MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016844	AGC	2	6	947789	947794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975506
18502	NC_016844	TGC	2	6	947880	947885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975506
18503	NC_016844	GC	4	8	947990	947997	0 %	0 %	50 %	50 %	378975506
18504	NC_016844	TC	3	6	948001	948006	0 %	50 %	0 %	50 %	378975506
18505	NC_016844	AAC	2	6	948033	948038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975506
18506	NC_016844	TGAC	2	8	948167	948174	25 %	25 %	25 %	25 %	378975506
18507	NC_016844	CCCA	2	8	948175	948182	25 %	0 %	0 %	75 %	378975506
18508	NC_016844	GCG	2	6	948199	948204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975506
18509	NC_016844	AGCT	2	8	948221	948228	25 %	25 %	25 %	25 %	378975506
18510	NC_016844	GGCA	2	8	948232	948239	25 %	0 %	50 %	25 %	378975506
18511	NC_016844	GC	3	6	948340	948345	0 %	0 %	50 %	50 %	378975506
18512	NC_016844	CTG	2	6	948361	948366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975506
18513	NC_016844	AAGCTC	2	12	948401	948412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975506
18514	NC_016844	CG	3	6	948451	948456	0 %	0 %	50 %	50 %	378975506
18515	NC_016844	CAC	2	6	948457	948462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975506
18516	NC_016844	CCTT	2	8	948549	948556	0 %	50 %	0 %	50 %	378975506
18517	NC_016844	TGA	2	6	948580	948585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975506
18518	NC_016844	AGC	2	6	948626	948631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975506
18519	NC_016844	CTT	2	6	948649	948654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975506
18520	NC_016844	ATGCG	2	10	948785	948794	20 %	20 %	40 %	20 %	378975507
18521	NC_016844	GCC	2	6	948867	948872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975507
18522	NC_016844	TACC	2	8	948933	948940	25 %	25 %	0 %	50 %	378975508
18523	NC_016844	A	6	6	948953	948958	100 %	0 %	0 %	0 %	378975508
18524	NC_016844	A	7	7	948963	948969	100 %	0 %	0 %	0 %	378975508
18525	NC_016844	GGA	2	6	949082	949087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975508
18526	NC_016844	ATCA	2	8	949098	949105	50 %	25 %	0 %	25 %	378975508
18527	NC_016844	A	6	6	949240	949245	100 %	0 %	0 %	0 %	378975509
18528	NC_016844	CCA	2	6	949279	949284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975509
18529	NC_016844	TTCA	2	8	949305	949312	25 %	50 %	0 %	25 %	378975509
18530	NC_016844	ACC	2	6	949338	949343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975509
18531	NC_016844	CAT	2	6	949346	949351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975509
18532	NC_016844	CTG	2	6	949399	949404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975509
18533	NC_016844	CAA	2	6	949679	949684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975509
18534	NC_016844	TGC	2	6	949703	949708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975509
18535	NC_016844	CAA	2	6	949721	949726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975509
18536	NC_016844	GCAG	2	8	949805	949812	25 %	0 %	50 %	25 %	378975509
18537	NC_016844	GCAAA	2	10	949842	949851	60 %	0 %	20 %	20 %	378975509
18538	NC_016844	GC	3	6	949921	949926	0 %	0 %	50 %	50 %	378975509
18539	NC_016844	TC	3	6	949934	949939	0 %	50 %	0 %	50 %	378975509
18540	NC_016844	GTGC	2	8	950132	950139	0 %	25 %	50 %	25 %	378975510
18541	NC_016844	GCG	2	6	950145	950150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975510
18542	NC_016844	ATCA	2	8	950237	950244	50 %	25 %	0 %	25 %	378975511
18543	NC_016844	GAT	2	6	950351	950356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975511
18544	NC_016844	A	6	6	950379	950384	100 %	0 %	0 %	0 %	378975511
18545	NC_016844	CAGG	2	8	950411	950418	25 %	0 %	50 %	25 %	378975511
18546	NC_016844	TTCA	2	8	950444	950451	25 %	50 %	0 %	25 %	378975511
18547	NC_016844	GGC	2	6	950518	950523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975511
18548	NC_016844	CCG	2	6	950538	950543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975511
18549	NC_016844	CGA	2	6	950584	950589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975511
18550	NC_016844	GC	3	6	950841	950846	0 %	0 %	50 %	50 %	378975511
18551	NC_016844	CGG	2	6	950928	950933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975511
18552	NC_016844	GCAG	2	8	950941	950948	25 %	0 %	50 %	25 %	378975511
18553	NC_016844	GCA	2	6	950980	950985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975511
18554	NC_016844	GAA	2	6	951001	951006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975511
18555	NC_016844	GCTC	2	8	951037	951044	0 %	25 %	25 %	50 %	378975511
18556	NC_016844	CTTTT	2	10	951200	951209	0 %	80 %	0 %	20 %	378975512
18557	NC_016844	TCA	2	6	951225	951230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975512
18558	NC_016844	AAC	2	6	951512	951517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975513
18559	NC_016844	GC	3	6	951542	951547	0 %	0 %	50 %	50 %	378975513
18560	NC_016844	CAA	2	6	951583	951588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975513
18561	NC_016844	GAAG	2	8	951601	951608	50 %	0 %	50 %	0 %	378975513
18562	NC_016844	GCGT	2	8	951625	951632	0 %	25 %	50 %	25 %	378975513
18563	NC_016844	TC	3	6	951712	951717	0 %	50 %	0 %	50 %	378975513
