MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016844	GCA	2	6	1069151	1069156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975629
21003	NC_016844	TCG	2	6	1069162	1069167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975629
21004	NC_016844	GTA	2	6	1069179	1069184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975629
21005	NC_016844	TCT	2	6	1069243	1069248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975629
21006	NC_016844	CAG	2	6	1069287	1069292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975629
21007	NC_016844	CCT	2	6	1069325	1069330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975629
21008	NC_016844	TGC	2	6	1069437	1069442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975629
21009	NC_016844	TTG	2	6	1069455	1069460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975629
21010	NC_016844	TCA	2	6	1069552	1069557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975629
21011	NC_016844	TGA	2	6	1069559	1069564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975629
21012	NC_016844	GT	3	6	1069681	1069686	0 %	50 %	50 %	0 %	378975629
21013	NC_016844	AG	3	6	1069694	1069699	50 %	0 %	50 %	0 %	378975629
21014	NC_016844	GAT	2	6	1069736	1069741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975629
21015	NC_016844	TCC	3	9	1069744	1069752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975629
21016	NC_016844	TCT	2	6	1069811	1069816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975629
21017	NC_016844	AGAT	2	8	1069867	1069874	50 %	25 %	25 %	0 %	378975629
21018	NC_016844	CTT	2	6	1069899	1069904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975629
21019	NC_016844	TCT	2	6	1070257	1070262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975629
21020	NC_016844	CAA	2	6	1070291	1070296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975629
21021	NC_016844	TCT	2	6	1070308	1070313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975629
21022	NC_016844	GTAC	2	8	1070355	1070362	25 %	25 %	25 %	25 %	378975629
21023	NC_016844	CAA	2	6	1070366	1070371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975629
21024	NC_016844	AG	3	6	1070450	1070455	50 %	0 %	50 %	0 %	378975629
21025	NC_016844	AGC	2	6	1070473	1070478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975629
21026	NC_016844	TCC	2	6	1070517	1070522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975630
21027	NC_016844	A	6	6	1070531	1070536	100 %	0 %	0 %	0 %	378975630
21028	NC_016844	CGC	2	6	1070547	1070552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975630
21029	NC_016844	CG	4	8	1070561	1070568	0 %	0 %	50 %	50 %	378975630
21030	NC_016844	GCA	2	6	1070587	1070592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975630
21031	NC_016844	AACC	2	8	1070598	1070605	50 %	0 %	0 %	50 %	378975630
21032	NC_016844	GGT	2	6	1070612	1070617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975630
21033	NC_016844	ATG	2	6	1070682	1070687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975630
21034	NC_016844	ATGG	2	8	1070769	1070776	25 %	25 %	50 %	0 %	378975630
21035	NC_016844	AGG	2	6	1070859	1070864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975631
21036	NC_016844	GTG	2	6	1070930	1070935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975631
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21038	NC_016844	GAGGTG	2	12	1070981	1070992	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378975631
21039	NC_016844	TC	3	6	1071013	1071018	0 %	50 %	0 %	50 %	378975631
21040	NC_016844	TTCCG	2	10	1071033	1071042	0 %	40 %	20 %	40 %	378975631
21041	NC_016844	TGA	2	6	1071046	1071051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975631
21042	NC_016844	TGT	2	6	1071052	1071057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975631
21043	NC_016844	TGT	2	6	1071244	1071249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975631
21044	NC_016844	C	6	6	1071294	1071299	0 %	0 %	0 %	100 %	378975631
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21050	NC_016844	GCA	2	6	1071663	1071668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975631
21051	NC_016844	TTC	2	6	1071681	1071686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975631
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21054	NC_016844	G	6	6	1071799	1071804	0 %	0 %	100 %	0 %	378975631
21055	NC_016844	T	6	6	1071815	1071820	0 %	100 %	0 %	0 %	378975631
21056	NC_016844	TTG	2	6	1071872	1071877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975631
21057	NC_016844	TGC	2	6	1071908	1071913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975631
21058	NC_016844	GTT	2	6	1071973	1071978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975631
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21064	NC_016844	CGC	3	9	1072281	1072289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975631
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21067	NC_016844	TGA	2	6	1072585	1072590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975632
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21070	NC_016844	CT	3	6	1072821	1072826	0 %	50 %	0 %	50 %	378975632
