MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016843	ACG	2	6	757930	757935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974264
15003	NC_016843	TACA	2	8	758005	758012	50 %	25 %	0 %	25 %	378974264
15004	NC_016843	AG	3	6	758124	758129	50 %	0 %	50 %	0 %	378974264
15005	NC_016843	CTTC	2	8	758133	758140	0 %	50 %	0 %	50 %	378974264
15006	NC_016843	CAA	2	6	758141	758146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974264
15007	NC_016843	TCT	2	6	758206	758211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974264
15008	NC_016843	CGA	2	6	758242	758247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974264
15009	NC_016843	TACAA	2	10	758250	758259	60 %	20 %	0 %	20 %	378974264
15010	NC_016843	AGT	2	6	758299	758304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974264
15011	NC_016843	CCG	2	6	758344	758349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974264
15012	NC_016843	GTA	2	6	758409	758414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974264
15013	NC_016843	CA	3	6	758425	758430	50 %	0 %	0 %	50 %	378974264
15014	NC_016843	TCA	2	6	758461	758466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974264
15015	NC_016843	AAC	2	6	758510	758515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974264
15016	NC_016843	ATC	2	6	758516	758521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974264
15017	NC_016843	ACCGT	2	10	758633	758642	20 %	20 %	20 %	40 %	378974264
15018	NC_016843	CCT	2	6	758659	758664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974264
15019	NC_016843	CTC	2	6	758665	758670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974264
15020	NC_016843	TTA	2	6	758679	758684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974264
15021	NC_016843	CCT	2	6	758731	758736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974264
15022	NC_016843	TCT	2	6	758739	758744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974264
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15025	NC_016843	T	7	7	758850	758856	0 %	100 %	0 %	0 %	378974264
15026	NC_016843	A	6	6	758860	758865	100 %	0 %	0 %	0 %	378974264
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15030	NC_016843	TCC	2	6	759103	759108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974264
15031	NC_016843	GC	3	6	759156	759161	0 %	0 %	50 %	50 %	378974265
15032	NC_016843	TAAA	2	8	759171	759178	75 %	25 %	0 %	0 %	378974265
15033	NC_016843	ATTTA	2	10	759253	759262	40 %	60 %	0 %	0 %	378974265
15034	NC_016843	TC	5	10	759373	759382	0 %	50 %	0 %	50 %	378974265
15035	NC_016843	T	10	10	759402	759411	0 %	100 %	0 %	0 %	378974265
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15038	NC_016843	AT	3	6	759582	759587	50 %	50 %	0 %	0 %	378974265
15039	NC_016843	TAC	2	6	759595	759600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974265
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15041	NC_016843	CGG	3	9	759639	759647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974265
15042	NC_016843	A	6	6	759776	759781	100 %	0 %	0 %	0 %	378974266
15043	NC_016843	GCC	2	6	759816	759821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974266
15044	NC_016843	CA	4	8	759841	759848	50 %	0 %	0 %	50 %	378974266
15045	NC_016843	GCT	2	6	759865	759870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974266
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15049	NC_016843	CTG	2	6	760048	760053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974266
15050	NC_016843	TGC	2	6	760068	760073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974266
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15052	NC_016843	CAC	2	6	760092	760097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974266
15053	NC_016843	CCA	2	6	760168	760173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974266
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15056	NC_016843	AGA	2	6	760251	760256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974266
15057	NC_016843	GTTC	2	8	760372	760379	0 %	50 %	25 %	25 %	378974266
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15061	NC_016843	CCT	2	6	760555	760560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974267
15062	NC_016843	ACT	2	6	760568	760573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974267
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15070	NC_016843	CCTTA	2	10	760952	760961	20 %	40 %	0 %	40 %	378974267
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15089	NC_016843	CA	3	6	762148	762153	50 %	0 %	0 %	50 %	378974268
15090	NC_016843	C	6	6	762226	762231	0 %	0 %	0 %	100 %	378974268
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15093	NC_016843	CCTG	2	8	762420	762427	0 %	25 %	25 %	50 %	378974268
15094	NC_016843	AC	3	6	762472	762477	50 %	0 %	0 %	50 %	378974268
15095	NC_016843	CGCTG	2	10	762502	762511	0 %	20 %	40 %	40 %	378974268
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15105	NC_016843	AC	3	6	763119	763124	50 %	0 %	0 %	50 %	378974268
15106	NC_016843	CGCC	2	8	763137	763144	0 %	0 %	25 %	75 %	378974268
15107	NC_016843	GCA	2	6	763160	763165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974268
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15110	NC_016843	A	8	8	763290	763297	100 %	0 %	0 %	0 %	378974268
15111	NC_016843	GCAAA	2	10	763471	763480	60 %	0 %	20 %	20 %	378974269
15112	NC_016843	GC	3	6	763509	763514	0 %	0 %	50 %	50 %	378974269
15113	NC_016843	GCAC	2	8	763588	763595	25 %	0 %	25 %	50 %	378974269
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15118	NC_016843	C	6	6	763824	763829	0 %	0 %	0 %	100 %	378974269
15119	NC_016843	CGG	2	6	763932	763937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974269
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15491	NC_016843	GAT	2	6	783878	783883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974289
15492	NC_016843	GAT	2	6	783953	783958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974289
15493	NC_016843	TTC	2	6	784010	784015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974289
15494	NC_016843	CA	3	6	784023	784028	50 %	0 %	0 %	50 %	378974289
15495	NC_016843	CCT	2	6	784072	784077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974289
15496	NC_016843	AAT	2	6	784193	784198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974289
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15499	NC_016843	T	6	6	784405	784410	0 %	100 %	0 %	0 %	378974289
15500	NC_016843	AC	3	6	784475	784480	50 %	0 %	0 %	50 %	378974289

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