MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016844	GAA	2	6	819566	819571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975386
16003	NC_016844	TGC	2	6	819584	819589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975386
16004	NC_016844	CTG	2	6	819607	819612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975386
16005	NC_016844	GAA	3	9	819685	819693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975386
16006	NC_016844	CG	4	8	819709	819716	0 %	0 %	50 %	50 %	378975386
16007	NC_016844	GAA	2	6	819859	819864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975387
16008	NC_016844	CGC	2	6	819866	819871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975387
16009	NC_016844	CGCA	2	8	819962	819969	25 %	0 %	25 %	50 %	378975387
16010	NC_016844	AAGC	2	8	819978	819985	50 %	0 %	25 %	25 %	378975387
16011	NC_016844	ATA	2	6	820087	820092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975387
16012	NC_016844	A	8	8	820092	820099	100 %	0 %	0 %	0 %	378975387
16013	NC_016844	CTTC	2	8	820165	820172	0 %	50 %	0 %	50 %	378975388
16014	NC_016844	TTC	2	6	820262	820267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975388
16015	NC_016844	ATT	2	6	820271	820276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975388
16016	NC_016844	GC	3	6	820323	820328	0 %	0 %	50 %	50 %	378975388
16017	NC_016844	AGT	2	6	820340	820345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975388
16018	NC_016844	AGGC	2	8	820420	820427	25 %	0 %	50 %	25 %	378975388
16019	NC_016844	CG	3	6	820435	820440	0 %	0 %	50 %	50 %	378975388
16020	NC_016844	TCC	3	9	820509	820517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975388
16021	NC_016844	CCA	2	6	820588	820593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975388
16022	NC_016844	CT	3	6	820607	820612	0 %	50 %	0 %	50 %	378975388
16023	NC_016844	TGC	2	6	820656	820661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975388
16024	NC_016844	GAC	2	6	820678	820683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975388
16025	NC_016844	TAG	2	6	820705	820710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975388
16026	NC_016844	ATC	2	6	820718	820723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975388
16027	NC_016844	ACG	2	6	820787	820792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975388
16028	NC_016844	AG	3	6	820904	820909	50 %	0 %	50 %	0 %	378975388
16029	NC_016844	CACG	2	8	820960	820967	25 %	0 %	25 %	50 %	378975388
16030	NC_016844	ATT	2	6	820994	820999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975388
16031	NC_016844	ATG	2	6	821010	821015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975388
16032	NC_016844	GAA	2	6	821049	821054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975388
16033	NC_016844	A	6	6	821058	821063	100 %	0 %	0 %	0 %	378975388
16034	NC_016844	CG	3	6	821169	821174	0 %	0 %	50 %	50 %	378975388
16035	NC_016844	CTG	3	9	821213	821221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975388
16036	NC_016844	ACGC	2	8	821272	821279	25 %	0 %	25 %	50 %	378975388
16037	NC_016844	T	8	8	821280	821287	0 %	100 %	0 %	0 %	378975388
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16039	NC_016844	CTG	2	6	821329	821334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975388
16040	NC_016844	GCT	2	6	821419	821424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975388
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16042	NC_016844	A	7	7	821626	821632	100 %	0 %	0 %	0 %	378975389
16043	NC_016844	AGC	2	6	821668	821673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975389
16044	NC_016844	T	7	7	821734	821740	0 %	100 %	0 %	0 %	378975389
16045	NC_016844	AGA	2	6	821773	821778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975389
16046	NC_016844	CTC	2	6	821830	821835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975389
16047	NC_016844	GAC	2	6	821922	821927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975389
16048	NC_016844	CTGT	2	8	822001	822008	0 %	50 %	25 %	25 %	378975389
16049	NC_016844	TTC	2	6	822172	822177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975389
16050	NC_016844	AACC	2	8	822183	822190	50 %	0 %	0 %	50 %	378975389
16051	NC_016844	TCAC	2	8	822265	822272	25 %	25 %	0 %	50 %	378975390
16052	NC_016844	ACCT	2	8	822280	822287	25 %	25 %	0 %	50 %	378975390
16053	NC_016844	TC	3	6	822318	822323	0 %	50 %	0 %	50 %	378975390
