MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016844	AC	3	6	972208	972213	50 %	0 %	0 %	50 %	378975532
19002	NC_016844	GCA	2	6	972219	972224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975532
19003	NC_016844	CTTT	2	8	972241	972248	0 %	75 %	0 %	25 %	378975532
19004	NC_016844	GC	3	6	972249	972254	0 %	0 %	50 %	50 %	378975532
19005	NC_016844	TCT	2	6	972265	972270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975532
19006	NC_016844	TTA	2	6	972271	972276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975532
19007	NC_016844	ACTC	2	8	972476	972483	25 %	25 %	0 %	50 %	378975533
19008	NC_016844	AGT	2	6	972489	972494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975533
19009	NC_016844	TCA	2	6	972535	972540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975533
19010	NC_016844	CCA	2	6	972541	972546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975533
19011	NC_016844	CCT	2	6	972572	972577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975533
19012	NC_016844	CTC	2	6	972582	972587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975533
19013	NC_016844	GGC	2	6	972612	972617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975533
19014	NC_016844	GAA	2	6	972757	972762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975533
19015	NC_016844	CTT	2	6	972773	972778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975533
19016	NC_016844	ACG	2	6	972810	972815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975533
19017	NC_016844	CATC	2	8	972830	972837	25 %	25 %	0 %	50 %	378975533
19018	NC_016844	CT	3	6	972850	972855	0 %	50 %	0 %	50 %	378975533
19019	NC_016844	CAA	2	6	972947	972952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975533
19020	NC_016844	TCA	2	6	972976	972981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975533
19021	NC_016844	ACG	2	6	972988	972993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975533
19022	NC_016844	CAG	2	6	973004	973009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975533
19023	NC_016844	TGA	2	6	973025	973030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975533
19024	NC_016844	ATCT	2	8	973062	973069	25 %	50 %	0 %	25 %	378975533
19025	NC_016844	TAA	2	6	973088	973093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975533
19026	NC_016844	CAT	2	6	973145	973150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975533
19027	NC_016844	CAA	2	6	973214	973219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975533
19028	NC_016844	CGT	2	6	973223	973228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975533
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19031	NC_016844	CG	4	8	973444	973451	0 %	0 %	50 %	50 %	378975533
19032	NC_016844	GTA	2	6	973455	973460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975533
19033	NC_016844	TC	3	6	973472	973477	0 %	50 %	0 %	50 %	378975533
19034	NC_016844	CTT	2	6	973478	973483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975533
19035	NC_016844	GCTCA	2	10	973527	973536	20 %	20 %	20 %	40 %	378975533
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19039	NC_016844	AC	3	6	973710	973715	50 %	0 %	0 %	50 %	378975533
19040	NC_016844	CTC	2	6	973719	973724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975533
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19044	NC_016844	CCG	2	6	973991	973996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975534
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19047	NC_016844	CTG	2	6	974272	974277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975534
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19050	NC_016844	GC	3	6	974605	974610	0 %	0 %	50 %	50 %	378975535
19051	NC_016844	TCA	2	6	974623	974628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975535
19052	NC_016844	AGGCA	2	10	974685	974694	40 %	0 %	40 %	20 %	378975535
19053	NC_016844	CAC	2	6	974828	974833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975535
19054	NC_016844	GCAC	2	8	974839	974846	25 %	0 %	25 %	50 %	378975535
19055	NC_016844	AAT	2	6	974849	974854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975535
19056	NC_016844	GGGA	2	8	974856	974863	25 %	0 %	75 %	0 %	378975535
19057	NC_016844	CCA	2	6	974906	974911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975535
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19061	NC_016844	TAA	2	6	975286	975291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975535
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19063	NC_016844	TAT	2	6	975371	975376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975535
19064	NC_016844	CTG	2	6	975402	975407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975535
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19069	NC_016844	CG	3	6	975707	975712	0 %	0 %	50 %	50 %	378975536
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19081	NC_016844	N	19	19	976428	976446	0 %	0 %	0 %	0 %	378975538
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19088	NC_016844	CAA	2	6	976813	976818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975538
19089	NC_016844	N	10	10	976833	976842	0 %	0 %	0 %	0 %	378975538
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19091	NC_016844	CA	3	6	976884	976889	50 %	0 %	0 %	50 %	378975538
19092	NC_016844	C	6	6	977042	977047	0 %	0 %	0 %	100 %	378975538
19093	NC_016844	CTG	2	6	977073	977078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975538
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19099	NC_016844	GA	3	6	977665	977670	50 %	0 %	50 %	0 %	378975538
19100	NC_016844	ACTA	2	8	977728	977735	50 %	25 %	0 %	25 %	378975538
19101	NC_016844	T	8	8	977797	977804	0 %	100 %	0 %	0 %	378975539
19102	NC_016844	GGT	2	6	977879	977884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975539
19103	NC_016844	TGC	2	6	977917	977922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975539
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19105	NC_016844	CGTG	2	8	978248	978255	0 %	25 %	50 %	25 %	378975539
19106	NC_016844	CCACG	2	10	978263	978272	20 %	0 %	20 %	60 %	378975539
19107	NC_016844	G	6	6	978272	978277	0 %	0 %	100 %	0 %	378975539
19108	NC_016844	CCGGAG	2	12	978323	978334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975539
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19110	NC_016844	GC	3	6	978460	978465	0 %	0 %	50 %	50 %	378975539
19111	NC_016844	GC	3	6	978480	978485	0 %	0 %	50 %	50 %	378975539
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19115	NC_016844	TGCA	2	8	978558	978565	25 %	25 %	25 %	25 %	378975539
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