MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016844	CAA	2	6	718078	718083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975285
14002	NC_016844	GACT	2	8	718344	718351	25 %	25 %	25 %	25 %	378975285
14003	NC_016844	GTC	2	6	718396	718401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975285
14004	NC_016844	CCG	2	6	718478	718483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975285
14005	NC_016844	GT	3	6	718510	718515	0 %	50 %	50 %	0 %	378975285
14006	NC_016844	AGA	2	6	718532	718537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975285
14007	NC_016844	ACC	2	6	718564	718569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975285
14008	NC_016844	TAT	2	6	718662	718667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975285
14009	NC_016844	ACG	2	6	718754	718759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975285
14010	NC_016844	AGC	2	6	718788	718793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975285
14011	NC_016844	CCGTA	2	10	718814	718823	20 %	20 %	20 %	40 %	378975286
14012	NC_016844	TCT	2	6	718873	718878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975286
14013	NC_016844	GGT	2	6	718895	718900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975286
14014	NC_016844	TG	3	6	718943	718948	0 %	50 %	50 %	0 %	378975286
14015	NC_016844	CTG	2	6	719001	719006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975286
14016	NC_016844	CT	3	6	719079	719084	0 %	50 %	0 %	50 %	378975286
14017	NC_016844	TTC	2	6	719103	719108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975286
14018	NC_016844	TC	3	6	719142	719147	0 %	50 %	0 %	50 %	378975286
14019	NC_016844	TTA	2	6	719221	719226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975286
14020	NC_016844	CGC	2	6	719315	719320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975286
14021	NC_016844	ATCG	2	8	719322	719329	25 %	25 %	25 %	25 %	378975286
14022	NC_016844	CCT	2	6	719342	719347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975286
14023	NC_016844	CCG	2	6	719431	719436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975286
14024	NC_016844	TGG	2	6	719485	719490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975286
14025	NC_016844	G	7	7	719595	719601	0 %	0 %	100 %	0 %	378975286
14026	NC_016844	ACA	2	6	719643	719648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975286
14027	NC_016844	GGA	2	6	719661	719666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975286
14028	NC_016844	CGC	2	6	719667	719672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975286
14029	NC_016844	CG	3	6	719702	719707	0 %	0 %	50 %	50 %	378975287
14030	NC_016844	CTG	2	6	719735	719740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975287
14031	NC_016844	TGC	2	6	719741	719746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975287
14032	NC_016844	GGC	2	6	719748	719753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975287
14033	NC_016844	T	6	6	719795	719800	0 %	100 %	0 %	0 %	378975287
14034	NC_016844	CAA	2	6	719805	719810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975287
14035	NC_016844	CGCTG	2	10	719840	719849	0 %	20 %	40 %	40 %	378975287
14036	NC_016844	CAA	2	6	719936	719941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975287
14037	NC_016844	TGC	2	6	720026	720031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975287
14038	NC_016844	T	7	7	720065	720071	0 %	100 %	0 %	0 %	378975287
14039	NC_016844	GC	3	6	720096	720101	0 %	0 %	50 %	50 %	378975287
14040	NC_016844	CAT	2	6	720105	720110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
14041	NC_016844	CT	4	8	720181	720188	0 %	50 %	0 %	50 %	378975287
14042	NC_016844	GGC	2	6	720195	720200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975287
14043	NC_016844	CAT	2	6	720255	720260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
14044	NC_016844	TCA	2	6	720317	720322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
14045	NC_016844	CCA	2	6	720347	720352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975287
14046	NC_016844	TC	3	6	720392	720397	0 %	50 %	0 %	50 %	378975287
14047	NC_016844	ATC	2	6	720400	720405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
14048	NC_016844	ATG	2	6	720424	720429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975287
14049	NC_016844	CCT	2	6	720453	720458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975287
14050	NC_016844	ACT	2	6	720495	720500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
14051	NC_016844	TG	3	6	720543	720548	0 %	50 %	50 %	0 %	378975288
14052	NC_016844	TTCT	2	8	720562	720569	0 %	75 %	0 %	25 %	378975288
14053	NC_016844	TC	3	6	720578	720583	0 %	50 %	0 %	50 %	378975288
14054	NC_016844	CCTGTA	2	12	720623	720634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975288
14055	NC_016844	TAC	2	6	720645	720650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975288
14056	NC_016844	AAC	2	6	720679	720684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975288
14057	NC_016844	ATG	2	6	720706	720711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975288
14058	NC_016844	CAT	2	6	720800	720805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975288
14059	NC_016844	A	6	6	720826	720831	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
14060	NC_016844	AG	3	6	720869	720874	50 %	0 %	50 %	0 %	378975288
14061	NC_016844	TAT	2	6	720924	720929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975288
14062	NC_016844	GGCA	2	8	720938	720945	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
14063	NC_016844	A	6	6	720957	720962	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
14064	NC_016844	CG	3	6	720977	720982	0 %	0 %	50 %	50 %	378975288
14065	NC_016844	TCT	2	6	720994	720999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
14066	NC_016844	CGTAT	2	10	721015	721024	20 %	40 %	20 %	20 %	378975288
14067	NC_016844	ATG	2	6	721029	721034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975288
14068	NC_016844	TGC	2	6	721058	721063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975288
14069	NC_016844	A	6	6	721094	721099	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
14070	NC_016844	GCAG	2	8	721115	721122	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
