MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016843	AGA	2	6	131138	131143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973683
2502	NC_016843	ACC	2	6	131179	131184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973683
2503	NC_016843	GGA	2	6	131192	131197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973683
2504	NC_016843	GGC	2	6	131241	131246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973683
2505	NC_016843	TGT	2	6	131316	131321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973683
2506	NC_016843	GGC	2	6	131469	131474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973683
2507	NC_016843	TTGTCG	2	12	131501	131512	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378973683
2508	NC_016843	AAG	2	6	131626	131631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973683
2509	NC_016843	GAG	2	6	131689	131694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973683
2510	NC_016843	CGC	2	6	131727	131732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973683
2511	NC_016843	CGT	2	6	132012	132017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973684
2512	NC_016843	TCCA	2	8	132084	132091	25 %	25 %	0 %	50 %	378973684
2513	NC_016843	CGT	2	6	132132	132137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973684
2514	NC_016843	CCG	2	6	132176	132181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973684
2515	NC_016843	CGCGC	2	10	132202	132211	0 %	0 %	40 %	60 %	378973684
2516	NC_016843	CCT	2	6	132231	132236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973684
2517	NC_016843	AAC	2	6	132304	132309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973684
2518	NC_016843	CG	3	6	132313	132318	0 %	0 %	50 %	50 %	378973684
2519	NC_016843	ATC	2	6	132335	132340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973684
2520	NC_016843	GCA	2	6	132410	132415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973684
2521	NC_016843	CA	3	6	132532	132537	50 %	0 %	0 %	50 %	378973684
2522	NC_016843	CAC	2	6	132666	132671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973684
2523	NC_016843	CCA	2	6	132686	132691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973684
2524	NC_016843	CTT	2	6	132884	132889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973685
2525	NC_016843	CGTG	2	8	132930	132937	0 %	25 %	50 %	25 %	378973685
2526	NC_016843	TCA	2	6	133043	133048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973685
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2529	NC_016843	T	6	6	133095	133100	0 %	100 %	0 %	0 %	378973685
2530	NC_016843	TAC	2	6	133132	133137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973685
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2532	NC_016843	CGT	2	6	133255	133260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973685
2533	NC_016843	TCTTGA	2	12	133356	133367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973685
2534	NC_016843	ACG	2	6	133409	133414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973685
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2539	NC_016843	GA	3	6	133748	133753	50 %	0 %	50 %	0 %	378973685
2540	NC_016843	ATT	2	6	133778	133783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973685
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2542	NC_016843	CTT	2	6	133828	133833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973685
2543	NC_016843	ATT	2	6	133835	133840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973685
2544	NC_016843	TGA	2	6	133866	133871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973685
2545	NC_016843	CA	3	6	134058	134063	50 %	0 %	0 %	50 %	378973685
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2549	NC_016843	A	8	8	134217	134224	100 %	0 %	0 %	0 %	378973685
2550	NC_016843	ATT	2	6	134243	134248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973685
2551	NC_016843	TGCG	2	8	134327	134334	0 %	25 %	50 %	25 %	378973685
2552	NC_016843	TTA	2	6	134365	134370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973685
2553	NC_016843	CATT	2	8	134399	134406	25 %	50 %	0 %	25 %	378973685
2554	NC_016843	T	6	6	134433	134438	0 %	100 %	0 %	0 %	378973685
2555	NC_016843	CGA	3	9	134444	134452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973685
2556	NC_016843	ATT	2	6	134464	134469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973685
2557	NC_016843	AGC	2	6	134475	134480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973685
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2561	NC_016843	GCAGAC	2	12	134707	134718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973685
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2563	NC_016843	TGC	2	6	134730	134735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973685
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2565	NC_016843	TTCA	2	8	135074	135081	25 %	50 %	0 %	25 %	378973686
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2573	NC_016843	GC	3	6	135637	135642	0 %	0 %	50 %	50 %	378973686
2574	NC_016843	AGC	2	6	135695	135700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973686
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2584	NC_016843	AGGA	2	8	136128	136135	50 %	0 %	50 %	0 %	378973686
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2587	NC_016843	GGAA	2	8	136351	136358	50 %	0 %	50 %	0 %	378973686
2588	NC_016843	AGA	2	6	136397	136402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973686
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2593	NC_016843	GAGT	2	8	136618	136625	25 %	25 %	50 %	0 %	378973686
2594	NC_016843	AGC	2	6	136643	136648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973686
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2596	NC_016843	AC	3	6	136777	136782	50 %	0 %	0 %	50 %	378973687
2597	NC_016843	GACA	2	8	136799	136806	50 %	0 %	25 %	25 %	378973687
2598	NC_016843	AG	3	6	136817	136822	50 %	0 %	50 %	0 %	378973687
2599	NC_016843	CCT	2	6	136870	136875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973687
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2602	NC_016843	CA	3	6	137004	137009	50 %	0 %	0 %	50 %	378973687
2603	NC_016843	GCT	2	6	137011	137016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973687
2604	NC_016843	CTGA	2	8	137017	137024	25 %	25 %	25 %	25 %	378973687
2605	NC_016843	GTCTT	2	10	137134	137143	0 %	60 %	20 %	20 %	378973687
2606	NC_016843	AGG	2	6	137153	137158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973687
2607	NC_016843	TCCT	2	8	137168	137175	0 %	50 %	0 %	50 %	378973687
2608	NC_016843	AAC	2	6	137185	137190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973687
2609	NC_016843	GCA	2	6	137199	137204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973687
2610	NC_016843	GC	4	8	137210	137217	0 %	0 %	50 %	50 %	378973687
2611	NC_016843	CGC	2	6	137264	137269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973687
2612	NC_016843	CAC	2	6	137290	137295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973687
2613	NC_016843	GC	3	6	137304	137309	0 %	0 %	50 %	50 %	378973687
2614	NC_016843	GC	3	6	137312	137317	0 %	0 %	50 %	50 %	378973687
2615	NC_016843	CTT	2	6	137326	137331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973687
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2995	NC_016843	GAA	2	6	157507	157512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973711
2996	NC_016843	GA	4	8	157513	157520	50 %	0 %	50 %	0 %	378973711
2997	NC_016843	CCG	2	6	157553	157558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973711
2998	NC_016843	TG	4	8	157928	157935	0 %	50 %	50 %	0 %	378973712
2999	NC_016843	GAG	2	6	157938	157943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973712
3000	NC_016843	GGT	2	6	157983	157988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973712

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