MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016843	CACG	2	8	705031	705038	25 %	0 %	25 %	50 %	378974217
14003	NC_016843	GC	3	6	705080	705085	0 %	0 %	50 %	50 %	378974217
14004	NC_016843	GC	3	6	705087	705092	0 %	0 %	50 %	50 %	378974217
14005	NC_016843	CA	3	6	705141	705146	50 %	0 %	0 %	50 %	378974217
14006	NC_016843	CTG	2	6	705147	705152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974217
14007	NC_016843	CAGTA	2	10	705228	705237	40 %	20 %	20 %	20 %	378974217
14008	NC_016843	ACG	2	6	705315	705320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974217
14009	NC_016843	A	7	7	705345	705351	100 %	0 %	0 %	0 %	378974217
14010	NC_016843	GAA	2	6	705359	705364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974217
14011	NC_016843	TGA	2	6	705448	705453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974217
14012	NC_016843	GTC	2	6	705649	705654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974217
14013	NC_016843	AGA	2	6	705664	705669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974217
14014	NC_016843	GT	3	6	705783	705788	0 %	50 %	50 %	0 %	378974217
14015	NC_016843	AACAA	2	10	705855	705864	80 %	0 %	0 %	20 %	378974217
14016	NC_016843	CG	3	6	705871	705876	0 %	0 %	50 %	50 %	378974217
14017	NC_016843	GTT	2	6	705896	705901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974217
14018	NC_016843	GCAC	2	8	705926	705933	25 %	0 %	25 %	50 %	378974217
14019	NC_016843	GT	3	6	705946	705951	0 %	50 %	50 %	0 %	378974217
14020	NC_016843	GAA	2	6	706037	706042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974217
14021	NC_016843	GA	3	6	706072	706077	50 %	0 %	50 %	0 %	378974217
14022	NC_016843	CGC	2	6	706093	706098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974217
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14024	NC_016843	GATC	2	8	706150	706157	25 %	25 %	25 %	25 %	378974217
14025	NC_016843	AAT	2	6	706252	706257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974217
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14027	NC_016843	AT	4	8	706320	706327	50 %	50 %	0 %	0 %	378974217
14028	NC_016843	CTTT	2	8	706373	706380	0 %	75 %	0 %	25 %	378974217
14029	NC_016843	TGC	2	6	706395	706400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974217
14030	NC_016843	GAACA	2	10	706446	706455	60 %	0 %	20 %	20 %	378974217
14031	NC_016843	A	6	6	706455	706460	100 %	0 %	0 %	0 %	378974217
14032	NC_016843	ATC	2	6	706472	706477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974217
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14035	NC_016843	AAC	2	6	706635	706640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974218
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14037	NC_016843	TAT	2	6	706704	706709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974218
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14039	NC_016843	CGA	2	6	706782	706787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974218
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14044	NC_016843	GCA	2	6	707044	707049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974218
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14048	NC_016843	A	7	7	707160	707166	100 %	0 %	0 %	0 %	378974218
14049	NC_016843	ACTG	2	8	707194	707201	25 %	25 %	25 %	25 %	378974218
14050	NC_016843	TCTG	2	8	707351	707358	0 %	50 %	25 %	25 %	378974219
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14053	NC_016843	TCT	2	6	707482	707487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974219
14054	NC_016843	AATT	2	8	707627	707634	50 %	50 %	0 %	0 %	378974219
14055	NC_016843	AT	3	6	707639	707644	50 %	50 %	0 %	0 %	378974219
14056	NC_016843	CGG	2	6	707682	707687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974219
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14059	NC_016843	TGC	2	6	708295	708300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974219
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14062	NC_016843	CTG	2	6	708483	708488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974219
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14094	NC_016843	A	6	6	710266	710271	100 %	0 %	0 %	0 %	378974221
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14105	NC_016843	CAAAC	2	10	711044	711053	60 %	0 %	0 %	40 %	378974222
14106	NC_016843	AGC	2	6	711072	711077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974222
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14111	NC_016843	TGCA	2	8	711509	711516	25 %	25 %	25 %	25 %	378974222
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14121	NC_016843	GT	3	6	712078	712083	0 %	50 %	50 %	0 %	378974223
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14123	NC_016843	TGA	2	6	712154	712159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974223
14124	NC_016843	ATC	2	6	712170	712175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974223
14125	NC_016843	CG	3	6	712222	712227	0 %	0 %	50 %	50 %	378974223
14126	NC_016843	AGAA	2	8	712285	712292	75 %	0 %	25 %	0 %	378974223
14127	NC_016843	ATGCA	2	10	712308	712317	40 %	20 %	20 %	20 %	378974223
14128	NC_016843	CAGGAT	2	12	712322	712333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974223
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14136	NC_016843	TCT	2	6	712708	712713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974223
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14142	NC_016843	ACGT	2	8	713071	713078	25 %	25 %	25 %	25 %	378974223
14143	NC_016843	ACA	2	6	713126	713131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974223
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14244	NC_016843	CCG	2	6	719270	719275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974228
14245	NC_016843	TGG	2	6	719324	719329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974228
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14247	NC_016843	ACA	2	6	719482	719487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974228
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14251	NC_016843	CTG	2	6	719574	719579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974229
14252	NC_016843	TGC	2	6	719580	719585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974229
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14258	NC_016843	CAA	2	6	719775	719780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974229
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14261	NC_016843	GC	3	6	719935	719940	0 %	0 %	50 %	50 %	378974229
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14264	NC_016843	GGC	2	6	720034	720039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974229
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14275	NC_016843	TC	3	6	720417	720422	0 %	50 %	0 %	50 %	378974230
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14282	NC_016843	AG	3	6	720708	720713	50 %	0 %	50 %	0 %	378974230
14283	NC_016843	TAT	2	6	720763	720768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974230
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14333	NC_016843	TCC	2	6	723407	723412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974233
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14355	NC_016843	A	7	7	724329	724335	100 %	0 %	0 %	0 %	378974234
14356	NC_016843	CAC	2	6	724518	724523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974234
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14359	NC_016843	CCA	2	6	724676	724681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974234
14360	NC_016843	TGA	3	9	724849	724857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974234
14361	NC_016843	ACAG	2	8	724924	724931	50 %	0 %	25 %	25 %	378974234
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14363	NC_016843	TCC	2	6	724981	724986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974234
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14484	NC_016843	ATG	2	6	731063	731068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974241
14485	NC_016843	GCAC	2	8	731204	731211	25 %	0 %	25 %	50 %	378974241
14486	NC_016843	CGGTA	2	10	731215	731224	20 %	20 %	40 %	20 %	378974241
14487	NC_016843	C	6	6	731232	731237	0 %	0 %	0 %	100 %	378974241
14488	NC_016843	TGGCA	2	10	731388	731397	20 %	20 %	40 %	20 %	378974241
14489	NC_016843	A	6	6	731447	731452	100 %	0 %	0 %	0 %	378974241
14490	NC_016843	CG	3	6	731467	731472	0 %	0 %	50 %	50 %	378974241
14491	NC_016843	CCA	2	6	731505	731510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974241
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14493	NC_016843	A	7	7	731836	731842	100 %	0 %	0 %	0 %	378974242
14494	NC_016843	CG	3	6	731855	731860	0 %	0 %	50 %	50 %	378974242
14495	NC_016843	AC	3	6	731876	731881	50 %	0 %	0 %	50 %	378974242
14496	NC_016843	CAT	2	6	731965	731970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974242
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14500	NC_016843	ACCGA	2	10	732116	732125	40 %	0 %	20 %	40 %	378974242

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