MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_016848	GAA	2	6	415028	415033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981870
8003	NC_016848	CGG	2	6	415122	415127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981870
8004	NC_016848	AGA	2	6	415137	415142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981870
8005	NC_016848	GGT	2	6	415223	415228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981871
8006	NC_016848	TGTAGG	2	12	415240	415251	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378981871
8007	NC_016848	GTA	2	6	415283	415288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981871
8008	NC_016848	CCA	2	6	415318	415323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981871
8009	NC_016848	GAT	2	6	415342	415347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981871
8010	NC_016848	AAGGGG	2	12	415439	415450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981871
8011	NC_016848	TCC	2	6	415513	415518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981871
8012	NC_016848	TTC	2	6	415530	415535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981871
8013	NC_016848	GAT	2	6	415562	415567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981871
8014	NC_016848	T	6	6	415699	415704	0 %	100 %	0 %	0 %	378981871
8015	NC_016848	GCT	2	6	415721	415726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981871
8016	NC_016848	GTTC	2	8	415727	415734	0 %	50 %	25 %	25 %	378981871
8017	NC_016848	GT	3	6	415765	415770	0 %	50 %	50 %	0 %	378981871
8018	NC_016848	TGG	2	6	415783	415788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981871
8019	NC_016848	A	6	6	415888	415893	100 %	0 %	0 %	0 %	378981871
8020	NC_016848	ATTAAA	2	12	415919	415930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981871
8021	NC_016848	GATG	2	8	415931	415938	25 %	25 %	50 %	0 %	378981871
8022	NC_016848	CCAG	2	8	415983	415990	25 %	0 %	25 %	50 %	378981871
8023	NC_016848	AAT	2	6	416035	416040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981871
8024	NC_016848	GC	3	6	416045	416050	0 %	0 %	50 %	50 %	378981871
8025	NC_016848	TG	3	6	416052	416057	0 %	50 %	50 %	0 %	378981871
8026	NC_016848	ATT	2	6	416129	416134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981871
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8028	NC_016848	GC	3	6	416148	416153	0 %	0 %	50 %	50 %	378981871
8029	NC_016848	CG	3	6	416199	416204	0 %	0 %	50 %	50 %	378981871
8030	NC_016848	GGA	2	6	416231	416236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981871
8031	NC_016848	GTG	2	6	416270	416275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981871
8032	NC_016848	GC	3	6	416314	416319	0 %	0 %	50 %	50 %	378981871
8033	NC_016848	GGA	2	6	416379	416384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981871
8034	NC_016848	ATG	2	6	416441	416446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981872
8035	NC_016848	GGT	3	9	416516	416524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981872
8036	NC_016848	GAT	2	6	416545	416550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981872
8037	NC_016848	GCA	2	6	416582	416587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981872
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8039	NC_016848	GAG	2	6	416775	416780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981872
8040	NC_016848	TGC	2	6	416794	416799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981872
8041	NC_016848	GAT	2	6	416887	416892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981872
8042	NC_016848	GCAC	2	8	416922	416929	25 %	0 %	25 %	50 %	378981872
8043	NC_016848	GAT	2	6	417017	417022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981872
8044	NC_016848	CTG	2	6	417023	417028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981872
8045	NC_016848	A	6	6	417100	417105	100 %	0 %	0 %	0 %	378981872
8046	NC_016848	GGGAGA	2	12	417142	417153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981872
8047	NC_016848	TAA	2	6	417193	417198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981872
8048	NC_016848	CTG	2	6	417239	417244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981872
8049	NC_016848	ATC	2	6	417335	417340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981872
8050	NC_016848	CAT	2	6	417462	417467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981872
8051	NC_016848	CGGTG	2	10	417472	417481	0 %	20 %	60 %	20 %	378981872
8052	NC_016848	GT	3	6	417489	417494	0 %	50 %	50 %	0 %	378981872
8053	NC_016848	ACGT	2	8	417775	417782	25 %	25 %	25 %	25 %	378981873
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8055	NC_016848	TGC	2	6	417879	417884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981873
