MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_016844	GTC	2	6	1096167	1096172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975652
21503	NC_016844	T	8	8	1096188	1096195	0 %	100 %	0 %	0 %	378975652
21504	NC_016844	ATCTGC	2	12	1096321	1096332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975652
21505	NC_016844	TTG	2	6	1096392	1096397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975652
21506	NC_016844	GTT	2	6	1096438	1096443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975652
21507	NC_016844	CGG	2	6	1096464	1096469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975652
21508	NC_016844	TCA	2	6	1096528	1096533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975652
21509	NC_016844	ATA	2	6	1096534	1096539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975652
21510	NC_016844	ACGT	2	8	1096593	1096600	25 %	25 %	25 %	25 %	378975652
21511	NC_016844	TG	4	8	1096611	1096618	0 %	50 %	50 %	0 %	378975652
21512	NC_016844	TC	3	6	1096664	1096669	0 %	50 %	0 %	50 %	378975652
21513	NC_016844	CA	3	6	1096713	1096718	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21514	NC_016844	AT	3	6	1096984	1096989	50 %	50 %	0 %	0 %	378975653
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21516	NC_016844	CAT	2	6	1097089	1097094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975653
21517	NC_016844	CCAT	2	8	1097138	1097145	25 %	25 %	0 %	50 %	378975653
21518	NC_016844	T	7	7	1097184	1097190	0 %	100 %	0 %	0 %	378975653
21519	NC_016844	GGC	2	6	1097273	1097278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975653
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21539	NC_016844	GCAAC	2	10	1098108	1098117	40 %	0 %	20 %	40 %	378975653
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21542	NC_016844	A	6	6	1098293	1098298	100 %	0 %	0 %	0 %	378975653
21543	NC_016844	ATGG	2	8	1098359	1098366	25 %	25 %	50 %	0 %	378975653
21544	NC_016844	ATA	2	6	1098383	1098388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975653
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21553	NC_016844	TTC	2	6	1099015	1099020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975654
21554	NC_016844	GC	3	6	1099024	1099029	0 %	0 %	50 %	50 %	378975654
21555	NC_016844	TTCC	2	8	1099033	1099040	0 %	50 %	0 %	50 %	378975654
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21563	NC_016844	CGT	2	6	1099344	1099349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975654
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21568	NC_016844	CG	3	6	1099429	1099434	0 %	0 %	50 %	50 %	378975654
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21576	NC_016844	CA	3	6	1099965	1099970	50 %	0 %	0 %	50 %	378975655
21577	NC_016844	CGTA	2	8	1099994	1100001	25 %	25 %	25 %	25 %	378975655
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21589	NC_016844	ATC	2	6	1100719	1100724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975655
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21592	NC_016844	CAC	2	6	1100797	1100802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975655
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21602	NC_016844	CGCA	2	8	1101415	1101422	25 %	0 %	25 %	50 %	378975655
21603	NC_016844	TCCC	2	8	1101444	1101451	0 %	25 %	0 %	75 %	378975655
21604	NC_016844	TGC	2	6	1101483	1101488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975655
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21612	NC_016844	GC	3	6	1101958	1101963	0 %	0 %	50 %	50 %	378975655
21613	NC_016844	CAGT	2	8	1101996	1102003	25 %	25 %	25 %	25 %	378975655
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21616	NC_016844	T	6	6	1102057	1102062	0 %	100 %	0 %	0 %	378975655
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21618	NC_016844	TTTC	2	8	1102128	1102135	0 %	75 %	0 %	25 %	378975655
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