MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016844	TC	3	6	691106	691111	0 %	50 %	0 %	50 %	378975263
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13504	NC_016844	TGC	2	6	691270	691275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975263
13505	NC_016844	CGC	2	6	691284	691289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975263
13506	NC_016844	AC	3	6	691303	691308	50 %	0 %	0 %	50 %	378975263
13507	NC_016844	GA	3	6	691314	691319	50 %	0 %	50 %	0 %	378975263
13508	NC_016844	GAG	2	6	691329	691334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975263
13509	NC_016844	CT	3	6	691367	691372	0 %	50 %	0 %	50 %	378975263
13510	NC_016844	CG	3	6	691397	691402	0 %	0 %	50 %	50 %	378975263
13511	NC_016844	GC	3	6	691440	691445	0 %	0 %	50 %	50 %	378975263
13512	NC_016844	GGA	2	6	691512	691517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975263
13513	NC_016844	GC	3	6	691522	691527	0 %	0 %	50 %	50 %	378975263
13514	NC_016844	GGT	2	6	691571	691576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975263
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13518	NC_016844	AAG	2	6	691663	691668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975263
13519	NC_016844	GCG	2	6	691679	691684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975263
13520	NC_016844	GCG	2	6	691730	691735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975263
13521	NC_016844	TGA	2	6	692009	692014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975263
13522	NC_016844	TGC	2	6	692169	692174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975264
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13525	NC_016844	CTGC	2	8	692336	692343	0 %	25 %	25 %	50 %	378975264
13526	NC_016844	TCGT	2	8	692346	692353	0 %	50 %	25 %	25 %	378975264
13527	NC_016844	CGG	2	6	692418	692423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975264
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13529	NC_016844	GCG	2	6	692570	692575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975264
13530	NC_016844	CTG	2	6	692582	692587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975264
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13535	NC_016844	GCG	2	6	692806	692811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975264
13536	NC_016844	GC	3	6	692840	692845	0 %	0 %	50 %	50 %	378975264
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13540	NC_016844	AG	3	6	693126	693131	50 %	0 %	50 %	0 %	378975264
13541	NC_016844	CAG	2	6	693370	693375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975265
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13544	NC_016844	TGGC	2	8	693495	693502	0 %	25 %	50 %	25 %	378975265
13545	NC_016844	CG	5	10	693525	693534	0 %	0 %	50 %	50 %	378975265
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13553	NC_016844	TAC	2	6	693837	693842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975265
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13556	NC_016844	GAG	2	6	693953	693958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975265
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13559	NC_016844	TGG	2	6	694146	694151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975265
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13561	NC_016844	CTA	2	6	694378	694383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975266
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13570	NC_016844	TTGT	2	8	694920	694927	0 %	75 %	25 %	0 %	378975266
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13593	NC_016844	AGC	2	6	695994	695999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975266
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13595	NC_016844	CG	3	6	696083	696088	0 %	0 %	50 %	50 %	378975266
13596	NC_016844	A	7	7	696181	696187	100 %	0 %	0 %	0 %	378975266
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13603	NC_016844	GCGT	2	8	696732	696739	0 %	25 %	50 %	25 %	378975266
13604	NC_016844	TGCG	2	8	696831	696838	0 %	25 %	50 %	25 %	378975267
13605	NC_016844	AGC	2	6	696892	696897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975267
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13607	NC_016844	ACA	2	6	696926	696931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975267
13608	NC_016844	CG	5	10	696936	696945	0 %	0 %	50 %	50 %	378975267
13609	NC_016844	AGC	2	6	697023	697028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975267
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13613	NC_016844	AC	3	6	697079	697084	50 %	0 %	0 %	50 %	378975267
13614	NC_016844	AG	3	6	697209	697214	50 %	0 %	50 %	0 %	378975267
13615	NC_016844	TCCA	2	8	697221	697228	25 %	25 %	0 %	50 %	378975267
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13987	NC_016844	CGA	2	6	717112	717117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975284
13988	NC_016844	CG	3	6	717138	717143	0 %	0 %	50 %	50 %	378975284
13989	NC_016844	CAG	2	6	717219	717224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975284
13990	NC_016844	CTT	2	6	717232	717237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975284
13991	NC_016844	TCA	2	6	717269	717274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975284
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13999	NC_016844	AGCG	2	8	717524	717531	25 %	0 %	50 %	25 %	378975284
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