MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_016844	GCT	2	6	398168	398173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975009
7503	NC_016844	GT	3	6	398189	398194	0 %	50 %	50 %	0 %	378975009
7504	NC_016844	GTG	2	6	398215	398220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975009
7505	NC_016844	TGC	2	6	398378	398383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975009
7506	NC_016844	GTT	2	6	398404	398409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975009
7507	NC_016844	TCGG	2	8	398462	398469	0 %	25 %	50 %	25 %	378975009
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7511	NC_016844	CGTT	2	8	398522	398529	0 %	50 %	25 %	25 %	378975009
7512	NC_016844	T	6	6	398644	398649	0 %	100 %	0 %	0 %	378975009
7513	NC_016844	CCT	2	6	398706	398711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975009
7514	NC_016844	GAGT	2	8	398728	398735	25 %	25 %	50 %	0 %	378975009
7515	NC_016844	TGCG	2	8	398771	398778	0 %	25 %	50 %	25 %	378975009
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7517	NC_016844	TTTTC	2	10	398853	398862	0 %	80 %	0 %	20 %	378975009
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7521	NC_016844	TGCG	2	8	399004	399011	0 %	25 %	50 %	25 %	378975009
7522	NC_016844	GCA	2	6	399021	399026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975009
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7527	NC_016844	CTT	2	6	399311	399316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975010
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7530	NC_016844	CCGTG	2	10	399360	399369	0 %	20 %	40 %	40 %	378975010
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7535	NC_016844	GCA	2	6	399447	399452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975010
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7544	NC_016844	GCAGGA	2	12	399699	399710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975010
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7550	NC_016844	CG	3	6	399885	399890	0 %	0 %	50 %	50 %	378975010
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7554	NC_016844	GTG	2	6	400066	400071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975010
7555	NC_016844	CTG	2	6	400087	400092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975010
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7559	NC_016844	T	6	6	400216	400221	0 %	100 %	0 %	0 %	378975010
7560	NC_016844	CGTG	2	8	400310	400317	0 %	25 %	50 %	25 %	378975010
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7602	NC_016844	GC	3	6	402324	402329	0 %	0 %	50 %	50 %	378975013
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7604	NC_016844	CGT	2	6	402412	402417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975013
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7607	NC_016844	T	7	7	402521	402527	0 %	100 %	0 %	0 %	378975013
7608	NC_016844	GCTC	2	8	402568	402575	0 %	25 %	25 %	50 %	378975013
7609	NC_016844	TGCGC	2	10	402592	402601	0 %	20 %	40 %	40 %	378975013
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7611	NC_016844	CG	3	6	402688	402693	0 %	0 %	50 %	50 %	378975013
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7615	NC_016844	TCTG	2	8	402846	402853	0 %	50 %	25 %	25 %	378975013
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7617	NC_016844	CAAG	2	8	403012	403019	50 %	0 %	25 %	25 %	378975013
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7619	NC_016844	GAG	2	6	403070	403075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975014
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7621	NC_016844	AC	3	6	403169	403174	50 %	0 %	0 %	50 %	378975014
7622	NC_016844	GC	4	8	403267	403274	0 %	0 %	50 %	50 %	378975014
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7624	NC_016844	TCA	2	6	403302	403307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975014
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7626	NC_016844	A	6	6	403367	403372	100 %	0 %	0 %	0 %	378975014
7627	NC_016844	AAC	2	6	403374	403379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975014
7628	NC_016844	GTG	2	6	403399	403404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975014
7629	NC_016844	GCACA	2	10	403406	403415	40 %	0 %	20 %	40 %	378975014
7630	NC_016844	AGC	2	6	403446	403451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975014
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7632	NC_016844	TCTT	2	8	403512	403519	0 %	75 %	0 %	25 %	378975014
7633	NC_016844	GAA	2	6	403520	403525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975014
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7638	NC_016844	GCT	2	6	403797	403802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975015
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7641	NC_016844	T	6	6	403984	403989	0 %	100 %	0 %	0 %	378975015
7642	NC_016844	ATCG	2	8	403990	403997	25 %	25 %	25 %	25 %	378975015
7643	NC_016844	T	6	6	404072	404077	0 %	100 %	0 %	0 %	378975015
7644	NC_016844	CCAG	2	8	404125	404132	25 %	0 %	25 %	50 %	378975015
7645	NC_016844	TTG	2	6	404179	404184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975015
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