MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016843	GCC	2	6	631102	631107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974156
12502	NC_016843	GCA	2	6	631123	631128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974156
12503	NC_016843	AAC	2	6	631136	631141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974156
12504	NC_016843	CAC	2	6	631147	631152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974156
12505	NC_016843	G	6	6	631188	631193	0 %	0 %	100 %	0 %	378974156
12506	NC_016843	CTG	2	6	631202	631207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974156
12507	NC_016843	GC	4	8	631236	631243	0 %	0 %	50 %	50 %	378974156
12508	NC_016843	CCA	2	6	631385	631390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974156
12509	NC_016843	AC	3	6	631469	631474	50 %	0 %	0 %	50 %	378974156
12510	NC_016843	T	6	6	631493	631498	0 %	100 %	0 %	0 %	378974156
12511	NC_016843	CAT	2	6	631500	631505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974156
12512	NC_016843	G	6	6	631541	631546	0 %	0 %	100 %	0 %	378974156
12513	NC_016843	CG	4	8	631575	631582	0 %	0 %	50 %	50 %	378974156
12514	NC_016843	GTTT	2	8	631584	631591	0 %	75 %	25 %	0 %	378974156
12515	NC_016843	GAT	2	6	631613	631618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974156
12516	NC_016843	CAG	2	6	631643	631648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974157
12517	NC_016843	TG	3	6	631666	631671	0 %	50 %	50 %	0 %	378974157
12518	NC_016843	GC	3	6	631681	631686	0 %	0 %	50 %	50 %	378974157
12519	NC_016843	A	6	6	631735	631740	100 %	0 %	0 %	0 %	378974157
12520	NC_016843	TCC	2	6	631758	631763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974157
12521	NC_016843	TCA	2	6	631875	631880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974157
12522	NC_016843	A	6	6	632056	632061	100 %	0 %	0 %	0 %	378974157
12523	NC_016843	ACCAC	2	10	632067	632076	40 %	0 %	0 %	60 %	378974157
12524	NC_016843	AC	4	8	632075	632082	50 %	0 %	0 %	50 %	378974157
12525	NC_016843	CG	4	8	632088	632095	0 %	0 %	50 %	50 %	378974157
12526	NC_016843	TCG	2	6	632116	632121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974157
12527	NC_016843	CG	3	6	632137	632142	0 %	0 %	50 %	50 %	378974157
12528	NC_016843	ACGC	2	8	632155	632162	25 %	0 %	25 %	50 %	378974157
12529	NC_016843	ACGCGC	2	12	632176	632187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974157
12530	NC_016843	GAA	2	6	632202	632207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974157
12531	NC_016843	AAT	2	6	632300	632305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974157
12532	NC_016843	AAGG	2	8	632313	632320	50 %	0 %	50 %	0 %	378974157
12533	NC_016843	GGAA	2	8	632350	632357	50 %	0 %	50 %	0 %	378974157
12534	NC_016843	GC	4	8	632448	632455	0 %	0 %	50 %	50 %	378974158
12535	NC_016843	T	8	8	632480	632487	0 %	100 %	0 %	0 %	378974158
12536	NC_016843	CAG	2	6	632551	632556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974158
12537	NC_016843	GGC	2	6	632644	632649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974158
12538	NC_016843	TAT	2	6	632701	632706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974158
12539	NC_016843	GC	3	6	632845	632850	0 %	0 %	50 %	50 %	378974158
12540	NC_016843	GTAC	2	8	632860	632867	25 %	25 %	25 %	25 %	378974158
12541	NC_016843	CAC	2	6	633015	633020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974158
12542	NC_016843	ACG	2	6	633031	633036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974158
12543	NC_016843	TCTT	2	8	633095	633102	0 %	75 %	0 %	25 %	378974158
12544	NC_016843	T	7	7	633156	633162	0 %	100 %	0 %	0 %	378974158
12545	NC_016843	AGA	2	6	633179	633184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974158
12546	NC_016843	CTT	2	6	633196	633201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974158
12547	NC_016843	TGG	2	6	633218	633223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974158
12548	NC_016843	GAA	2	6	633274	633279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974158
12549	NC_016843	GTCA	2	8	633310	633317	25 %	25 %	25 %	25 %	378974158
12550	NC_016843	CT	4	8	633366	633373	0 %	50 %	0 %	50 %	378974158
12551	NC_016843	AAT	2	6	633417	633422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974158
12552	NC_016843	CTG	2	6	633437	633442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974158
12553	NC_016843	CTT	2	6	633491	633496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974158
