MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016844	GGT	2	6	543112	543117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975140
10503	NC_016844	CG	4	8	543121	543128	0 %	0 %	50 %	50 %	378975140
10504	NC_016844	TTG	2	6	543156	543161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975140
10505	NC_016844	GCG	2	6	543263	543268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975140
10506	NC_016844	GGA	2	6	543289	543294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975140
10507	NC_016844	ACG	2	6	543405	543410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975140
10508	NC_016844	TTCC	2	8	543414	543421	0 %	50 %	0 %	50 %	378975140
10509	NC_016844	AGA	2	6	543478	543483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975140
10510	NC_016844	TC	3	6	543489	543494	0 %	50 %	0 %	50 %	378975140
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10512	NC_016844	GGA	2	6	543661	543666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975140
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10514	NC_016844	AGC	2	6	543792	543797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975140
10515	NC_016844	TGA	3	9	543814	543822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975140
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10519	NC_016844	AGC	2	6	544116	544121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975140
10520	NC_016844	TTG	2	6	544128	544133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975140
10521	NC_016844	CTT	2	6	544139	544144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975140
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10528	NC_016844	TG	3	6	544322	544327	0 %	50 %	50 %	0 %	378975140
10529	NC_016844	TGAC	2	8	544353	544360	25 %	25 %	25 %	25 %	378975140
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10534	NC_016844	TTG	2	6	544464	544469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975141
10535	NC_016844	TAT	2	6	544478	544483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975141
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10537	NC_016844	TACGA	2	10	544626	544635	40 %	20 %	20 %	20 %	378975141
10538	NC_016844	GCA	2	6	544637	544642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975141
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10542	NC_016844	TGA	2	6	544753	544758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975141
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10544	NC_016844	TG	3	6	544799	544804	0 %	50 %	50 %	0 %	378975141
10545	NC_016844	GGA	2	6	544892	544897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975141
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10551	NC_016844	ATTG	2	8	545295	545302	25 %	50 %	25 %	0 %	378975142
10552	NC_016844	TGC	2	6	545315	545320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975142
10553	NC_016844	CTA	2	6	545405	545410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975142
10554	NC_016844	TTA	2	6	545455	545460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975142
10555	NC_016844	TGA	2	6	545520	545525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975142
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10557	NC_016844	AAT	2	6	545610	545615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975142
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10559	NC_016844	TGG	2	6	545712	545717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975142
10560	NC_016844	CGTT	2	8	545720	545727	0 %	50 %	25 %	25 %	378975142
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10564	NC_016844	TGA	2	6	546015	546020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975142
10565	NC_016844	CAG	2	6	546043	546048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975142
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10570	NC_016844	CG	4	8	546486	546493	0 %	0 %	50 %	50 %	378975143
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10593	NC_016844	AC	3	6	548391	548396	50 %	0 %	0 %	50 %	378975144
10594	NC_016844	ACC	2	6	548564	548569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975144
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10598	NC_016844	TGT	2	6	548739	548744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975144
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10601	NC_016844	GC	3	6	548879	548884	0 %	0 %	50 %	50 %	378975144
10602	NC_016844	TAG	2	6	548886	548891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975144
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10605	NC_016844	GTG	2	6	549052	549057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975145
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10611	NC_016844	TCTG	2	8	549246	549253	0 %	50 %	25 %	25 %	378975145
10612	NC_016844	GTG	2	6	549320	549325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975145
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10989	NC_016844	TCC	2	6	568394	568399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975157
10990	NC_016844	GCGT	2	8	568428	568435	0 %	25 %	50 %	25 %	378975157
10991	NC_016844	TGC	2	6	568436	568441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975157
10992	NC_016844	TCT	2	6	568442	568447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157
10993	NC_016844	TCT	2	6	568526	568531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157
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11000	NC_016844	TGC	2	6	569050	569055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975157

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