MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016848	A	7	7	558445	558451	100 %	0 %	0 %	0 %	378981998
11002	NC_016848	A	7	7	558460	558466	100 %	0 %	0 %	0 %	378981998
11003	NC_016848	A	7	7	558590	558596	100 %	0 %	0 %	0 %	378981998
11004	NC_016848	CGC	2	6	558613	558618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981998
11005	NC_016848	AATGC	2	10	558629	558638	40 %	20 %	20 %	20 %	378981998
11006	NC_016848	CCT	2	6	558644	558649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981998
11007	NC_016848	TGC	2	6	558731	558736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981998
11008	NC_016848	AGCA	2	8	558775	558782	50 %	0 %	25 %	25 %	378981998
11009	NC_016848	TAA	2	6	558912	558917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981998
11010	NC_016848	AGG	2	6	558944	558949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981998
11011	NC_016848	GAAA	2	8	558985	558992	75 %	0 %	25 %	0 %	378981998
11012	NC_016848	TAA	2	6	559036	559041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981998
11013	NC_016848	GCA	2	6	559076	559081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981998
11014	NC_016848	AC	3	6	559114	559119	50 %	0 %	0 %	50 %	378981998
11015	NC_016848	AGA	2	6	559130	559135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981998
11016	NC_016848	TCG	2	6	559180	559185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981998
11017	NC_016848	AT	3	6	559244	559249	50 %	50 %	0 %	0 %	378981998
11018	NC_016848	TCC	2	6	559282	559287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981998
11019	NC_016848	TGC	2	6	559303	559308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981998
11020	NC_016848	A	6	6	559353	559358	100 %	0 %	0 %	0 %	378981998
11021	NC_016848	A	6	6	559372	559377	100 %	0 %	0 %	0 %	378981998
11022	NC_016848	GCA	2	6	559419	559424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981998
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11024	NC_016848	GA	4	8	559444	559451	50 %	0 %	50 %	0 %	378981998
11025	NC_016848	AAT	2	6	559514	559519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981998
11026	NC_016848	ACT	2	6	559573	559578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981998
11027	NC_016848	GAAA	2	8	559598	559605	75 %	0 %	25 %	0 %	378981998
11028	NC_016848	AGA	2	6	559618	559623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981998
11029	NC_016848	AGT	2	6	559653	559658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981998
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11031	NC_016848	CGG	2	6	559712	559717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981998
11032	NC_016848	CTG	2	6	559755	559760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981998
11033	NC_016848	ACT	2	6	559790	559795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981998
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11035	NC_016848	AGC	2	6	559841	559846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981998
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11038	NC_016848	ACA	2	6	559956	559961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981999
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11041	NC_016848	T	6	6	560094	560099	0 %	100 %	0 %	0 %	378981999
11042	NC_016848	TGT	2	6	560137	560142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981999
11043	NC_016848	AC	3	6	560179	560184	50 %	0 %	0 %	50 %	378981999
11044	NC_016848	AT	3	6	560244	560249	50 %	50 %	0 %	0 %	378981999
11045	NC_016848	GCA	2	6	560293	560298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981999
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11053	NC_016848	TGT	2	6	560715	560720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982000
11054	NC_016848	CGA	2	6	560845	560850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982000
11055	NC_016848	TCG	2	6	560859	560864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982000
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11058	NC_016848	GCAG	2	8	561072	561079	25 %	0 %	50 %	25 %	378982000
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11061	NC_016848	TTA	2	6	561245	561250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982001
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11070	NC_016848	CGCAG	2	10	561572	561581	20 %	0 %	40 %	40 %	378982001
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11091	NC_016848	GT	3	6	563730	563735	0 %	50 %	50 %	0 %	378982002
11092	NC_016848	TG	3	6	563815	563820	0 %	50 %	50 %	0 %	378982002
11093	NC_016848	GGT	2	6	563852	563857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982002
11094	NC_016848	A	7	7	563895	563901	100 %	0 %	0 %	0 %	378982002
11095	NC_016848	A	6	6	563934	563939	100 %	0 %	0 %	0 %	378982002
11096	NC_016848	TACC	2	8	563992	563999	25 %	25 %	0 %	50 %	378982002
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11099	NC_016848	TG	3	6	564138	564143	0 %	50 %	50 %	0 %	378982002
11100	NC_016848	T	6	6	564144	564149	0 %	100 %	0 %	0 %	378982002
11101	NC_016848	TCGG	2	8	564153	564160	0 %	25 %	50 %	25 %	378982002
11102	NC_016848	CTT	2	6	564207	564212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982002
11103	NC_016848	CG	3	6	564298	564303	0 %	0 %	50 %	50 %	378982002
11104	NC_016848	TTC	2	6	564308	564313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982002
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11106	NC_016848	CTTT	2	8	564379	564386	0 %	75 %	0 %	25 %	378982002
11107	NC_016848	CTG	2	6	564464	564469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982002
11108	NC_016848	CTTT	2	8	564504	564511	0 %	75 %	0 %	25 %	378982002
11109	NC_016848	ATC	2	6	564608	564613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982002
11110	NC_016848	TCGT	2	8	564626	564633	0 %	50 %	25 %	25 %	378982002
11111	NC_016848	CG	3	6	564719	564724	0 %	0 %	50 %	50 %	378982002
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11115	NC_016848	CG	3	6	564844	564849	0 %	0 %	50 %	50 %	378982002
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11119	NC_016848	CG	3	6	564918	564923	0 %	0 %	50 %	50 %	378982002
11120	NC_016848	CAT	2	6	564931	564936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982002
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11490	NC_016848	AGA	2	6	582522	582527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982021
11491	NC_016848	CAC	2	6	582536	582541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982021
11492	NC_016848	CCA	2	6	582551	582556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982021
11493	NC_016848	ACC	2	6	582652	582657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982021
11494	NC_016848	CAT	2	6	582692	582697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982021
11495	NC_016848	CTT	2	6	582882	582887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982021
11496	NC_016848	AATG	2	8	582930	582937	50 %	25 %	25 %	0 %	378982021
11497	NC_016848	TCTT	2	8	582961	582968	0 %	75 %	0 %	25 %	378982021
11498	NC_016848	GAT	2	6	583050	583055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982021
11499	NC_016848	CTG	2	6	583073	583078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982021
11500	NC_016848	CG	3	6	583085	583090	0 %	0 %	50 %	50 %	378982021

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