MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 22539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016848	TAC	2	6	238321	238326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981711
4502	NC_016848	AG	4	8	238580	238587	50 %	0 %	50 %	0 %	378981712
4503	NC_016848	CGTG	2	8	238600	238607	0 %	25 %	50 %	25 %	378981712
4504	NC_016848	TGC	2	6	238687	238692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981712
4505	NC_016848	GT	3	6	238744	238749	0 %	50 %	50 %	0 %	378981712
4506	NC_016848	CGTG	2	8	238811	238818	0 %	25 %	50 %	25 %	378981712
4507	NC_016848	GGT	2	6	238846	238851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981712
4508	NC_016848	GCAGAC	2	12	238865	238876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981712
4509	NC_016848	TCG	2	6	238881	238886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981712
4510	NC_016848	GAA	2	6	238907	238912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981712
4511	NC_016848	GTC	2	6	238923	238928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981712
4512	NC_016848	GCG	2	6	238970	238975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981712
4513	NC_016848	GCCG	2	8	239025	239032	0 %	0 %	50 %	50 %	378981712
4514	NC_016848	TCC	2	6	239082	239087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981712
4515	NC_016848	GCACA	2	10	239144	239153	40 %	0 %	20 %	40 %	378981712
4516	NC_016848	AAC	2	6	239161	239166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981712
4517	NC_016848	T	6	6	239195	239200	0 %	100 %	0 %	0 %	378981712
4518	NC_016848	GTT	2	6	239245	239250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981712
4519	NC_016848	GGA	2	6	239281	239286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981712
4520	NC_016848	TGC	2	6	239310	239315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981712
4521	NC_016848	CA	3	6	239331	239336	50 %	0 %	0 %	50 %	378981712
4522	NC_016848	CGTG	2	8	239409	239416	0 %	25 %	50 %	25 %	378981713
4523	NC_016848	TGC	2	6	239417	239422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4524	NC_016848	TTC	2	6	239510	239515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981713
4525	NC_016848	CTG	2	6	239518	239523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4526	NC_016848	GGT	2	6	239529	239534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4527	NC_016848	ATC	2	6	239556	239561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981713
4528	NC_016848	TG	3	6	239635	239640	0 %	50 %	50 %	0 %	378981713
4529	NC_016848	TG	3	6	239656	239661	0 %	50 %	50 %	0 %	378981713
4530	NC_016848	GGT	2	6	239663	239668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4531	NC_016848	TCT	2	6	239697	239702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981713
4532	NC_016848	CTT	2	6	239707	239712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981713
4533	NC_016848	GC	3	6	239796	239801	0 %	0 %	50 %	50 %	378981713
4534	NC_016848	GC	3	6	239852	239857	0 %	0 %	50 %	50 %	378981713
4535	NC_016848	TATC	2	8	239891	239898	25 %	50 %	0 %	25 %	378981713
4536	NC_016848	CTCA	2	8	239916	239923	25 %	25 %	0 %	50 %	378981713
4537	NC_016848	AGG	2	6	239935	239940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981713
4538	NC_016848	GGC	2	6	239963	239968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981713
4539	NC_016848	GGC	2	6	240013	240018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981713
4540	NC_016848	GAA	2	6	240108	240113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981713
4541	NC_016848	TGC	2	6	240247	240252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4542	NC_016848	G	6	6	240253	240258	0 %	0 %	100 %	0 %	378981713
4543	NC_016848	CGT	2	6	240264	240269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4544	NC_016848	G	8	8	240293	240300	0 %	0 %	100 %	0 %	378981713
4545	NC_016848	CCG	2	6	240303	240308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981713
4546	NC_016848	GGT	2	6	240317	240322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4547	NC_016848	CT	3	6	240348	240353	0 %	50 %	0 %	50 %	378981713
4548	NC_016848	TGG	2	6	240361	240366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4549	NC_016848	AGG	2	6	240385	240390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981713
4550	NC_016848	TCG	2	6	240419	240424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4551	NC_016848	GCAAT	2	10	240519	240528	40 %	20 %	20 %	20 %	378981713
4552	NC_016848	GGCA	2	8	240540	240547	25 %	0 %	50 %	25 %	378981713
4553	NC_016848	GCC	2	6	240554	240559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981713
4554	NC_016848	TCAT	2	8	240578	240585	25 %	50 %	0 %	25 %	378981713
4555	NC_016848	CGG	2	6	240599	240604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981713
4556	NC_016848	TGCGC	2	10	240680	240689	0 %	20 %	40 %	40 %	378981713
4557	NC_016848	GCA	2	6	240701	240706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4558	NC_016848	CG	3	6	240723	240728	0 %	0 %	50 %	50 %	378981713
4559	NC_016848	CGC	2	6	240845	240850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981713
4560	NC_016848	TGA	2	6	240868	240873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981713
4561	NC_016848	TCA	2	6	240919	240924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981713
4562	NC_016848	GGT	2	6	240953	240958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4563	NC_016848	GT	3	6	240957	240962	0 %	50 %	50 %	0 %	378981713
