MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_016843	ATG	2	6	936423	936428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974439
18503	NC_016843	TTC	2	6	936488	936493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974439
18504	NC_016843	ACC	2	6	936614	936619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974439
18505	NC_016843	AGC	2	6	936657	936662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974439
18506	NC_016843	ATC	2	6	936677	936682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974439
18507	NC_016843	TC	3	6	936706	936711	0 %	50 %	0 %	50 %	378974439
18508	NC_016843	GCA	2	6	936757	936762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974439
18509	NC_016843	GTGG	2	8	936793	936800	0 %	25 %	75 %	0 %	378974440
18510	NC_016843	GAG	2	6	936827	936832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974440
18511	NC_016843	CCA	2	6	936858	936863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974440
18512	NC_016843	TGC	2	6	936932	936937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974440
18513	NC_016843	CTG	2	6	936949	936954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974440
18514	NC_016843	GTA	2	6	936960	936965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974440
18515	NC_016843	TGC	2	6	936968	936973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974440
18516	NC_016843	GAA	2	6	936976	936981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974440
18517	NC_016843	GACA	2	8	937039	937046	50 %	0 %	25 %	25 %	378974440
18518	NC_016843	TGC	2	6	937050	937055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974440
18519	NC_016843	CCA	3	9	937107	937115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974440
18520	NC_016843	ATA	2	6	937336	937341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974440
18521	NC_016843	T	6	6	937410	937415	0 %	100 %	0 %	0 %	378974441
18522	NC_016843	GCG	2	6	937419	937424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18523	NC_016843	GT	4	8	937428	937435	0 %	50 %	50 %	0 %	378974441
18524	NC_016843	AGG	2	6	937455	937460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974441
18525	NC_016843	CG	3	6	937493	937498	0 %	0 %	50 %	50 %	378974441
18526	NC_016843	CCT	2	6	937515	937520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974441
18527	NC_016843	GGC	2	6	937617	937622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
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18529	NC_016843	GCG	2	6	937649	937654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18530	NC_016843	CG	3	6	937666	937671	0 %	0 %	50 %	50 %	378974441
18531	NC_016843	CGG	2	6	937758	937763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18532	NC_016843	TTG	2	6	937784	937789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974441
18533	NC_016843	CGG	2	6	937799	937804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18534	NC_016843	CTT	2	6	937815	937820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974441
18535	NC_016843	CGC	2	6	937830	937835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974441
18536	NC_016843	CCA	2	6	937844	937849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974441
18537	NC_016843	T	6	6	937870	937875	0 %	100 %	0 %	0 %	378974441
18538	NC_016843	CGGG	3	12	937923	937934	0 %	0 %	75 %	25 %	378974441
18539	NC_016843	ACC	2	6	937990	937995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974441
18540	NC_016843	G	18	18	938099	938116	0 %	0 %	100 %	0 %	378974441
18541	NC_016843	ACC	2	6	938159	938164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974441
18542	NC_016843	TCAA	2	8	938278	938285	50 %	25 %	0 %	25 %	378974441
18543	NC_016843	GCG	3	9	938324	938332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18544	NC_016843	CTTGCG	2	12	938389	938400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974441
18545	NC_016843	GCG	2	6	938494	938499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974441
18546	NC_016843	CAG	2	6	938566	938571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974441
18547	NC_016843	CG	3	6	938575	938580	0 %	0 %	50 %	50 %	378974441
18548	NC_016843	TCGTAT	2	12	938626	938637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974441
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18550	NC_016843	GCA	2	6	938814	938819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974441
18551	NC_016843	GC	3	6	938856	938861	0 %	0 %	50 %	50 %	378974441
18552	NC_016843	GCCGC	2	10	938913	938922	0 %	0 %	40 %	60 %	378974441
18553	NC_016843	A	6	6	939087	939092	100 %	0 %	0 %	0 %	378974442
18554	NC_016843	CGC	2	6	939222	939227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974442
18555	NC_016843	GC	4	8	939226	939233	0 %	0 %	50 %	50 %	378974442
18556	NC_016843	T	6	6	939258	939263	0 %	100 %	0 %	0 %	378974442
18557	NC_016843	ACC	2	6	939299	939304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974442
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18559	NC_016843	TGC	2	6	939452	939457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974442
18560	NC_016843	GCAC	2	8	939458	939465	25 %	0 %	25 %	50 %	378974442
18561	NC_016843	CG	3	6	939473	939478	0 %	0 %	50 %	50 %	378974442
18562	NC_016843	AG	3	6	939547	939552	50 %	0 %	50 %	0 %	378974442
18563	NC_016843	T	6	6	939581	939586	0 %	100 %	0 %	0 %	378974442
18564	NC_016843	AGCA	2	8	939614	939621	50 %	0 %	25 %	25 %	378974442
18565	NC_016843	GGT	2	6	939631	939636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974442
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18568	NC_016843	ACG	2	6	939842	939847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974442
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18575	NC_016843	A	6	6	940280	940285	100 %	0 %	0 %	0 %	378974442
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18585	NC_016843	CCA	2	6	940869	940874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974442
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18602	NC_016843	GCTCCT	2	12	941747	941758	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378974444
18603	NC_016843	CAG	2	6	941783	941788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974444
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18605	NC_016843	A	6	6	941852	941857	100 %	0 %	0 %	0 %	378974444
18606	NC_016843	AC	3	6	941892	941897	50 %	0 %	0 %	50 %	378974444
18607	NC_016843	CTT	2	6	941906	941911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974444
18608	NC_016843	T	6	6	941910	941915	0 %	100 %	0 %	0 %	378974444
18609	NC_016843	GCT	2	6	942086	942091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974445
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18611	NC_016843	CTG	2	6	942156	942161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974445
18612	NC_016843	GC	3	6	942182	942187	0 %	0 %	50 %	50 %	378974445
18613	NC_016843	AC	3	6	942208	942213	50 %	0 %	0 %	50 %	378974445
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18619	NC_016843	CAC	2	6	942762	942767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974445
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18988	NC_016843	TAA	2	6	961496	961501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974465
18989	NC_016843	CT	3	6	961511	961516	0 %	50 %	0 %	50 %	378974465
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18992	NC_016843	ACA	2	6	961645	961650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974465
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