18564	NC_016844	CCCT	2	8	951723	951730	0 %	25 %	0 %	75 %	378975513
18565	NC_016844	A	9	9	951777	951785	100 %	0 %	0 %	0 %	378975513
18566	NC_016844	CAA	2	6	951835	951840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975513
18567	NC_016844	ACTC	2	8	951852	951859	25 %	25 %	0 %	50 %	378975513
18568	NC_016844	GTC	2	6	951933	951938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975513
18569	NC_016844	CGCTG	2	10	951952	951961	0 %	20 %	40 %	40 %	378975513
18570	NC_016844	CTGCGC	2	12	951971	951982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975513
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18572	NC_016844	GC	4	8	952075	952082	0 %	0 %	50 %	50 %	378975513
18573	NC_016844	AGC	2	6	952228	952233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975513
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18575	NC_016844	ACGG	2	8	952349	952356	25 %	0 %	50 %	25 %	378975513
18576	NC_016844	CGA	2	6	952378	952383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975513
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18578	NC_016844	CCAC	2	8	952428	952435	25 %	0 %	0 %	75 %	378975513
18579	NC_016844	GTC	2	6	952447	952452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975513
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18582	NC_016844	CG	3	6	952616	952621	0 %	0 %	50 %	50 %	378975513
18583	NC_016844	GC	3	6	952663	952668	0 %	0 %	50 %	50 %	378975513
18584	NC_016844	GTGC	2	8	952676	952683	0 %	25 %	50 %	25 %	378975513
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18587	NC_016844	A	6	6	952836	952841	100 %	0 %	0 %	0 %	378975513
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18589	NC_016844	GAA	2	6	952879	952884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975513
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18591	NC_016844	CGA	2	6	952966	952971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975513
18592	NC_016844	GAG	2	6	952991	952996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975513
18593	NC_016844	AAAG	2	8	952999	953006	75 %	0 %	25 %	0 %	378975513
18594	NC_016844	AAC	2	6	953013	953018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975513
18595	NC_016844	CTT	2	6	953045	953050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975513
18596	NC_016844	AGAC	2	8	953059	953066	50 %	0 %	25 %	25 %	378975513
18597	NC_016844	CA	3	6	953127	953132	50 %	0 %	0 %	50 %	378975513
18598	NC_016844	TGA	2	6	953203	953208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975513
18599	NC_016844	GTGC	2	8	953249	953256	0 %	25 %	50 %	25 %	378975513
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18602	NC_016844	ATGG	2	8	953474	953481	25 %	25 %	50 %	0 %	378975513
18603	NC_016844	A	6	6	953615	953620	100 %	0 %	0 %	0 %	378975514
18604	NC_016844	A	6	6	953659	953664	100 %	0 %	0 %	0 %	378975514
18605	NC_016844	AAAC	2	8	953668	953675	75 %	0 %	0 %	25 %	378975514
18606	NC_016844	CGG	2	6	953681	953686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975514
18607	NC_016844	T	6	6	953732	953737	0 %	100 %	0 %	0 %	378975514
18608	NC_016844	CGTG	2	8	953793	953800	0 %	25 %	50 %	25 %	378975514
18609	NC_016844	GCAC	2	8	953833	953840	25 %	0 %	25 %	50 %	378975514
18610	NC_016844	AG	3	6	953889	953894	50 %	0 %	50 %	0 %	378975514
18611	NC_016844	CT	3	6	953921	953926	0 %	50 %	0 %	50 %	378975514
18612	NC_016844	CT	3	6	953951	953956	0 %	50 %	0 %	50 %	378975514
18613	NC_016844	GAA	2	6	954061	954066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975514
18614	NC_016844	GTT	2	6	954115	954120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975514
18615	NC_016844	CTA	2	6	954224	954229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975515
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18617	NC_016844	CTG	2	6	954244	954249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975515
18618	NC_016844	CT	4	8	954260	954267	0 %	50 %	0 %	50 %	378975515
18619	NC_016844	ATTC	2	8	954276	954283	25 %	50 %	0 %	25 %	378975515
18620	NC_016844	GAA	2	6	954419	954424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975515
18621	NC_016844	GCT	2	6	954539	954544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975516
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18989	NC_016844	CTG	2	6	971594	971599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975532
18990	NC_016844	GCCG	2	8	971694	971701	0 %	0 %	50 %	50 %	378975532
18991	NC_016844	ACCC	2	8	971728	971735	25 %	0 %	0 %	75 %	378975532
18992	NC_016844	ACGG	2	8	971764	971771	25 %	0 %	50 %	25 %	378975532
18993	NC_016844	CGC	2	6	971781	971786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975532
18994	NC_016844	ACC	2	6	971789	971794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975532
18995	NC_016844	CGCTG	2	10	971830	971839	0 %	20 %	40 %	40 %	378975532
18996	NC_016844	GC	4	8	971867	971874	0 %	0 %	50 %	50 %	378975532
18997	NC_016844	TCA	2	6	971919	971924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975532
18998	NC_016844	CCCA	2	8	971936	971943	25 %	0 %	0 %	75 %	378975532
18999	NC_016844	TCC	2	6	971985	971990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975532
19000	NC_016844	TCC	2	6	972108	972113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975532

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