MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016843	TGC	3	9	858071	858079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974369
17003	NC_016843	CAC	2	6	858097	858102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974369
17004	NC_016843	CCA	2	6	858162	858167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974369
17005	NC_016843	ACA	2	6	858176	858181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974369
17006	NC_016843	CAA	2	6	858192	858197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974369
17007	NC_016843	ACA	2	6	858198	858203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974369
17008	NC_016843	CA	4	8	858288	858295	50 %	0 %	0 %	50 %	378974369
17009	NC_016843	GAG	2	6	858319	858324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974369
17010	NC_016843	ACGCC	2	10	858360	858369	20 %	0 %	20 %	60 %	378974369
17011	NC_016843	GGT	2	6	858442	858447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974369
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17013	NC_016843	ATT	2	6	858473	858478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974369
17014	NC_016843	GAG	2	6	858536	858541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974369
17015	NC_016843	ACTA	2	8	858559	858566	50 %	25 %	0 %	25 %	378974369
17016	NC_016843	CA	3	6	858642	858647	50 %	0 %	0 %	50 %	378974369
17017	NC_016843	AAG	2	6	858701	858706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974369
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17019	NC_016843	ACAA	2	8	858731	858738	75 %	0 %	0 %	25 %	378974369
17020	NC_016843	ATT	2	6	858746	858751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974369
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17023	NC_016843	ACT	2	6	858916	858921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974369
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17026	NC_016843	AGACT	2	10	858978	858987	40 %	20 %	20 %	20 %	378974369
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17044	NC_016843	GTCC	2	8	859927	859934	0 %	25 %	25 %	50 %	378974371
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17051	NC_016843	GCCA	2	8	860237	860244	25 %	0 %	25 %	50 %	378974371
17052	NC_016843	CG	3	6	860284	860289	0 %	0 %	50 %	50 %	378974371
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17054	NC_016843	GC	3	6	860503	860508	0 %	0 %	50 %	50 %	378974371
17055	NC_016843	AGC	2	6	860581	860586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974371
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17059	NC_016843	TAT	2	6	860999	861004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974372
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17063	NC_016843	T	6	6	861097	861102	0 %	100 %	0 %	0 %	378974372
17064	NC_016843	CGC	3	9	861103	861111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974372
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17066	NC_016843	GCT	2	6	861241	861246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974372
17067	NC_016843	GA	3	6	861252	861257	50 %	0 %	50 %	0 %	378974372
17068	NC_016843	CAT	2	6	861280	861285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974372
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17071	NC_016843	CG	3	6	861345	861350	0 %	0 %	50 %	50 %	378974372
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17075	NC_016843	TAC	2	6	861677	861682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974372
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17082	NC_016843	CGG	2	6	861825	861830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974372
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17085	NC_016843	A	6	6	861896	861901	100 %	0 %	0 %	0 %	378974372
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17096	NC_016843	CA	3	6	862594	862599	50 %	0 %	0 %	50 %	378974373
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17098	NC_016843	TG	3	6	862663	862668	0 %	50 %	50 %	0 %	378974373
17099	NC_016843	GC	4	8	862677	862684	0 %	0 %	50 %	50 %	378974373
17100	NC_016843	T	6	6	862785	862790	0 %	100 %	0 %	0 %	378974373
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17104	NC_016843	A	7	7	862967	862973	100 %	0 %	0 %	0 %	378974373
17105	NC_016843	TGC	2	6	863073	863078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974373
17106	NC_016843	GCA	2	6	863193	863198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974373
17107	NC_016843	GC	3	6	863215	863220	0 %	0 %	50 %	50 %	378974373
17108	NC_016843	G	6	6	863227	863232	0 %	0 %	100 %	0 %	378974373
17109	NC_016843	TGA	3	9	863358	863366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974373
17110	NC_016843	CGCA	2	8	863527	863534	25 %	0 %	25 %	50 %	378974373
17111	NC_016843	CTCA	2	8	863615	863622	25 %	25 %	0 %	50 %	378974373
17112	NC_016843	A	6	6	863636	863641	100 %	0 %	0 %	0 %	378974373
17113	NC_016843	GCGCT	2	10	863726	863735	0 %	20 %	40 %	40 %	378974374
17114	NC_016843	CGCA	2	8	863774	863781	25 %	0 %	25 %	50 %	378974374
17115	NC_016843	CA	4	8	863787	863794	50 %	0 %	0 %	50 %	378974374
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17118	NC_016843	AC	3	6	863826	863831	50 %	0 %	0 %	50 %	378974374
17119	NC_016843	CACG	2	8	863883	863890	25 %	0 %	25 %	50 %	378974375
17120	NC_016843	GC	3	6	863912	863917	0 %	0 %	50 %	50 %	378974375
17121	NC_016843	GCATCT	2	12	864020	864031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974375
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17490	NC_016843	ACG	2	6	884474	884479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974392
17491	NC_016843	ATC	2	6	884482	884487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974392
17492	NC_016843	CGCAG	2	10	884514	884523	20 %	0 %	40 %	40 %	378974392
17493	NC_016843	GGT	2	6	884575	884580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974392
17494	NC_016843	GCAG	2	8	884667	884674	25 %	0 %	50 %	25 %	378974392
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