MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016848	TCCT	2	8	679416	679423	0 %	50 %	0 %	50 %	378982106
13503	NC_016848	G	6	6	679462	679467	0 %	0 %	100 %	0 %	378982106
13504	NC_016848	CAC	2	6	679479	679484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982106
13505	NC_016848	GC	3	6	679490	679495	0 %	0 %	50 %	50 %	378982106
13506	NC_016848	GC	4	8	679523	679530	0 %	0 %	50 %	50 %	378982106
13507	NC_016848	CCG	2	6	679563	679568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982106
13508	NC_016848	GC	3	6	679597	679602	0 %	0 %	50 %	50 %	378982106
13509	NC_016848	CT	3	6	679617	679622	0 %	50 %	0 %	50 %	378982106
13510	NC_016848	GC	3	6	679639	679644	0 %	0 %	50 %	50 %	378982106
13511	NC_016848	CTG	2	6	679668	679673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982106
13512	NC_016848	GCT	2	6	679697	679702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982106
13513	NC_016848	GTGA	2	8	679812	679819	25 %	25 %	50 %	0 %	378982106
13514	NC_016848	CGC	2	6	679859	679864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982106
13515	NC_016848	A	6	6	679869	679874	100 %	0 %	0 %	0 %	378982106
13516	NC_016848	CAGG	2	8	679965	679972	25 %	0 %	50 %	25 %	378982106
13517	NC_016848	CCG	2	6	679975	679980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982106
13518	NC_016848	TGAG	2	8	679993	680000	25 %	25 %	50 %	0 %	378982106
13519	NC_016848	CGA	2	6	680015	680020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982106
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13521	NC_016848	GAG	2	6	680115	680120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982106
13522	NC_016848	ACC	2	6	680121	680126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982106
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13524	NC_016848	GCA	2	6	680172	680177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982106
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13528	NC_016848	CGCC	2	8	680372	680379	0 %	0 %	25 %	75 %	378982106
13529	NC_016848	CA	3	6	680422	680427	50 %	0 %	0 %	50 %	378982106
13530	NC_016848	TCA	2	6	680458	680463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982106
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13533	NC_016848	G	6	6	680506	680511	0 %	0 %	100 %	0 %	378982106
13534	NC_016848	CGC	2	6	680593	680598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982106
13535	NC_016848	CG	4	8	680620	680627	0 %	0 %	50 %	50 %	378982106
13536	NC_016848	CCA	2	6	680658	680663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982106
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13542	NC_016848	TGC	2	6	680885	680890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13544	NC_016848	ACGC	2	8	680943	680950	25 %	0 %	25 %	50 %	378982107
13545	NC_016848	GCA	2	6	680971	680976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13548	NC_016848	TGCACG	2	12	681119	681130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13551	NC_016848	TCG	2	6	681220	681225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13554	NC_016848	GC	3	6	681381	681386	0 %	0 %	50 %	50 %	378982107
13555	NC_016848	CACG	2	8	681395	681402	25 %	0 %	25 %	50 %	378982107
13556	NC_016848	C	7	7	681425	681431	0 %	0 %	0 %	100 %	378982107
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13559	NC_016848	TGTT	2	8	681528	681535	0 %	75 %	25 %	0 %	378982107
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13561	NC_016848	GC	3	6	681690	681695	0 %	0 %	50 %	50 %	378982107
13562	NC_016848	CAG	2	6	681708	681713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
13563	NC_016848	GC	3	6	681759	681764	0 %	0 %	50 %	50 %	378982107
13564	NC_016848	TTGC	2	8	681780	681787	0 %	50 %	25 %	25 %	378982107
13565	NC_016848	CGA	2	6	681812	681817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13569	NC_016848	CGGTGT	2	12	681917	681928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378982107
13570	NC_016848	ACG	2	6	681964	681969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
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13578	NC_016848	CG	3	6	682418	682423	0 %	0 %	50 %	50 %	378982108
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13592	NC_016848	AAG	2	6	682920	682925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982108
13593	NC_016848	CG	4	8	682942	682949	0 %	0 %	50 %	50 %	378982108
13594	NC_016848	A	6	6	682957	682962	100 %	0 %	0 %	0 %	378982108
13595	NC_016848	AGAC	2	8	682965	682972	50 %	0 %	25 %	25 %	378982108
13596	NC_016848	AAG	2	6	682974	682979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982108
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13601	NC_016848	A	7	7	683113	683119	100 %	0 %	0 %	0 %	378982109
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13604	NC_016848	TCA	2	6	683168	683173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982109
13605	NC_016848	AG	3	6	683211	683216	50 %	0 %	50 %	0 %	378982109
13606	NC_016848	T	6	6	683235	683240	0 %	100 %	0 %	0 %	378982109
13607	NC_016848	AT	3	6	683275	683280	50 %	50 %	0 %	0 %	378982109
13608	NC_016848	TC	3	6	683313	683318	0 %	50 %	0 %	50 %	378982109
13609	NC_016848	AGC	2	6	683339	683344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982109
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13615	NC_016848	CCAT	2	8	683822	683829	25 %	25 %	0 %	50 %	378982109
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13617	NC_016848	T	6	6	683931	683936	0 %	100 %	0 %	0 %	378982109
13618	NC_016848	GACC	2	8	683949	683956	25 %	0 %	25 %	50 %	378982109
13619	NC_016848	C	9	9	684049	684057	0 %	0 %	0 %	100 %	378982109
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13990	NC_016848	CTG	2	6	702913	702918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982123
13991	NC_016848	CTTG	2	8	703044	703051	0 %	50 %	25 %	25 %	378982123
13992	NC_016848	GTCAG	2	10	703089	703098	20 %	20 %	40 %	20 %	378982123
13993	NC_016848	AGT	2	6	703107	703112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982123
13994	NC_016848	TGC	2	6	703175	703180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982123
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14000	NC_016848	CAG	2	6	703464	703469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982123

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