21071	NC_016844	GTC	2	6	1072887	1072892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975632
21072	NC_016844	GTG	2	6	1072900	1072905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975632
21073	NC_016844	TGC	2	6	1072910	1072915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975632
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21085	NC_016844	AGC	2	6	1073575	1073580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975633
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21087	NC_016844	ACC	2	6	1073637	1073642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975633
21088	NC_016844	CGGTA	2	10	1073672	1073681	20 %	20 %	40 %	20 %	378975633
21089	NC_016844	GC	3	6	1073782	1073787	0 %	0 %	50 %	50 %	378975633
21090	NC_016844	AC	4	8	1073809	1073816	50 %	0 %	0 %	50 %	378975633
21091	NC_016844	A	6	6	1073841	1073846	100 %	0 %	0 %	0 %	378975633
21092	NC_016844	TGC	2	6	1073847	1073852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975633
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21094	NC_016844	CA	3	6	1073867	1073872	50 %	0 %	0 %	50 %	378975633
21095	NC_016844	AC	3	6	1073937	1073942	50 %	0 %	0 %	50 %	378975634
21096	NC_016844	TAT	2	6	1073972	1073977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975634
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21099	NC_016844	TCCT	2	8	1074090	1074097	0 %	50 %	0 %	50 %	378975634
21100	NC_016844	T	6	6	1074097	1074102	0 %	100 %	0 %	0 %	378975634
21101	NC_016844	CCA	2	6	1074223	1074228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975634
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21103	NC_016844	CAC	2	6	1074290	1074295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975634
21104	NC_016844	GA	3	6	1074310	1074315	50 %	0 %	50 %	0 %	378975634
21105	NC_016844	TGC	2	6	1074344	1074349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975634
21106	NC_016844	GCT	2	6	1074350	1074355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975634
21107	NC_016844	TTA	2	6	1074379	1074384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975634
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21109	NC_016844	TGC	2	6	1074460	1074465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975634
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21111	NC_016844	TG	3	6	1074484	1074489	0 %	50 %	50 %	0 %	378975634
21112	NC_016844	ATT	2	6	1074507	1074512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975634
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21115	NC_016844	AG	3	6	1074723	1074728	50 %	0 %	50 %	0 %	378975635
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21472	NC_016844	ATG	2	6	1094877	1094882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975651
21473	NC_016844	TCC	2	6	1094920	1094925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975651
21474	NC_016844	GCA	2	6	1094942	1094947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975651
21475	NC_016844	CA	4	8	1094946	1094953	50 %	0 %	0 %	50 %	378975651
21476	NC_016844	CG	3	6	1094986	1094991	0 %	0 %	50 %	50 %	378975651
21477	NC_016844	ACT	2	6	1095090	1095095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975651
21478	NC_016844	ATC	2	6	1095111	1095116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975651
21479	NC_016844	TCCCC	2	10	1095221	1095230	0 %	20 %	0 %	80 %	378975652
21480	NC_016844	AC	3	6	1095235	1095240	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21481	NC_016844	AC	3	6	1095257	1095262	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21482	NC_016844	CAC	2	6	1095264	1095269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975652
21483	NC_016844	CA	3	6	1095279	1095284	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21484	NC_016844	GCAG	2	8	1095307	1095314	25 %	0 %	50 %	25 %	378975652
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21486	NC_016844	AG	3	6	1095368	1095373	50 %	0 %	50 %	0 %	378975652
21487	NC_016844	AGC	2	6	1095490	1095495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975652
21488	NC_016844	GA	3	6	1095506	1095511	50 %	0 %	50 %	0 %	378975652
21489	NC_016844	TGCG	2	8	1095529	1095536	0 %	25 %	50 %	25 %	378975652
21490	NC_016844	CA	3	6	1095547	1095552	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21491	NC_016844	GAA	2	6	1095580	1095585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975652
21492	NC_016844	CG	3	6	1095615	1095620	0 %	0 %	50 %	50 %	378975652
21493	NC_016844	ACGC	2	8	1095647	1095654	25 %	0 %	25 %	50 %	378975652
21494	NC_016844	GAC	2	6	1095702	1095707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975652
21495	NC_016844	AC	3	6	1095744	1095749	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
21496	NC_016844	CTG	2	6	1095777	1095782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975652
21497	NC_016844	CTT	2	6	1095806	1095811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975652
21498	NC_016844	ACTC	2	8	1095824	1095831	25 %	25 %	0 %	50 %	378975652
21499	NC_016844	GGC	2	6	1096116	1096121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975652
21500	NC_016844	GCA	2	6	1096137	1096142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975652

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