MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016848	GCC	2	6	318736	318741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981781
6003	NC_016848	TGG	2	6	318765	318770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981781
6004	NC_016848	ACG	2	6	318806	318811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981781
6005	NC_016848	GCG	2	6	318839	318844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981781
6006	NC_016848	T	7	7	318846	318852	0 %	100 %	0 %	0 %	378981781
6007	NC_016848	GC	3	6	318968	318973	0 %	0 %	50 %	50 %	378981781
6008	NC_016848	CA	3	6	318978	318983	50 %	0 %	0 %	50 %	378981781
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6010	NC_016848	AGA	2	6	319215	319220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981782
6011	NC_016848	AT	3	6	319237	319242	50 %	50 %	0 %	0 %	378981782
6012	NC_016848	CCT	2	6	319317	319322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981782
6013	NC_016848	CAC	2	6	319462	319467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981782
6014	NC_016848	TGAA	2	8	319643	319650	50 %	25 %	25 %	0 %	378981782
6015	NC_016848	TAA	2	6	319670	319675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981782
6016	NC_016848	GCA	2	6	319708	319713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981782
6017	NC_016848	CTG	2	6	319714	319719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981782
6018	NC_016848	C	6	6	319720	319725	0 %	0 %	0 %	100 %	378981782
6019	NC_016848	GTT	2	6	319726	319731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981782
6020	NC_016848	GCA	2	6	319735	319740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981782
6021	NC_016848	CCG	2	6	319754	319759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981782
6022	NC_016848	CAGG	2	8	319768	319775	25 %	0 %	50 %	25 %	378981782
6023	NC_016848	A	6	6	319807	319812	100 %	0 %	0 %	0 %	378981782
6024	NC_016848	CCG	2	6	319862	319867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981782
6025	NC_016848	A	6	6	319969	319974	100 %	0 %	0 %	0 %	378981782
6026	NC_016848	GT	3	6	320057	320062	0 %	50 %	50 %	0 %	378981782
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6031	NC_016848	CTG	2	6	320373	320378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981782
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6034	NC_016848	C	7	7	320433	320439	0 %	0 %	0 %	100 %	378981782
6035	NC_016848	CGT	2	6	320481	320486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981782
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6038	NC_016848	CAT	2	6	320608	320613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981782
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6042	NC_016848	GT	4	8	320896	320903	0 %	50 %	50 %	0 %	378981782
6043	NC_016848	GTGC	2	8	320920	320927	0 %	25 %	50 %	25 %	378981782
6044	NC_016848	GCTC	2	8	320928	320935	0 %	25 %	25 %	50 %	378981782
6045	NC_016848	CGTC	2	8	320969	320976	0 %	25 %	25 %	50 %	378981782
6046	NC_016848	GAT	2	6	320991	320996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981782
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6050	NC_016848	CCTC	2	8	321381	321388	0 %	25 %	0 %	75 %	378981782
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6054	NC_016848	GAA	2	6	321529	321534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981782
6055	NC_016848	GA	3	6	321538	321543	50 %	0 %	50 %	0 %	378981782
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6058	NC_016848	CG	3	6	321618	321623	0 %	0 %	50 %	50 %	378981782
6059	NC_016848	TGA	2	6	321630	321635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981782
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6065	NC_016848	TTC	2	6	321853	321858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981782
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6098	NC_016848	GC	3	6	323342	323347	0 %	0 %	50 %	50 %	378981783
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6102	NC_016848	CGGCAC	2	12	323537	323548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378981783
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6110	NC_016848	GCG	2	6	324222	324227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981784
6111	NC_016848	GC	3	6	324350	324355	0 %	0 %	50 %	50 %	378981784
6112	NC_016848	ATG	2	6	324356	324361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981784
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6118	NC_016848	TAC	2	6	324541	324546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981784
6119	NC_016848	GGC	2	6	324631	324636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981785
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6495	NC_016848	CGC	2	6	343624	343629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981800
6496	NC_016848	TGGCG	2	10	343669	343678	0 %	20 %	60 %	20 %	378981800
6497	NC_016848	T	6	6	343709	343714	0 %	100 %	0 %	0 %	378981800
6498	NC_016848	GCA	2	6	343774	343779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981800
6499	NC_016848	GCAGG	2	10	343928	343937	20 %	0 %	60 %	20 %	378981800
6500	NC_016848	GGA	2	6	344057	344062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981800

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