MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016844	GC	3	6	569108	569113	0 %	0 %	50 %	50 %	378975157
11002	NC_016844	TCC	2	6	569114	569119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975157
11003	NC_016844	CGGC	2	8	569181	569188	0 %	0 %	50 %	50 %	378975157
11004	NC_016844	CGT	2	6	569196	569201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975157
11005	NC_016844	TTC	2	6	569216	569221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157
11006	NC_016844	TGC	2	6	569460	569465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975158
11007	NC_016844	GC	3	6	569470	569475	0 %	0 %	50 %	50 %	378975158
11008	NC_016844	CTCA	2	8	569509	569516	25 %	25 %	0 %	50 %	378975158
11009	NC_016844	TCAGTA	2	12	569571	569582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975158
11010	NC_016844	AG	3	6	569662	569667	50 %	0 %	50 %	0 %	378975158
11011	NC_016844	CCA	2	6	569738	569743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975158
11012	NC_016844	CA	3	6	569762	569767	50 %	0 %	0 %	50 %	378975158
11013	NC_016844	CAAG	2	8	569859	569866	50 %	0 %	25 %	25 %	378975158
11014	NC_016844	GA	3	6	569867	569872	50 %	0 %	50 %	0 %	378975158
11015	NC_016844	GAAT	2	8	569895	569902	50 %	25 %	25 %	0 %	378975158
11016	NC_016844	CAC	2	6	570004	570009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975159
11017	NC_016844	T	6	6	570025	570030	0 %	100 %	0 %	0 %	378975159
11018	NC_016844	GC	3	6	570125	570130	0 %	0 %	50 %	50 %	378975160
11019	NC_016844	TTG	2	6	570149	570154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975160
11020	NC_016844	TTC	2	6	570200	570205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975160
11021	NC_016844	GGT	2	6	570226	570231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975160
11022	NC_016844	CT	3	6	570268	570273	0 %	50 %	0 %	50 %	378975160
11023	NC_016844	CA	3	6	570349	570354	50 %	0 %	0 %	50 %	378975160
11024	NC_016844	CTC	2	6	570421	570426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975160
11025	NC_016844	CAT	3	9	570438	570446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975160
11026	NC_016844	ATTTT	2	10	570482	570491	20 %	80 %	0 %	0 %	378975160
11027	NC_016844	TCA	2	6	570599	570604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975160
11028	NC_016844	TCC	2	6	570645	570650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975160
11029	NC_016844	GCC	2	6	570688	570693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975160
11030	NC_016844	CTTT	2	8	570834	570841	0 %	75 %	0 %	25 %	378975160
11031	NC_016844	AGA	2	6	570867	570872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11032	NC_016844	CG	3	6	570892	570897	0 %	0 %	50 %	50 %	378975160
11033	NC_016844	GTC	2	6	570916	570921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975160
11034	NC_016844	CATC	2	8	570944	570951	25 %	25 %	0 %	50 %	378975160
11035	NC_016844	GCG	2	6	571071	571076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975160
11036	NC_016844	GCAG	2	8	571084	571091	25 %	0 %	50 %	25 %	378975160
11037	NC_016844	CG	3	6	571124	571129	0 %	0 %	50 %	50 %	378975160
11038	NC_016844	AGC	2	6	571139	571144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975160
11039	NC_016844	GAA	2	6	571162	571167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11040	NC_016844	TCC	2	6	571251	571256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975160
11041	NC_016844	TAT	2	6	571269	571274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975160
11042	NC_016844	AGA	2	6	571281	571286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11043	NC_016844	AGA	2	6	571311	571316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11044	NC_016844	ATG	2	6	571345	571350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975160
11045	NC_016844	GAT	2	6	571383	571388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975160
11046	NC_016844	GCG	2	6	571401	571406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975160
11047	NC_016844	GCG	2	6	571441	571446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975160
11048	NC_016844	TCTG	2	8	571449	571456	0 %	50 %	25 %	25 %	378975160
11049	NC_016844	GAA	2	6	571489	571494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11050	NC_016844	A	6	6	571493	571498	100 %	0 %	0 %	0 %	378975160
11051	NC_016844	A	6	6	571500	571505	100 %	0 %	0 %	0 %	378975160
11052	NC_016844	T	6	6	571548	571553	0 %	100 %	0 %	0 %	378975160
11053	NC_016844	CG	3	6	571564	571569	0 %	0 %	50 %	50 %	378975160
11054	NC_016844	AACA	2	8	571585	571592	75 %	0 %	0 %	25 %	378975160
11055	NC_016844	AGC	2	6	571655	571660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975160
11056	NC_016844	CGGG	2	8	571700	571707	0 %	0 %	75 %	25 %	378975160
11057	NC_016844	GAA	2	6	571714	571719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11058	NC_016844	GTGC	2	8	571758	571765	0 %	25 %	50 %	25 %	378975160
11059	NC_016844	TCGC	2	8	571785	571792	0 %	25 %	25 %	50 %	378975160
11060	NC_016844	TG	3	6	571828	571833	0 %	50 %	50 %	0 %	378975160
11061	NC_016844	GTAT	2	8	571886	571893	25 %	50 %	25 %	0 %	378975160
11062	NC_016844	A	7	7	571918	571924	100 %	0 %	0 %	0 %	378975160
11063	NC_016844	GCACG	2	10	571977	571986	20 %	0 %	40 %	40 %	378975160
