MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_016844	CT	3	6	641252	641257	0 %	50 %	0 %	50 %	378975222
12503	NC_016844	CAC	2	6	641265	641270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975222
12504	NC_016844	AGA	2	6	641278	641283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975222
12505	NC_016844	TG	3	6	641295	641300	0 %	50 %	50 %	0 %	378975222
12506	NC_016844	GCACAC	2	12	641302	641313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975222
12507	NC_016844	TG	3	6	641365	641370	0 %	50 %	50 %	0 %	378975222
12508	NC_016844	GTG	2	6	641378	641383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
12509	NC_016844	CCG	2	6	641466	641471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975222
12510	NC_016844	GCA	2	6	641494	641499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975222
12511	NC_016844	TG	3	6	641584	641589	0 %	50 %	50 %	0 %	378975223
12512	NC_016844	GTCT	2	8	641678	641685	0 %	50 %	25 %	25 %	378975223
12513	NC_016844	GC	3	6	641739	641744	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
12514	NC_016844	TCC	2	6	641811	641816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975223
12515	NC_016844	AGC	2	6	641901	641906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975223
12516	NC_016844	TCT	2	6	641976	641981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975223
12517	NC_016844	TG	3	6	641984	641989	0 %	50 %	50 %	0 %	378975223
12518	NC_016844	GCG	2	6	642023	642028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975223
12519	NC_016844	A	8	8	642038	642045	100 %	0 %	0 %	0 %	378975223
12520	NC_016844	GTT	2	6	642083	642088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975223
12521	NC_016844	CCA	2	6	642091	642096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975223
12522	NC_016844	AAG	2	6	642101	642106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975223
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12525	NC_016844	T	6	6	642173	642178	0 %	100 %	0 %	0 %	378975223
12526	NC_016844	AAC	2	6	642186	642191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975223
12527	NC_016844	A	6	6	642196	642201	100 %	0 %	0 %	0 %	378975223
12528	NC_016844	GC	3	6	642285	642290	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
12529	NC_016844	GCC	2	6	642293	642298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975223
12530	NC_016844	CTT	2	6	642338	642343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975223
12531	NC_016844	CG	3	6	642483	642488	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
12532	NC_016844	CCT	2	6	642493	642498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975223
12533	NC_016844	GCA	2	6	642690	642695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975224
12534	NC_016844	CAAC	2	8	642715	642722	50 %	0 %	0 %	50 %	378975224
12535	NC_016844	AGCCAT	2	12	642746	642757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975224
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12537	NC_016844	ATC	2	6	642961	642966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975225
12538	NC_016844	ATA	2	6	642973	642978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975225
12539	NC_016844	TGC	2	6	642988	642993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975225
12540	NC_016844	AGC	2	6	643075	643080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975225
12541	NC_016844	GAT	2	6	643090	643095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
12542	NC_016844	TTCC	2	8	643103	643110	0 %	50 %	0 %	50 %	378975225
12543	NC_016844	TAG	2	6	643155	643160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
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12547	NC_016844	TGA	2	6	643284	643289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
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12549	NC_016844	CTA	2	6	643377	643382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975225
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12552	NC_016844	TCG	2	6	643512	643517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975225
12553	NC_016844	GA	3	6	643532	643537	50 %	0 %	50 %	0 %	378975225
12554	NC_016844	AAAG	2	8	643553	643560	75 %	0 %	25 %	0 %	378975225
12555	NC_016844	CTCG	2	8	643561	643568	0 %	25 %	25 %	50 %	378975225
12556	NC_016844	AAG	3	9	643596	643604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975225
12557	NC_016844	CGG	2	6	643630	643635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975225
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12561	NC_016844	TCG	2	6	644682	644687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975226
12562	NC_016844	CTT	2	6	644704	644709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975226
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12565	NC_016844	CAT	2	6	644949	644954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975226
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12570	NC_016844	CG	4	8	645129	645136	0 %	0 %	50 %	50 %	378975226
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12573	NC_016844	A	6	6	645429	645434	100 %	0 %	0 %	0 %	378975226
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12581	NC_016844	GCAC	2	8	645742	645749	25 %	0 %	25 %	50 %	378975226
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12592	NC_016844	CT	3	6	646191	646196	0 %	50 %	0 %	50 %	378975227
12593	NC_016844	CA	3	6	646206	646211	50 %	0 %	0 %	50 %	378975227
12594	NC_016844	CTT	2	6	646263	646268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975227
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12602	NC_016844	GAG	2	6	646761	646766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975227
12603	NC_016844	ACG	2	6	646768	646773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975227
12604	NC_016844	TTA	2	6	646816	646821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975227
12605	NC_016844	CGA	2	6	646823	646828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975227
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12608	NC_016844	CCCT	2	8	646857	646864	0 %	25 %	0 %	75 %	378975227
12609	NC_016844	CACC	2	8	646925	646932	25 %	0 %	0 %	75 %	378975227
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12611	NC_016844	TGA	2	6	646985	646990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975227
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12613	NC_016844	AGC	2	6	647107	647112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975227
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12617	NC_016844	GAG	2	6	647367	647372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975227
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12620	NC_016844	TCT	2	6	647500	647505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975227
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