12554	NC_016843	GT	3	6	633500	633505	0 %	50 %	50 %	0 %	378974158
12555	NC_016843	AGG	2	6	633560	633565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974158
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12557	NC_016843	TTCT	2	8	633678	633685	0 %	75 %	0 %	25 %	378974159
12558	NC_016843	AAGT	2	8	633693	633700	50 %	25 %	25 %	0 %	378974159
12559	NC_016843	CTG	2	6	633709	633714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974159
12560	NC_016843	ATT	2	6	633824	633829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974159
12561	NC_016843	GGA	2	6	633830	633835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974159
12562	NC_016843	GCAC	2	8	633898	633905	25 %	0 %	25 %	50 %	378974159
12563	NC_016843	TCA	2	6	633949	633954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974159
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12565	NC_016843	GC	3	6	634075	634080	0 %	0 %	50 %	50 %	378974159
12566	NC_016843	CAT	2	6	634082	634087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974159
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12569	NC_016843	CTG	2	6	634223	634228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974159
12570	NC_016843	TC	3	6	634230	634235	0 %	50 %	0 %	50 %	378974159
12571	NC_016843	CAG	2	6	634319	634324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974159
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12573	NC_016843	CAC	2	6	634456	634461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974160
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12582	NC_016843	GATG	2	8	634778	634785	25 %	25 %	50 %	0 %	378974160
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12591	NC_016843	CTTT	2	8	635170	635177	0 %	75 %	0 %	25 %	378974160
12592	NC_016843	ATCG	2	8	635288	635295	25 %	25 %	25 %	25 %	378974160
12593	NC_016843	GTTATT	2	12	635325	635336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378974160
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12601	NC_016843	T	6	6	636215	636220	0 %	100 %	0 %	0 %	378974161
12602	NC_016843	ACT	2	6	636226	636231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974161
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12604	NC_016843	AC	3	6	636337	636342	50 %	0 %	0 %	50 %	378974161
12605	NC_016843	GCT	2	6	636378	636383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974161
12606	NC_016843	CAGCA	2	10	636449	636458	40 %	0 %	20 %	40 %	378974161
12607	NC_016843	CAA	2	6	636551	636556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974161
12608	NC_016843	GA	3	6	636647	636652	50 %	0 %	50 %	0 %	378974161
12609	NC_016843	TCC	2	6	636691	636696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974161
12610	NC_016843	GAA	2	6	636705	636710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974161
12611	NC_016843	TCT	2	6	636711	636716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974161
12612	NC_016843	TAC	2	6	636760	636765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974161
12613	NC_016843	GAG	2	6	636837	636842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974161
12614	NC_016843	CTT	2	6	636866	636871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974161
12615	NC_016843	GTC	3	9	636939	636947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974161
12616	NC_016843	GT	3	6	637016	637021	0 %	50 %	50 %	0 %	378974161
12617	NC_016843	AGC	2	6	637090	637095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974161
12618	NC_016843	TGA	2	6	637160	637165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974161
12619	NC_016843	TAC	2	6	637167	637172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974161
12620	NC_016843	GC	3	6	637193	637198	0 %	0 %	50 %	50 %	378974161
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12990	NC_016843	ACGC	2	8	655214	655221	25 %	0 %	25 %	50 %	378974175
12991	NC_016843	AGG	2	6	655332	655337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974175
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12994	NC_016843	TCT	2	6	655553	655558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974175
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12997	NC_016843	AGC	2	6	655710	655715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974175
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13000	NC_016843	CTTT	2	8	655795	655802	0 %	75 %	0 %	25 %	378974175

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