848	CGTCC	2	10	729686	729695	0 %	20 %	20 %	60 %	378982148
14491	NC_016848	GAC	2	6	729701	729706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982148
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14493	NC_016848	AGC	2	6	729845	729850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982149
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