8056	NC_016848	GGC	2	6	417918	417923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981873
8057	NC_016848	CGT	2	6	418000	418005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981873
8058	NC_016848	CG	3	6	418019	418024	0 %	0 %	50 %	50 %	378981873
8059	NC_016848	GCGT	2	8	418085	418092	0 %	25 %	50 %	25 %	378981873
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8061	NC_016848	TTAT	2	8	418112	418119	25 %	75 %	0 %	0 %	378981873
8062	NC_016848	T	8	8	418169	418176	0 %	100 %	0 %	0 %	378981873
8063	NC_016848	TA	3	6	418264	418269	50 %	50 %	0 %	0 %	378981873
8064	NC_016848	A	8	8	418319	418326	100 %	0 %	0 %	0 %	378981873
8065	NC_016848	CAGG	2	8	418344	418351	25 %	0 %	50 %	25 %	378981873
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8067	NC_016848	TTGC	2	8	418459	418466	0 %	50 %	25 %	25 %	378981873
8068	NC_016848	AC	4	8	418535	418542	50 %	0 %	0 %	50 %	378981873
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8070	NC_016848	TTC	2	6	418584	418589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981873
8071	NC_016848	TGA	2	6	418602	418607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981873
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8077	NC_016848	T	9	9	418923	418931	0 %	100 %	0 %	0 %	378981874
8078	NC_016848	TG	3	6	418941	418946	0 %	50 %	50 %	0 %	378981874
8079	NC_016848	GAA	2	6	418987	418992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981874
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8082	NC_016848	CG	3	6	419015	419020	0 %	0 %	50 %	50 %	378981874
8083	NC_016848	TGCG	2	8	419040	419047	0 %	25 %	50 %	25 %	378981874
8084	NC_016848	TGTAT	2	10	419092	419101	20 %	60 %	20 %	0 %	378981874
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8087	NC_016848	AGC	2	6	419176	419181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981874
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8089	NC_016848	GC	4	8	419195	419202	0 %	0 %	50 %	50 %	378981874
8090	NC_016848	TAC	2	6	419204	419209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981874
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8092	NC_016848	AG	3	6	419280	419285	50 %	0 %	50 %	0 %	378981874
8093	NC_016848	CT	3	6	419401	419406	0 %	50 %	0 %	50 %	378981875
8094	NC_016848	GAT	2	6	419620	419625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981875
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8096	NC_016848	CAACC	2	10	419699	419708	40 %	0 %	0 %	60 %	378981875
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8099	NC_016848	TGC	2	6	419931	419936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981875
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8102	NC_016848	AAG	2	6	420070	420075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981875
8103	NC_016848	TG	3	6	420098	420103	0 %	50 %	50 %	0 %	378981875
8104	NC_016848	CTTG	2	8	420141	420148	0 %	50 %	25 %	25 %	378981875
8105	NC_016848	GAGG	2	8	420163	420170	25 %	0 %	75 %	0 %	378981875
8106	NC_016848	TGCA	2	8	420179	420186	25 %	25 %	25 %	25 %	378981875
8107	NC_016848	CG	3	6	420196	420201	0 %	0 %	50 %	50 %	378981875
8108	NC_016848	CGTG	2	8	420206	420213	0 %	25 %	50 %	25 %	378981875
8109	NC_016848	AGA	2	6	420325	420330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981876
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8111	NC_016848	TATTGA	2	12	420464	420475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378981876
8112	NC_016848	ACC	2	6	420610	420615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981876
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8114	NC_016848	GGCGC	2	10	420749	420758	0 %	0 %	60 %	40 %	378981876
8115	NC_016848	ACC	2	6	420781	420786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981876
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8119	NC_016848	T	6	6	421027	421032	0 %	100 %	0 %	0 %	378981876
8120	NC_016848	A	7	7	421072	421078	100 %	0 %	0 %	0 %	378981876
8121	NC_016848	AGC	2	6	421090	421095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981876
8122	NC_016848	TAC	2	6	421100	421105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981876
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8124	NC_016848	GCA	2	6	421172	421177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981876
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8497	NC_016848	GGT	2	6	439395	439400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981894
8498	NC_016848	CAG	2	6	439402	439407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981894
8499	NC_016848	GC	3	6	439416	439421	0 %	0 %	50 %	50 %	378981894
8500	NC_016848	TCC	2	6	439468	439473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981894

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