MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016848	ACCAT	2	10	583102	583111	40 %	20 %	0 %	40 %	378982021
11503	NC_016848	ACA	2	6	583144	583149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982021
11504	NC_016848	CAT	2	6	583188	583193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982021
11505	NC_016848	A	7	7	583260	583266	100 %	0 %	0 %	0 %	378982022
11506	NC_016848	TCGG	2	8	583282	583289	0 %	25 %	50 %	25 %	378982022
11507	NC_016848	CCTG	2	8	583310	583317	0 %	25 %	25 %	50 %	378982022
11508	NC_016848	TTG	2	6	583361	583366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982022
11509	NC_016848	CGG	2	6	583394	583399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982022
11510	NC_016848	GTT	2	6	583774	583779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982023
11511	NC_016848	ATCT	2	8	583856	583863	25 %	50 %	0 %	25 %	378982023
11512	NC_016848	CTT	2	6	583894	583899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982023
11513	NC_016848	AAAG	2	8	583924	583931	75 %	0 %	25 %	0 %	378982023
11514	NC_016848	GCT	2	6	583948	583953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982023
11515	NC_016848	ATT	2	6	583956	583961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982023
11516	NC_016848	CCG	2	6	584015	584020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982023
11517	NC_016848	CG	3	6	584070	584075	0 %	0 %	50 %	50 %	378982024
11518	NC_016848	TGC	2	6	584102	584107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982024
11519	NC_016848	ACGG	2	8	584174	584181	25 %	0 %	50 %	25 %	378982024
11520	NC_016848	AAG	2	6	584191	584196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982024
11521	NC_016848	TGT	2	6	584445	584450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982025
11522	NC_016848	TAG	2	6	584454	584459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982025
11523	NC_016848	GAA	3	9	584480	584488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982025
11524	NC_016848	TTGC	2	8	584504	584511	0 %	50 %	25 %	25 %	378982025
11525	NC_016848	A	6	6	584520	584525	100 %	0 %	0 %	0 %	378982025
11526	NC_016848	CG	3	6	584526	584531	0 %	0 %	50 %	50 %	378982025
11527	NC_016848	TTGC	2	8	584534	584541	0 %	50 %	25 %	25 %	378982025
11528	NC_016848	CGA	2	6	584581	584586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982025
11529	NC_016848	AGGCA	2	10	584603	584612	40 %	0 %	40 %	20 %	378982025
11530	NC_016848	TGC	2	6	584616	584621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982025
11531	NC_016848	CGC	2	6	584650	584655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982025
11532	NC_016848	CTG	2	6	584670	584675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982025
11533	NC_016848	GA	3	6	584737	584742	50 %	0 %	50 %	0 %	378982025
11534	NC_016848	GCG	2	6	584756	584761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982025
11535	NC_016848	CGCA	2	8	584862	584869	25 %	0 %	25 %	50 %	378982025
11536	NC_016848	CG	3	6	584927	584932	0 %	0 %	50 %	50 %	378982025
11537	NC_016848	GAA	2	6	584977	584982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982025
11538	NC_016848	CG	3	6	585020	585025	0 %	0 %	50 %	50 %	378982025
11539	NC_016848	CTC	2	6	585035	585040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982025
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11541	NC_016848	CGC	2	6	585154	585159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982026
11542	NC_016848	GGGC	2	8	585162	585169	0 %	0 %	75 %	25 %	378982026
11543	NC_016848	CA	4	8	585201	585208	50 %	0 %	0 %	50 %	378982026
11544	NC_016848	ATA	2	6	585220	585225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982026
11545	NC_016848	CGA	2	6	585278	585283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982026
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11547	NC_016848	T	6	6	585326	585331	0 %	100 %	0 %	0 %	378982026
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11550	NC_016848	AAT	2	6	585501	585506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982026
11551	NC_016848	A	7	7	585550	585556	100 %	0 %	0 %	0 %	378982026
11552	NC_016848	A	6	6	585570	585575	100 %	0 %	0 %	0 %	378982026
11553	NC_016848	GTAC	2	8	585583	585590	25 %	25 %	25 %	25 %	378982026
11554	NC_016848	TG	3	6	585701	585706	0 %	50 %	50 %	0 %	378982026
11555	NC_016848	CAG	2	6	585714	585719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982026
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11557	NC_016848	GC	3	6	585813	585818	0 %	0 %	50 %	50 %	378982026
11558	NC_016848	GC	3	6	585926	585931	0 %	0 %	50 %	50 %	378982026
11559	NC_016848	CA	3	6	585945	585950	50 %	0 %	0 %	50 %	378982026
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11561	NC_016848	GACA	2	8	586008	586015	50 %	0 %	25 %	25 %	378982026
11562	NC_016848	GC	3	6	586032	586037	0 %	0 %	50 %	50 %	378982026
11563	NC_016848	TAA	2	6	586077	586082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982026
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11565	NC_016848	TCA	2	6	586292	586297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982026
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11567	NC_016848	CGG	2	6	586350	586355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982026
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11570	NC_016848	GTG	2	6	586736	586741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982026
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11589	NC_016848	ACAG	2	8	587736	587743	50 %	0 %	25 %	25 %	378982029
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11598	NC_016848	T	6	6	588159	588164	0 %	100 %	0 %	0 %	378982029
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11604	NC_016848	T	7	7	588449	588455	0 %	100 %	0 %	0 %	378982029
11605	NC_016848	CAA	2	6	588478	588483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982029
11606	NC_016848	CG	3	6	588535	588540	0 %	0 %	50 %	50 %	378982029
11607	NC_016848	AGA	2	6	588698	588703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982029
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11611	NC_016848	TCC	2	6	588851	588856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982029
11612	NC_016848	AGG	2	6	588894	588899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982029
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11618	NC_016848	CACG	2	8	589475	589482	25 %	0 %	25 %	50 %	378982029
11619	NC_016848	CA	4	8	589590	589597	50 %	0 %	0 %	50 %	378982030
11620	NC_016848	CG	3	6	589625	589630	0 %	0 %	50 %	50 %	378982030
11621	NC_016848	TGCG	2	8	589649	589656	0 %	25 %	50 %	25 %	378982030
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11989	NC_016848	GCA	2	6	605814	605819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982044
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