MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016844	C	6	6	869050	869055	0 %	0 %	0 %	100 %	378975438
17003	NC_016844	CG	3	6	869065	869070	0 %	0 %	50 %	50 %	378975438
17004	NC_016844	AGG	2	6	869085	869090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975438
17005	NC_016844	CCT	2	6	869108	869113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975438
17006	NC_016844	C	6	6	869133	869138	0 %	0 %	0 %	100 %	378975438
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17009	NC_016844	ACT	2	6	869482	869487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975438
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17011	NC_016844	GC	3	6	869557	869562	0 %	0 %	50 %	50 %	378975438
17012	NC_016844	GTA	2	6	869576	869581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975438
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17014	NC_016844	CAAC	2	8	869627	869634	50 %	0 %	0 %	50 %	378975438
17015	NC_016844	GCA	2	6	869644	869649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975438
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17017	NC_016844	CAG	2	6	869675	869680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975438
17018	NC_016844	CAG	2	6	869742	869747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975438
17019	NC_016844	CAT	2	6	869766	869771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975438
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17021	NC_016844	ATTCC	2	10	869798	869807	20 %	40 %	0 %	40 %	378975438
17022	NC_016844	CG	4	8	869824	869831	0 %	0 %	50 %	50 %	378975438
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17054	NC_016844	T	6	6	871581	871586	0 %	100 %	0 %	0 %	378975439
17055	NC_016844	GAA	2	6	871673	871678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975439
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17065	NC_016844	CGT	2	6	872238	872243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975439
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17098	NC_016844	A	6	6	873831	873836	100 %	0 %	0 %	0 %	378975441
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17102	NC_016844	TTTCG	2	10	874024	874033	0 %	60 %	20 %	20 %	378975441
17103	NC_016844	AG	3	6	874063	874068	50 %	0 %	50 %	0 %	378975441
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17105	NC_016844	CG	3	6	874147	874152	0 %	0 %	50 %	50 %	378975441
17106	NC_016844	CGG	2	6	874204	874209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975441
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17110	NC_016844	CA	3	6	874673	874678	50 %	0 %	0 %	50 %	378975442
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17117	NC_016844	TTC	2	6	874943	874948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975442
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17488	NC_016844	AGG	2	6	896631	896636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975466
17489	NC_016844	CCA	2	6	896684	896689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975466
17490	NC_016844	CAT	2	6	896719	896724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975466
17491	NC_016844	TGG	2	6	896835	896840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975466
17492	NC_016844	AC	3	6	896874	896879	50 %	0 %	0 %	50 %	378975466
17493	NC_016844	CG	3	6	896915	896920	0 %	0 %	50 %	50 %	378975466
17494	NC_016844	ACA	2	6	897035	897040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975466
17495	NC_016844	CAGGTG	2	12	897107	897118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975466
17496	NC_016844	TTC	2	6	897155	897160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975466
17497	NC_016844	GTACA	2	10	897242	897251	40 %	20 %	20 %	20 %	378975466
17498	NC_016844	CAGT	2	8	897287	897294	25 %	25 %	25 %	25 %	378975466
17499	NC_016844	CGG	2	6	897297	897302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975466
17500	NC_016844	ATGA	2	8	897309	897316	50 %	25 %	25 %	0 %	378975466

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