11064	NC_016844	CG	3	6	571994	571999	0 %	0 %	50 %	50 %	378975160
11065	NC_016844	GAA	2	6	572010	572015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11066	NC_016844	AGA	2	6	572044	572049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975160
11067	NC_016844	GGT	2	6	572133	572138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975161
11068	NC_016844	GC	3	6	572151	572156	0 %	0 %	50 %	50 %	378975161
11069	NC_016844	CTC	2	6	572196	572201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975161
11070	NC_016844	TGCT	2	8	572251	572258	0 %	50 %	25 %	25 %	378975161
11071	NC_016844	TCC	2	6	572365	572370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975161
11072	NC_016844	GCA	2	6	572404	572409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975161
11073	NC_016844	CCT	2	6	572477	572482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975161
11074	NC_016844	GCA	2	6	572521	572526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975161
11075	NC_016844	ATC	2	6	572529	572534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975161
11076	NC_016844	AAG	2	6	572547	572552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975161
11077	NC_016844	AGA	2	6	572608	572613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975161
11078	NC_016844	AG	3	6	572627	572632	50 %	0 %	50 %	0 %	378975161
11079	NC_016844	CAAG	2	8	572669	572676	50 %	0 %	25 %	25 %	378975161
11080	NC_016844	TGG	2	6	572732	572737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975161
11081	NC_016844	CCT	2	6	572877	572882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975162
11082	NC_016844	TCAC	2	8	572903	572910	25 %	25 %	0 %	50 %	378975162
11083	NC_016844	CGATA	2	10	572955	572964	40 %	20 %	20 %	20 %	378975162
11084	NC_016844	CTGA	2	8	573016	573023	25 %	25 %	25 %	25 %	378975162
11085	NC_016844	GGTCA	2	10	573334	573343	20 %	20 %	40 %	20 %	378975162
11086	NC_016844	TCG	2	6	573362	573367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975162
11087	NC_016844	GGA	2	6	573406	573411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975162
11088	NC_016844	CTGC	2	8	573422	573429	0 %	25 %	25 %	50 %	378975162
11089	NC_016844	GC	3	6	573428	573433	0 %	0 %	50 %	50 %	378975162
11090	NC_016844	GTG	2	6	573503	573508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975162
11091	NC_016844	AGT	2	6	573531	573536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975162
11092	NC_016844	GTG	2	6	573615	573620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975162
11093	NC_016844	ATA	2	6	573623	573628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975162
11094	NC_016844	CAC	2	6	573667	573672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975162
11095	NC_016844	TTC	2	6	573691	573696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975162
11096	NC_016844	AGA	2	6	573700	573705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975162
11097	NC_016844	A	6	6	573709	573714	100 %	0 %	0 %	0 %	378975162
11098	NC_016844	ATACCC	2	12	573734	573745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975162
11099	NC_016844	GCT	2	6	573806	573811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975162
11100	NC_016844	AGA	2	6	573840	573845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975162
11101	NC_016844	TGAA	2	8	573905	573912	50 %	25 %	25 %	0 %	378975162
11102	NC_016844	CG	4	8	573927	573934	0 %	0 %	50 %	50 %	378975162
11103	NC_016844	GATAG	2	10	573943	573952	40 %	20 %	40 %	0 %	378975162
11104	NC_016844	AG	3	6	573976	573981	50 %	0 %	50 %	0 %	378975162
11105	NC_016844	AGGC	2	8	574082	574089	25 %	0 %	50 %	25 %	378975162
11106	NC_016844	ACA	2	6	574135	574140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975162
11107	NC_016844	CCA	2	6	574239	574244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975162
11108	NC_016844	GGA	2	6	574261	574266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975162
11109	NC_016844	C	7	7	574304	574310	0 %	0 %	0 %	100 %	378975163
11110	NC_016844	TG	3	6	574312	574317	0 %	50 %	50 %	0 %	378975163
11111	NC_016844	CG	3	6	574318	574323	0 %	0 %	50 %	50 %	378975163
11112	NC_016844	GCA	2	6	574324	574329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975163
11113	NC_016844	CA	4	8	574328	574335	50 %	0 %	0 %	50 %	378975163
11114	NC_016844	CGTA	2	8	574403	574410	25 %	25 %	25 %	25 %	378975163
11115	NC_016844	TACG	2	8	574418	574425	25 %	25 %	25 %	25 %	378975163
11116	NC_016844	GCA	3	9	574478	574486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975163
11117	NC_016844	CTG	2	6	574578	574583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975163
11118	NC_016844	CA	3	6	574607	574612	50 %	0 %	0 %	50 %	378975163
11119	NC_016844	TCT	2	6	574630	574635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975163
11120	NC_016844	GCG	2	6	574711	574716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975163
11121	NC_016844	GC	3	6	574729	574734	0 %	0 %	50 %	50 %	378975163
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11123	NC_016844	CCA	2	6	574749	574754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975163
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