4564	NC_016848	GCA	2	6	240965	240970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4565	NC_016848	GTTT	2	8	241052	241059	0 %	75 %	25 %	0 %	378981713
4566	NC_016848	GCA	2	6	241063	241068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4567	NC_016848	CGC	2	6	241091	241096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981713
4568	NC_016848	GT	3	6	241163	241168	0 %	50 %	50 %	0 %	378981713
4569	NC_016848	GGCA	2	8	241181	241188	25 %	0 %	50 %	25 %	378981713
4570	NC_016848	CTG	2	6	241206	241211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4571	NC_016848	CAT	2	6	241219	241224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981713
4572	NC_016848	GTG	2	6	241230	241235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981713
4573	NC_016848	CAG	2	6	241236	241241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981713
4574	NC_016848	GC	3	6	241245	241250	0 %	0 %	50 %	50 %	378981713
4575	NC_016848	CGG	2	6	241276	241281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981713
4576	NC_016848	ATT	2	6	241438	241443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981714
4577	NC_016848	GGT	2	6	241458	241463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981714
4578	NC_016848	GCGGGT	2	12	241506	241517	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378981714
4579	NC_016848	TGC	2	6	241598	241603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981714
4580	NC_016848	GCT	2	6	241627	241632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981714
4581	NC_016848	GCA	2	6	241652	241657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981714
4582	NC_016848	GTG	2	6	241712	241717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981714
4583	NC_016848	GCA	2	6	241747	241752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981714
4584	NC_016848	GGC	2	6	241754	241759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981714
4585	NC_016848	GT	3	6	241793	241798	0 %	50 %	50 %	0 %	378981714
4586	NC_016848	TGCG	2	8	241799	241806	0 %	25 %	50 %	25 %	378981714
4587	NC_016848	CATA	2	8	241816	241823	50 %	25 %	0 %	25 %	378981714
4588	NC_016848	CG	3	6	241923	241928	0 %	0 %	50 %	50 %	378981714
4589	NC_016848	CGTG	2	8	241945	241952	0 %	25 %	50 %	25 %	378981714
4590	NC_016848	CA	3	6	241979	241984	50 %	0 %	0 %	50 %	378981714
4591	NC_016848	TGT	2	6	242331	242336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981715
4592	NC_016848	CGT	2	6	242409	242414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981715
4593	NC_016848	TTC	2	6	242448	242453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981715
4594	NC_016848	T	6	6	242455	242460	0 %	100 %	0 %	0 %	378981715
4595	NC_016848	GTATT	2	10	242501	242510	20 %	60 %	20 %	0 %	378981715
4596	NC_016848	TCC	2	6	242536	242541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981715
4597	NC_016848	T	6	6	242662	242667	0 %	100 %	0 %	0 %	378981715
4598	NC_016848	AAG	2	6	242773	242778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981715
4599	NC_016848	GTT	2	6	242807	242812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981715
4600	NC_016848	TC	3	6	242857	242862	0 %	50 %	0 %	50 %	378981715
4601	NC_016848	CGG	2	6	243117	243122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981716
4602	NC_016848	GCG	2	6	243157	243162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981716
4603	NC_016848	TGC	2	6	243246	243251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981716
4604	NC_016848	AG	3	6	243254	243259	50 %	0 %	50 %	0 %	378981716
4605	NC_016848	AGG	2	6	243469	243474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981717
4606	NC_016848	GTG	2	6	243475	243480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981717
4607	NC_016848	GC	3	6	243487	243492	0 %	0 %	50 %	50 %	378981717
4608	NC_016848	TCT	3	9	243593	243601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981717
4609	NC_016848	CA	3	6	243637	243642	50 %	0 %	0 %	50 %	378981718
4610	NC_016848	AACG	2	8	243708	243715	50 %	0 %	25 %	25 %	378981718
4611	NC_016848	AAG	2	6	243769	243774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981718
4612	NC_016848	GGT	2	6	243777	243782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981718
4613	NC_016848	TTG	2	6	243808	243813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981718
4614	NC_016848	GGA	2	6	243842	243847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981718
4615	NC_016848	GT	3	6	243850	243855	0 %	50 %	50 %	0 %	378981718
4616	NC_016848	T	6	6	243888	243893	0 %	100 %	0 %	0 %	378981718
4617	NC_016848	TTC	2	6	243897	243902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981718
4618	NC_016848	CTC	2	6	243986	243991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981718
4619	NC_016848	T	6	6	244005	244010	0 %	100 %	0 %	0 %	378981718
4620	NC_016848	ACA	2	6	244017	244022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981718
4621	NC_016848	GGA	2	6	244068	244073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981718
4622	NC_016848	TGA	2	6	244076	244081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981718
4623	NC_016848	CAA	2	6	244089	244094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981718
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4733	NC_016848	GACG	2	8	249780	249787	25 %	0 %	50 %	25 %	378981724
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