MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016844	TTC	2	6	517491	517496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975118
10003	NC_016844	AAG	2	6	517536	517541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975118
10004	NC_016844	AGC	2	6	517593	517598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975119
10005	NC_016844	G	6	6	517638	517643	0 %	0 %	100 %	0 %	378975119
10006	NC_016844	CGC	2	6	517829	517834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975119
10007	NC_016844	CCA	2	6	518006	518011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975119
10008	NC_016844	CGC	2	6	518012	518017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975119
10009	NC_016844	CTA	2	6	518069	518074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975119
10010	NC_016844	A	7	7	518128	518134	100 %	0 %	0 %	0 %	378975119
10011	NC_016844	CTT	2	6	518222	518227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975119
10012	NC_016844	GAG	2	6	518280	518285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975119
10013	NC_016844	AGG	2	6	518320	518325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975119
10014	NC_016844	GCGT	2	8	518344	518351	0 %	25 %	50 %	25 %	378975119
10015	NC_016844	CGA	2	6	518357	518362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975119
10016	NC_016844	CAAG	2	8	518405	518412	50 %	0 %	25 %	25 %	378975119
10017	NC_016844	GAG	2	6	518421	518426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975119
10018	NC_016844	TTG	2	6	518557	518562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975119
10019	NC_016844	TTTG	2	8	518582	518589	0 %	75 %	25 %	0 %	378975119
10020	NC_016844	GA	3	6	518658	518663	50 %	0 %	50 %	0 %	378975119
10021	NC_016844	GGT	2	6	518672	518677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975119
10022	NC_016844	GGA	2	6	518718	518723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975119
10023	NC_016844	CGA	2	6	518810	518815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975119
10024	NC_016844	GCG	2	6	518845	518850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975119
10025	NC_016844	CGA	2	6	518911	518916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975119
10026	NC_016844	GAA	2	6	518946	518951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975119
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10028	NC_016844	A	8	8	519014	519021	100 %	0 %	0 %	0 %	378975119
10029	NC_016844	GC	4	8	519051	519058	0 %	0 %	50 %	50 %	378975119
10030	NC_016844	GCA	2	6	519130	519135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975119
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10033	NC_016844	TGG	2	6	519224	519229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975119
10034	NC_016844	CAC	3	9	519234	519242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975119
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10040	NC_016844	TTTG	2	8	519372	519379	0 %	75 %	25 %	0 %	378975120
10041	NC_016844	CG	3	6	519391	519396	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120
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10045	NC_016844	TAG	2	6	519510	519515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975120
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10052	NC_016844	TCA	2	6	519847	519852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975120
10053	NC_016844	CTG	2	6	519908	519913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
10054	NC_016844	GCT	2	6	519919	519924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
10055	NC_016844	GC	3	6	519932	519937	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120
10056	NC_016844	CG	3	6	519942	519947	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120
10057	NC_016844	GCC	2	6	519987	519992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975120
10058	NC_016844	CTG	2	6	520004	520009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
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10063	NC_016844	CTG	2	6	520175	520180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
10064	NC_016844	CTG	2	6	520184	520189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
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10091	NC_016844	T	6	6	521569	521574	0 %	100 %	0 %	0 %	378975121
10092	NC_016844	GAAGA	2	10	521587	521596	60 %	0 %	40 %	0 %	378975121
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10106	NC_016844	T	8	8	522261	522268	0 %	100 %	0 %	0 %	378975121
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10116	NC_016844	C	6	6	522474	522479	0 %	0 %	0 %	100 %	378975121
10117	NC_016844	CGC	2	6	522483	522488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975121
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10119	NC_016844	GCA	2	6	522517	522522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975121
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10121	NC_016844	AGG	2	6	522779	522784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975121
10122	NC_016844	GCG	2	6	522805	522810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975121
10123	NC_016844	TGCG	2	8	522815	522822	0 %	25 %	50 %	25 %	378975121
10124	NC_016844	GAGG	2	8	522923	522930	25 %	0 %	75 %	0 %	378975121
10125	NC_016844	GT	3	6	522931	522936	0 %	50 %	50 %	0 %	378975121
10126	NC_016844	GCG	2	6	523008	523013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975121
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10230	NC_016844	TGT	2	6	528966	528971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975126
10231	NC_016844	TAG	2	6	528999	529004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975126
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10237	NC_016844	CGA	2	6	529567	529572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975126
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10240	NC_016844	GGC	2	6	529701	529706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975126
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10362	NC_016844	GTA	2	6	535830	535835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975133
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10482	NC_016844	AGC	2	6	541717	541722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975138
10483	NC_016844	GA	3	6	541749	541754	50 %	0 %	50 %	0 %	378975138
10484	NC_016844	AC	3	6	541807	541812	50 %	0 %	0 %	50 %	378975138
10485	NC_016844	CAG	2	6	541826	541831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975138
10486	NC_016844	TCACCG	2	12	541861	541872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975138
10487	NC_016844	A	6	6	541962	541967	100 %	0 %	0 %	0 %	378975138
10488	NC_016844	GGT	2	6	541989	541994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975138
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10491	NC_016844	ATC	2	6	542149	542154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975138
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