MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016843	AAT	2	6	732347	732352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974242
14503	NC_016843	TAGA	2	8	732363	732370	50 %	25 %	25 %	0 %	378974242
14504	NC_016843	GCAC	2	8	732383	732390	25 %	0 %	25 %	50 %	378974243
14505	NC_016843	TGC	2	6	732430	732435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974243
14506	NC_016843	ACGT	2	8	732481	732488	25 %	25 %	25 %	25 %	378974243
14507	NC_016843	CATG	2	8	732500	732507	25 %	25 %	25 %	25 %	378974243
14508	NC_016843	GAA	2	6	732509	732514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974243
14509	NC_016843	CCT	2	6	732529	732534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974243
14510	NC_016843	TC	3	6	732647	732652	0 %	50 %	0 %	50 %	378974243
14511	NC_016843	CCAG	2	8	732679	732686	25 %	0 %	25 %	50 %	378974243
14512	NC_016843	CCA	2	6	732779	732784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974243
14513	NC_016843	ATA	2	6	732790	732795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974243
14514	NC_016843	GC	3	6	732812	732817	0 %	0 %	50 %	50 %	378974243
14515	NC_016843	CTC	2	6	732822	732827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974243
14516	NC_016843	CACAG	2	10	732829	732838	40 %	0 %	20 %	40 %	378974243
14517	NC_016843	TATT	2	8	732952	732959	25 %	75 %	0 %	0 %	378974243
14518	NC_016843	TCA	2	6	733027	733032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974243
14519	NC_016843	ATA	2	6	733050	733055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974243
14520	NC_016843	TC	3	6	733083	733088	0 %	50 %	0 %	50 %	378974243
14521	NC_016843	TTC	2	6	733101	733106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974243
14522	NC_016843	GCTT	2	8	733161	733168	0 %	50 %	25 %	25 %	378974243
14523	NC_016843	T	6	6	733189	733194	0 %	100 %	0 %	0 %	378974243
14524	NC_016843	TCG	2	6	733216	733221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974243
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14527	NC_016843	AGG	2	6	733343	733348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974243
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14530	NC_016843	AATT	2	8	733547	733554	50 %	50 %	0 %	0 %	378974243
14531	NC_016843	CGG	2	6	733583	733588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974243
14532	NC_016843	TTA	2	6	733651	733656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974243
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14534	NC_016843	TTTC	2	8	733779	733786	0 %	75 %	0 %	25 %	378974243
14535	NC_016843	TATTT	2	10	733921	733930	20 %	80 %	0 %	0 %	378974243
14536	NC_016843	AT	3	6	733954	733959	50 %	50 %	0 %	0 %	378974243
14537	NC_016843	AATG	2	8	733965	733972	50 %	25 %	25 %	0 %	378974243
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14541	NC_016843	CGT	2	6	734176	734181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974243
14542	NC_016843	CTG	2	6	734357	734362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974243
14543	NC_016843	T	6	6	734472	734477	0 %	100 %	0 %	0 %	378974243
14544	NC_016843	ATC	2	6	734493	734498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974243
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14548	NC_016843	CGCA	2	8	734631	734638	25 %	0 %	25 %	50 %	378974243
14549	NC_016843	CTT	2	6	734651	734656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974243
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14551	NC_016843	CAA	2	6	734780	734785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974243
14552	NC_016843	CCCCG	2	10	734803	734812	0 %	0 %	20 %	80 %	378974243
14553	NC_016843	TAA	2	6	734846	734851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974243
14554	NC_016843	CAA	2	6	734876	734881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974243
14555	NC_016843	ATCC	2	8	734883	734890	25 %	25 %	0 %	50 %	378974243
14556	NC_016843	TTC	2	6	734931	734936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974243
14557	NC_016843	ACT	2	6	734941	734946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974243
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14563	NC_016843	CGT	2	6	735263	735268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974243
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14565	NC_016843	TCAA	2	8	735307	735314	50 %	25 %	0 %	25 %	378974243
14566	NC_016843	TCT	2	6	735329	735334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974243
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14570	NC_016843	CAAGA	2	10	735464	735473	60 %	0 %	20 %	20 %	378974243
14571	NC_016843	GTA	2	6	735534	735539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974243
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14588	NC_016843	CG	3	6	736438	736443	0 %	0 %	50 %	50 %	378974244
14589	NC_016843	CG	4	8	736558	736565	0 %	0 %	50 %	50 %	378974244
14590	NC_016843	CCA	2	6	736577	736582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974244
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14593	NC_016843	CAA	2	6	736724	736729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974244
14594	NC_016843	TGCATA	2	12	736735	736746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378974244
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14601	NC_016843	ACG	2	6	737106	737111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974244
14602	NC_016843	GT	3	6	737134	737139	0 %	50 %	50 %	0 %	378974244
14603	NC_016843	GC	3	6	737154	737159	0 %	0 %	50 %	50 %	378974244
14604	NC_016843	CAC	2	6	737229	737234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974244
14605	NC_016843	GCCAAT	2	12	737262	737273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378974245
14606	NC_016843	TAC	2	6	737331	737336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974245
14607	NC_016843	ACA	2	6	737379	737384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974245
14608	NC_016843	TCCC	2	8	737425	737432	0 %	25 %	0 %	75 %	378974245
14609	NC_016843	TA	3	6	737497	737502	50 %	50 %	0 %	0 %	378974245
14610	NC_016843	AGAA	2	8	737543	737550	75 %	0 %	25 %	0 %	378974245
14611	NC_016843	A	7	7	737567	737573	100 %	0 %	0 %	0 %	378974245
14612	NC_016843	A	6	6	737616	737621	100 %	0 %	0 %	0 %	378974245
14613	NC_016843	AC	3	6	737623	737628	50 %	0 %	0 %	50 %	378974245
14614	NC_016843	A	7	7	737673	737679	100 %	0 %	0 %	0 %	378974245
14615	NC_016843	GC	3	6	737770	737775	0 %	0 %	50 %	50 %	378974245
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14617	NC_016843	CAG	2	6	737902	737907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974245
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14619	NC_016843	C	6	6	738056	738061	0 %	0 %	0 %	100 %	378974245
14620	NC_016843	AGC	2	6	738092	738097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974245
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14990	NC_016843	TGC	2	6	757419	757424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974263
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14992	NC_016843	ACTTT	2	10	757468	757477	20 %	60 %	0 %	20 %	378974263
14993	NC_016843	T	6	6	757475	757480	0 %	100 %	0 %	0 %	378974263
14994	NC_016843	GCA	2	6	757491	757496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974263
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14996	NC_016843	TCG	2	6	757545	757550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974263
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