MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_016844	TGCG	2	8	796021	796028	0 %	25 %	50 %	25 %	378975361
15503	NC_016844	CCT	2	6	796131	796136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975361
15504	NC_016844	CAC	2	6	796159	796164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975361
15505	NC_016844	GCA	2	6	796257	796262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975361
15506	NC_016844	GCC	2	6	796319	796324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975361
15507	NC_016844	CG	3	6	796373	796378	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15508	NC_016844	ACGC	2	8	796395	796402	25 %	0 %	25 %	50 %	378975361
15509	NC_016844	CTGCGC	2	12	796483	796494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975361
15510	NC_016844	AC	3	6	796524	796529	50 %	0 %	0 %	50 %	378975361
15511	NC_016844	CG	3	6	796542	796547	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15512	NC_016844	CG	3	6	796556	796561	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15513	NC_016844	GC	3	6	796576	796581	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15514	NC_016844	GAG	2	6	796605	796610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975361
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15517	NC_016844	TCC	2	6	796708	796713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975361
15518	NC_016844	CTGC	2	8	796721	796728	0 %	25 %	25 %	50 %	378975361
15519	NC_016844	CAC	2	6	796752	796757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975361
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15521	NC_016844	CCA	2	6	796770	796775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975361
15522	NC_016844	CGA	2	6	796825	796830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975361
15523	NC_016844	GCA	2	6	796863	796868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975361
15524	NC_016844	GGGCAG	2	12	796869	796880	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975361
15525	NC_016844	GAAG	2	8	796886	796893	50 %	0 %	50 %	0 %	378975361
15526	NC_016844	CA	3	6	796956	796961	50 %	0 %	0 %	50 %	378975361
15527	NC_016844	CG	3	6	797005	797010	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15528	NC_016844	CGC	2	6	797029	797034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975361
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15534	NC_016844	CG	3	6	797164	797169	0 %	0 %	50 %	50 %	378975361
15535	NC_016844	CGC	2	6	797197	797202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975361
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15540	NC_016844	CT	3	6	797364	797369	0 %	50 %	0 %	50 %	378975361
15541	NC_016844	TGC	2	6	797422	797427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975361
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15550	NC_016844	CTT	2	6	797893	797898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975362
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15552	NC_016844	ACC	2	6	797933	797938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975362
15553	NC_016844	ACAG	2	8	797962	797969	50 %	0 %	25 %	25 %	378975362
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15555	NC_016844	TCT	2	6	797990	797995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975362
15556	NC_016844	ACCGC	2	10	798009	798018	20 %	0 %	20 %	60 %	378975362
15557	NC_016844	GCA	2	6	798227	798232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975362
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15563	NC_016844	CTG	2	6	798452	798457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975362
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15565	NC_016844	CG	3	6	798484	798489	0 %	0 %	50 %	50 %	378975362
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15592	NC_016844	CG	3	6	799503	799508	0 %	0 %	50 %	50 %	378975364
15593	NC_016844	TGA	2	6	799529	799534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975364
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15595	NC_016844	GC	3	6	799588	799593	0 %	0 %	50 %	50 %	378975364
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15602	NC_016844	GCAG	2	8	800021	800028	25 %	0 %	50 %	25 %	378975364
15603	NC_016844	C	6	6	800040	800045	0 %	0 %	0 %	100 %	378975364
15604	NC_016844	GCT	2	6	800070	800075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975364
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15610	NC_016844	CG	3	6	800346	800351	0 %	0 %	50 %	50 %	378975365
15611	NC_016844	TG	3	6	800371	800376	0 %	50 %	50 %	0 %	378975365
15612	NC_016844	CT	3	6	800379	800384	0 %	50 %	0 %	50 %	378975365
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15988	NC_016844	CCCT	2	8	818860	818867	0 %	25 %	0 %	75 %	378975386
15989	NC_016844	GAC	3	9	818894	818902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975386
15990	NC_016844	GCCGT	2	10	818918	818927	0 %	20 %	40 %	40 %	378975386
15991	NC_016844	GC	3	6	818940	818945	0 %	0 %	50 %	50 %	378975386
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15995	NC_016844	CT	3	6	819134	819139	0 %	50 %	0 %	50 %	378975386
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