14071	NC_016844	CGGA	2	8	721171	721178	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
14072	NC_016844	TGT	2	6	721208	721213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975288
14073	NC_016844	CTT	2	6	721235	721240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
14074	NC_016844	CTT	2	6	721277	721282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
14075	NC_016844	CTT	2	6	721376	721381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
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14079	NC_016844	CGAG	2	8	721496	721503	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
14080	NC_016844	GCA	2	6	721527	721532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975288
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14082	NC_016844	CGC	2	6	721772	721777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975289
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14085	NC_016844	CGA	2	6	721885	721890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975290
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14088	NC_016844	CAA	2	6	722066	722071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975290
14089	NC_016844	CTGCA	2	10	722177	722186	20 %	20 %	20 %	40 %	378975290
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14091	NC_016844	TAA	2	6	722242	722247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975290
14092	NC_016844	AAT	2	6	722326	722331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975291
14093	NC_016844	CTG	2	6	722671	722676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975291
14094	NC_016844	CGG	2	6	722687	722692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975291
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14096	NC_016844	CTG	2	6	722921	722926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975291
14097	NC_016844	GC	4	8	722937	722944	0 %	0 %	50 %	50 %	378975291
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14100	NC_016844	TGG	2	6	723000	723005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975291
14101	NC_016844	TGCATT	2	12	723179	723190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975291
14102	NC_016844	T	8	8	723232	723239	0 %	100 %	0 %	0 %	378975291
14103	NC_016844	TAC	2	6	723299	723304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975291
14104	NC_016844	TC	3	6	723368	723373	0 %	50 %	0 %	50 %	378975291
14105	NC_016844	GAC	2	6	723396	723401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975291
14106	NC_016844	AGCG	2	8	723425	723432	25 %	0 %	50 %	25 %	378975291
14107	NC_016844	ATC	2	6	723434	723439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975291
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14109	NC_016844	CTGT	2	8	723525	723532	0 %	50 %	25 %	25 %	378975291
14110	NC_016844	TG	3	6	723541	723546	0 %	50 %	50 %	0 %	378975291
14111	NC_016844	TCC	2	6	723568	723573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975291
14112	NC_016844	TGA	2	6	723619	723624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975292
14113	NC_016844	CCG	2	6	723646	723651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975292
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14115	NC_016844	TCA	2	6	723711	723716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975292
14116	NC_016844	TGT	2	6	723821	723826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975292
14117	NC_016844	A	6	6	723836	723841	100 %	0 %	0 %	0 %	378975292
14118	NC_016844	GT	3	6	723852	723857	0 %	50 %	50 %	0 %	378975292
14119	NC_016844	GCC	2	6	723906	723911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975292
14120	NC_016844	ACAGC	2	10	723979	723988	40 %	0 %	20 %	40 %	378975292
14121	NC_016844	TCCA	2	8	723999	724006	25 %	25 %	0 %	50 %	378975292
14122	NC_016844	CCTG	2	8	724047	724054	0 %	25 %	25 %	50 %	378975292
14123	NC_016844	CT	3	6	724078	724083	0 %	50 %	0 %	50 %	378975292
14124	NC_016844	TGC	2	6	724112	724117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975292
14125	NC_016844	TCC	2	6	724155	724160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975292
14126	NC_016844	TGAT	2	8	724266	724273	25 %	50 %	25 %	0 %	378975292
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14134	NC_016844	CAC	2	6	724679	724684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975292
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14140	NC_016844	GCCA	2	8	725098	725105	25 %	0 %	25 %	50 %	378975292
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14145	NC_016844	CGAA	2	8	725341	725348	50 %	0 %	25 %	25 %	378975292
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14233	NC_016844	CGTCC	2	10	729580	729589	0 %	20 %	20 %	60 %	378975297
14234	NC_016844	GAC	2	6	729595	729600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975297
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14238	NC_016844	C	6	6	729788	729793	0 %	0 %	0 %	100 %	378975298
14239	NC_016844	ACC	2	6	729795	729800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975298
14240	NC_016844	AAG	2	6	729885	729890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975298
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14242	NC_016844	ATA	2	6	729948	729953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975298
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14246	NC_016844	CAT	2	6	730255	730260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975299
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14255	NC_016844	ATC	2	6	730732	730737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975299
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14350	NC_016844	CAAGA	2	10	735631	735640	60 %	0 %	20 %	20 %	378975301
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14357	NC_016844	TCCA	2	8	735998	736005	25 %	25 %	0 %	50 %	378975301
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14360	NC_016844	AGGG	2	8	736220	736227	25 %	0 %	75 %	0 %	378975302
14361	NC_016844	GTC	2	6	736250	736255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975302
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14491	NC_016844	GCT	2	6	742650	742655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975307
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