16054	NC_016844	T	6	6	822335	822340	0 %	100 %	0 %	0 %	378975390
16055	NC_016844	GCA	2	6	822411	822416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975390
16056	NC_016844	TGC	2	6	822632	822637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975390
16057	NC_016844	CAT	2	6	822673	822678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975390
16058	NC_016844	CCA	2	6	822694	822699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975390
16059	NC_016844	GC	3	6	822718	822723	0 %	0 %	50 %	50 %	378975390
16060	NC_016844	AGT	2	6	822725	822730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975390
16061	NC_016844	CATC	2	8	822778	822785	25 %	25 %	0 %	50 %	378975390
16062	NC_016844	CGC	2	6	822839	822844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975390
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16065	NC_016844	AC	3	6	822956	822961	50 %	0 %	0 %	50 %	378975390
16066	NC_016844	GAA	2	6	823045	823050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975390
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16068	NC_016844	CAG	3	9	823120	823128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975390
16069	NC_016844	GGCAC	2	10	823185	823194	20 %	0 %	40 %	40 %	378975390
16070	NC_016844	GAA	2	6	823211	823216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975390
16071	NC_016844	CGA	2	6	823263	823268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975391
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16074	NC_016844	GAT	2	6	823324	823329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975391
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16080	NC_016844	GCT	2	6	823648	823653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975391
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16086	NC_016844	ATC	2	6	823947	823952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975392
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16089	NC_016844	TCC	2	6	824294	824299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975393
16090	NC_016844	CTG	2	6	824315	824320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975393
16091	NC_016844	GC	3	6	824334	824339	0 %	0 %	50 %	50 %	378975393
16092	NC_016844	AC	3	6	824379	824384	50 %	0 %	0 %	50 %	378975393
16093	NC_016844	ACC	2	6	824438	824443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975393
16094	NC_016844	GAA	2	6	824540	824545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975393
16095	NC_016844	CG	4	8	824557	824564	0 %	0 %	50 %	50 %	378975393
16096	NC_016844	CTT	2	6	824569	824574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975393
16097	NC_016844	A	7	7	824585	824591	100 %	0 %	0 %	0 %	378975393
16098	NC_016844	TGA	2	6	824725	824730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975393
16099	NC_016844	TTCT	2	8	824772	824779	0 %	75 %	0 %	25 %	378975393
16100	NC_016844	TCGA	2	8	824831	824838	25 %	25 %	25 %	25 %	378975393
16101	NC_016844	ATG	2	6	824855	824860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975393
16102	NC_016844	A	6	6	824862	824867	100 %	0 %	0 %	0 %	378975393
16103	NC_016844	TAC	2	6	824875	824880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975393
16104	NC_016844	CGCCC	2	10	825017	825026	0 %	0 %	20 %	80 %	378975393
16105	NC_016844	T	6	6	825060	825065	0 %	100 %	0 %	0 %	378975393
16106	NC_016844	CTGC	2	8	825184	825191	0 %	25 %	25 %	50 %	378975393
16107	NC_016844	ATC	2	6	825221	825226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975393
16108	NC_016844	GC	3	6	825298	825303	0 %	0 %	50 %	50 %	378975393
16109	NC_016844	TCTCT	2	10	825355	825364	0 %	60 %	0 %	40 %	378975393
16110	NC_016844	GCA	2	6	825387	825392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975393
16111	NC_016844	CTCC	2	8	825490	825497	0 %	25 %	0 %	75 %	378975393
16112	NC_016844	CCG	2	6	825513	825518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975393
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16115	NC_016844	CAT	2	6	825787	825792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975393
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16117	NC_016844	AGC	2	6	826059	826064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975393
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16119	NC_016844	CG	3	6	826136	826141	0 %	0 %	50 %	50 %	378975394
16120	NC_016844	CCGG	2	8	826146	826153	0 %	0 %	50 %	50 %	378975394
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