MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016843	GAT	2	6	884973	884978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974392
17502	NC_016843	GTG	2	6	885080	885085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974392
17503	NC_016843	TCC	2	6	885097	885102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974392
17504	NC_016843	TCT	2	6	885161	885166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974392
17505	NC_016843	CGA	3	9	885237	885245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974392
17506	NC_016843	GC	3	6	885288	885293	0 %	0 %	50 %	50 %	378974392
17507	NC_016843	TTA	2	6	885311	885316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974392
17508	NC_016843	CGC	3	9	885348	885356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974392
17509	NC_016843	AC	3	6	885368	885373	50 %	0 %	0 %	50 %	378974392
17510	NC_016843	AAAACT	2	12	885377	885388	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378974392
17511	NC_016843	T	6	6	885415	885420	0 %	100 %	0 %	0 %	378974393
17512	NC_016843	GAGGG	2	10	885428	885437	20 %	0 %	80 %	0 %	378974393
17513	NC_016843	TC	4	8	885444	885451	0 %	50 %	0 %	50 %	378974393
17514	NC_016843	GCTG	2	8	885491	885498	0 %	25 %	50 %	25 %	378974393
17515	NC_016843	GT	3	6	885504	885509	0 %	50 %	50 %	0 %	378974393
17516	NC_016843	CGT	2	6	885607	885612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974393
17517	NC_016843	GTCTC	2	10	885625	885634	0 %	40 %	20 %	40 %	378974394
17518	NC_016843	TGA	2	6	885661	885666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974395
17519	NC_016843	AGC	2	6	885727	885732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974395
17520	NC_016843	CG	3	6	885828	885833	0 %	0 %	50 %	50 %	378974395
17521	NC_016843	CAAACA	2	12	885861	885872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974395
17522	NC_016843	GCG	2	6	885875	885880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974395
17523	NC_016843	GCA	2	6	885991	885996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974395
17524	NC_016843	TGC	2	6	886017	886022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974395
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17526	NC_016843	GC	3	6	886078	886083	0 %	0 %	50 %	50 %	378974395
17527	NC_016843	GAA	2	6	886136	886141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974395
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17529	NC_016843	AGG	2	6	886234	886239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974395
17530	NC_016843	CAAA	2	8	886259	886266	75 %	0 %	0 %	25 %	378974395
17531	NC_016843	TA	3	6	886302	886307	50 %	50 %	0 %	0 %	378974395
17532	NC_016843	GCGCG	2	10	886424	886433	0 %	0 %	60 %	40 %	378974395
17533	NC_016843	A	6	6	886570	886575	100 %	0 %	0 %	0 %	378974396
17534	NC_016843	TCG	2	6	886664	886669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974396
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17536	NC_016843	TCC	2	6	886742	886747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974396
17537	NC_016843	GC	3	6	886800	886805	0 %	0 %	50 %	50 %	378974396
17538	NC_016843	CTGA	2	8	886843	886850	25 %	25 %	25 %	25 %	378974396
17539	NC_016843	CGAT	2	8	886913	886920	25 %	25 %	25 %	25 %	378974396
17540	NC_016843	ATC	2	6	886930	886935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974396
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17542	NC_016843	AACC	2	8	887062	887069	50 %	0 %	0 %	50 %	378974396
17543	NC_016843	CA	3	6	887117	887122	50 %	0 %	0 %	50 %	378974396
17544	NC_016843	AAC	2	6	887366	887371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974397
17545	NC_016843	GTA	2	6	887397	887402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974397
17546	NC_016843	GC	3	6	887403	887408	0 %	0 %	50 %	50 %	378974397
17547	NC_016843	TTTGA	2	10	887487	887496	20 %	60 %	20 %	0 %	378974397
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17550	NC_016843	A	7	7	887706	887712	100 %	0 %	0 %	0 %	378974397
17551	NC_016843	CTT	2	6	887829	887834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974397
17552	NC_016843	ATCA	2	8	887841	887848	50 %	25 %	0 %	25 %	378974397
17553	NC_016843	CTGTG	2	10	887853	887862	0 %	40 %	40 %	20 %	378974397
17554	NC_016843	AGA	2	6	887928	887933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974397
17555	NC_016843	AC	3	6	887952	887957	50 %	0 %	0 %	50 %	378974397
17556	NC_016843	ACC	2	6	888042	888047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974397
17557	NC_016843	TCA	2	6	888049	888054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974397
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17559	NC_016843	AGC	2	6	888085	888090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974397
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17561	NC_016843	C	6	6	888204	888209	0 %	0 %	0 %	100 %	378974397
17562	NC_016843	CAC	2	6	888254	888259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974397
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17564	NC_016843	GCA	3	9	888295	888303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974397
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17567	NC_016843	AC	3	6	888553	888558	50 %	0 %	0 %	50 %	378974397
17568	NC_016843	GAT	2	6	888624	888629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974397
17569	NC_016843	CG	3	6	888632	888637	0 %	0 %	50 %	50 %	378974397
17570	NC_016843	ATGC	2	8	888643	888650	25 %	25 %	25 %	25 %	378974397
17571	NC_016843	TCAC	2	8	888655	888662	25 %	25 %	0 %	50 %	378974397
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17578	NC_016843	CTGC	2	8	889005	889012	0 %	25 %	25 %	50 %	378974399
17579	NC_016843	CTG	2	6	889035	889040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974399
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17583	NC_016843	AAT	2	6	889420	889425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974399
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17585	NC_016843	GGA	2	6	889487	889492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974399
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17593	NC_016843	CAA	2	6	889687	889692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974399
17594	NC_016843	GCC	2	6	889729	889734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974399
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17596	NC_016843	ACC	2	6	889923	889928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974400
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17598	NC_016843	CG	3	6	890049	890054	0 %	0 %	50 %	50 %	378974400
17599	NC_016843	A	6	6	890110	890115	100 %	0 %	0 %	0 %	378974400
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17603	NC_016843	AG	4	8	890360	890367	50 %	0 %	50 %	0 %	378974400
17604	NC_016843	GCT	2	6	890384	890389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974400
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17606	NC_016843	CCT	2	6	890495	890500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974400
17607	NC_016843	ACGCG	2	10	890547	890556	20 %	0 %	40 %	40 %	378974400
17608	NC_016843	TACG	2	8	890710	890717	25 %	25 %	25 %	25 %	378974401
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17611	NC_016843	ACC	2	6	890785	890790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974401
17612	NC_016843	ATT	2	6	890860	890865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974401
17613	NC_016843	CG	3	6	890909	890914	0 %	0 %	50 %	50 %	378974401
17614	NC_016843	CCT	2	6	890933	890938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974401
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17620	NC_016843	TGC	2	6	891196	891201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974401
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