MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_016848	CTG	2	6	629974	629979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982064
12503	NC_016848	ACA	2	6	630091	630096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982064
12504	NC_016848	GCA	2	6	630099	630104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982064
12505	NC_016848	GC	3	6	630196	630201	0 %	0 %	50 %	50 %	378982064
12506	NC_016848	GC	3	6	630421	630426	0 %	0 %	50 %	50 %	378982064
12507	NC_016848	TCT	2	6	630429	630434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982064
12508	NC_016848	CGC	2	6	630439	630444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982064
12509	NC_016848	CCT	2	6	630450	630455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982064
12510	NC_016848	GC	3	6	630567	630572	0 %	0 %	50 %	50 %	378982064
12511	NC_016848	CG	3	6	630618	630623	0 %	0 %	50 %	50 %	378982064
12512	NC_016848	CGA	2	6	630653	630658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982064
12513	NC_016848	AGA	3	9	630662	630670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982064
12514	NC_016848	GAA	2	6	630675	630680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982064
12515	NC_016848	ACG	2	6	630731	630736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982065
12516	NC_016848	T	6	6	630771	630776	0 %	100 %	0 %	0 %	378982065
12517	NC_016848	GC	3	6	630778	630783	0 %	0 %	50 %	50 %	378982065
12518	NC_016848	GCT	2	6	630791	630796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982065
12519	NC_016848	AG	3	6	630827	630832	50 %	0 %	50 %	0 %	378982065
12520	NC_016848	CA	3	6	630839	630844	50 %	0 %	0 %	50 %	378982065
12521	NC_016848	CGC	2	6	630854	630859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982065
12522	NC_016848	GC	3	6	630858	630863	0 %	0 %	50 %	50 %	378982065
12523	NC_016848	CTG	2	6	631012	631017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982065
12524	NC_016848	GCC	2	6	631068	631073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982065
12525	NC_016848	GCA	2	6	631089	631094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982065
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12527	NC_016848	CAC	2	6	631113	631118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982065
12528	NC_016848	G	6	6	631154	631159	0 %	0 %	100 %	0 %	378982065
12529	NC_016848	CTG	2	6	631168	631173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982065
12530	NC_016848	GC	4	8	631202	631209	0 %	0 %	50 %	50 %	378982065
12531	NC_016848	CCA	2	6	631351	631356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982065
12532	NC_016848	AC	3	6	631435	631440	50 %	0 %	0 %	50 %	378982065
12533	NC_016848	T	6	6	631459	631464	0 %	100 %	0 %	0 %	378982065
12534	NC_016848	CAT	2	6	631466	631471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982065
12535	NC_016848	G	6	6	631507	631512	0 %	0 %	100 %	0 %	378982065
12536	NC_016848	CG	4	8	631541	631548	0 %	0 %	50 %	50 %	378982065
12537	NC_016848	GTTT	2	8	631550	631557	0 %	75 %	25 %	0 %	378982065
12538	NC_016848	GAT	2	6	631579	631584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982065
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12541	NC_016848	GC	3	6	631647	631652	0 %	0 %	50 %	50 %	378982066
12542	NC_016848	A	6	6	631701	631706	100 %	0 %	0 %	0 %	378982066
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12544	NC_016848	TCA	2	6	631841	631846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982066
12545	NC_016848	A	6	6	632022	632027	100 %	0 %	0 %	0 %	378982066
12546	NC_016848	ACCAC	2	10	632033	632042	40 %	0 %	0 %	60 %	378982066
12547	NC_016848	AC	4	8	632041	632048	50 %	0 %	0 %	50 %	378982066
12548	NC_016848	CG	4	8	632054	632061	0 %	0 %	50 %	50 %	378982066
12549	NC_016848	TCG	2	6	632082	632087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982066
12550	NC_016848	CG	3	6	632103	632108	0 %	0 %	50 %	50 %	378982066
12551	NC_016848	ACGC	2	8	632121	632128	25 %	0 %	25 %	50 %	378982066
12552	NC_016848	ACGCGC	2	12	632142	632153	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378982066
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12554	NC_016848	AAT	2	6	632266	632271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982066
12555	NC_016848	AAGG	2	8	632279	632286	50 %	0 %	50 %	0 %	378982066
12556	NC_016848	GGAA	2	8	632316	632323	50 %	0 %	50 %	0 %	378982066
12557	NC_016848	GC	4	8	632414	632421	0 %	0 %	50 %	50 %	378982067
12558	NC_016848	T	8	8	632446	632453	0 %	100 %	0 %	0 %	378982067
12559	NC_016848	CAG	2	6	632517	632522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982067
12560	NC_016848	GGC	2	6	632610	632615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982067
12561	NC_016848	TAT	2	6	632667	632672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982067
12562	NC_016848	GC	3	6	632811	632816	0 %	0 %	50 %	50 %	378982067
12563	NC_016848	GTAC	2	8	632826	632833	25 %	25 %	25 %	25 %	378982067
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12567	NC_016848	T	7	7	633122	633128	0 %	100 %	0 %	0 %	378982067
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12571	NC_016848	GAA	2	6	633240	633245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982067
12572	NC_016848	GTCA	2	8	633276	633283	25 %	25 %	25 %	25 %	378982067
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12574	NC_016848	AAT	2	6	633383	633388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982067
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12581	NC_016848	AAGT	2	8	633659	633666	50 %	25 %	25 %	0 %	378982068
12582	NC_016848	CTG	2	6	633675	633680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982068
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12589	NC_016848	CAT	2	6	634048	634053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982068
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12592	NC_016848	CTG	2	6	634189	634194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982068
12593	NC_016848	TC	3	6	634196	634201	0 %	50 %	0 %	50 %	378982068
12594	NC_016848	CAG	2	6	634285	634290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982068
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12601	NC_016848	CAC	2	6	634589	634594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982069
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12603	NC_016848	GCAAC	2	10	634665	634674	40 %	0 %	20 %	40 %	378982069
12604	NC_016848	TCAC	2	8	634736	634743	25 %	25 %	0 %	50 %	378982069
12605	NC_016848	GATG	2	8	634744	634751	25 %	25 %	50 %	0 %	378982069
12606	NC_016848	G	6	6	634797	634802	0 %	0 %	100 %	0 %	378982069
12607	NC_016848	T	8	8	634826	634833	0 %	100 %	0 %	0 %	378982069
12608	NC_016848	AC	3	6	634907	634912	50 %	0 %	0 %	50 %	378982069
12609	NC_016848	AGG	2	6	634991	634996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982069
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12611	NC_016848	GGT	2	6	635030	635035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982069
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12614	NC_016848	CTTT	2	8	635136	635143	0 %	75 %	0 %	25 %	378982069
12615	NC_016848	ATCG	2	8	635254	635261	25 %	25 %	25 %	25 %	378982069
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12620	NC_016848	AGG	2	6	635702	635707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982069
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12989	NC_016848	T	6	6	654169	654174	0 %	100 %	0 %	0 %	378982083
12990	NC_016848	AGC	2	6	654187	654192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982083
12991	NC_016848	GCA	2	6	654274	654279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982083
12992	NC_016848	CCG	2	6	654293	654298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982083
12993	NC_016848	CAA	2	6	654299	654304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982083
12994	NC_016848	TCC	2	6	654332	654337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982083
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12996	NC_016848	TACA	2	8	654552	654559	50 %	25 %	0 %	25 %	378982083
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12999	NC_016848	C	6	6	654783	654788	0 %	0 %	0 %	100 %	378982083
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