MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016848	ACA	2	6	654923	654928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982083
13003	NC_016848	CAC	2	6	654942	654947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982083
13004	NC_016848	AAT	2	6	654954	654959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982083
13005	NC_016848	CT	4	8	654972	654979	0 %	50 %	0 %	50 %	378982084
13006	NC_016848	CA	3	6	655006	655011	50 %	0 %	0 %	50 %	378982084
13007	NC_016848	CTT	2	6	655039	655044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982084
13008	NC_016848	GC	3	6	655062	655067	0 %	0 %	50 %	50 %	378982084
13009	NC_016848	TCT	2	6	655071	655076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982084
13010	NC_016848	ACGC	2	8	655135	655142	25 %	0 %	25 %	50 %	378982084
13011	NC_016848	CCT	2	6	655147	655152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982084
13012	NC_016848	TGC	2	6	655157	655162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982084
13013	NC_016848	ACGC	2	8	655180	655187	25 %	0 %	25 %	50 %	378982084
13014	NC_016848	AGG	2	6	655298	655303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982084
13015	NC_016848	CAC	3	9	655421	655429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982084
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13017	NC_016848	TCT	2	6	655519	655524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982084
13018	NC_016848	ACC	2	6	655607	655612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982084
13019	NC_016848	GC	3	6	655645	655650	0 %	0 %	50 %	50 %	378982084
13020	NC_016848	AGC	2	6	655676	655681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982084
13021	NC_016848	TTG	2	6	655705	655710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982084
13022	NC_016848	GCA	2	6	655728	655733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982084
13023	NC_016848	CTTT	2	8	655761	655768	0 %	75 %	0 %	25 %	378982084
13024	NC_016848	AG	3	6	655809	655814	50 %	0 %	50 %	0 %	378982084
13025	NC_016848	CAG	2	6	655825	655830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982084
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13028	NC_016848	TGCG	2	8	655888	655895	0 %	25 %	50 %	25 %	378982084
13029	NC_016848	CTT	2	6	655900	655905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982084
13030	NC_016848	CG	3	6	655951	655956	0 %	0 %	50 %	50 %	378982084
13031	NC_016848	CG	3	6	655965	655970	0 %	0 %	50 %	50 %	378982084
13032	NC_016848	CCA	2	6	655999	656004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982084
13033	NC_016848	TGC	2	6	656042	656047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982084
13034	NC_016848	CCGCC	2	10	656180	656189	0 %	0 %	20 %	80 %	378982085
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13036	NC_016848	TCA	2	6	656232	656237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982085
13037	NC_016848	CGACT	2	10	656239	656248	20 %	20 %	20 %	40 %	378982085
13038	NC_016848	CAGT	2	8	656265	656272	25 %	25 %	25 %	25 %	378982085
13039	NC_016848	AG	3	6	656308	656313	50 %	0 %	50 %	0 %	378982085
13040	NC_016848	TGT	2	6	656427	656432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982085
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13043	NC_016848	AAG	2	6	656616	656621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982085
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13049	NC_016848	GC	3	6	657004	657009	0 %	0 %	50 %	50 %	378982086
13050	NC_016848	TCT	2	6	657016	657021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982086
13051	NC_016848	A	6	6	657085	657090	100 %	0 %	0 %	0 %	378982086
13052	NC_016848	TGA	2	6	657119	657124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982086
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13054	NC_016848	CTT	2	6	657173	657178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982086
13055	NC_016848	TGC	2	6	657209	657214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982086
13056	NC_016848	T	6	6	657223	657228	0 %	100 %	0 %	0 %	378982086
13057	NC_016848	AGT	2	6	657279	657284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982086
13058	NC_016848	ACC	2	6	657419	657424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982086
13059	NC_016848	TCA	2	6	657434	657439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982086
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13062	NC_016848	TCCA	2	8	657612	657619	25 %	25 %	0 %	50 %	378982086
13063	NC_016848	TGA	2	6	657620	657625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982086
13064	NC_016848	TGC	2	6	657634	657639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982086
13065	NC_016848	CTG	2	6	657736	657741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982087
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13067	NC_016848	CG	3	6	657829	657834	0 %	0 %	50 %	50 %	378982087
13068	NC_016848	CG	4	8	657848	657855	0 %	0 %	50 %	50 %	378982087
13069	NC_016848	CCTG	2	8	657856	657863	0 %	25 %	25 %	50 %	378982087
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13104	NC_016848	CCA	2	6	659579	659584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982089
13105	NC_016848	CAA	2	6	659588	659593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982089
13106	NC_016848	CTCGC	2	10	659606	659615	0 %	20 %	20 %	60 %	378982089
13107	NC_016848	GCC	2	6	659691	659696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982089
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13109	NC_016848	AG	3	6	659751	659756	50 %	0 %	50 %	0 %	378982089
13110	NC_016848	TCT	2	6	659792	659797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982089
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13112	NC_016848	GCC	2	6	659844	659849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982089
13113	NC_016848	GCGCT	2	10	659883	659892	0 %	20 %	40 %	40 %	378982089
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13116	NC_016848	CAAA	2	8	659933	659940	75 %	0 %	0 %	25 %	378982089
13117	NC_016848	ATG	2	6	660019	660024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982089
13118	NC_016848	CCTGA	2	10	660078	660087	20 %	20 %	20 %	40 %	378982089
13119	NC_016848	CAC	2	6	660129	660134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982089
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13121	NC_016848	CAC	2	6	660533	660538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982090
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13235	NC_016848	CG	3	6	665930	665935	0 %	0 %	50 %	50 %	378982094
13236	NC_016848	GA	3	6	665960	665965	50 %	0 %	50 %	0 %	378982094
13237	NC_016848	A	8	8	665965	665972	100 %	0 %	0 %	0 %	378982094
13238	NC_016848	ATC	2	6	666112	666117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982094
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13240	NC_016848	TCG	2	6	666170	666175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982094
13241	NC_016848	AGG	2	6	666270	666275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982094
13242	NC_016848	ACGT	2	8	666423	666430	25 %	25 %	25 %	25 %	378982095
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