MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016843	GTG	2	6	607202	607207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974137
12003	NC_016843	AAG	2	6	607253	607258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974137
12004	NC_016843	GCAG	2	8	607343	607350	25 %	0 %	50 %	25 %	378974137
12005	NC_016843	CCT	2	6	607371	607376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974137
12006	NC_016843	ACC	2	6	607388	607393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974137
12007	NC_016843	CTG	2	6	607415	607420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974137
12008	NC_016843	GCT	3	9	607436	607444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974137
12009	NC_016843	CGCT	2	8	607500	607507	0 %	25 %	25 %	50 %	378974137
12010	NC_016843	GC	3	6	607508	607513	0 %	0 %	50 %	50 %	378974137
12011	NC_016843	GGCGC	2	10	607540	607549	0 %	0 %	60 %	40 %	378974137
12012	NC_016843	CCA	2	6	607609	607614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974137
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12014	NC_016843	CGG	2	6	607765	607770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974137
12015	NC_016843	CTGT	2	8	607825	607832	0 %	50 %	25 %	25 %	378974137
12016	NC_016843	CCT	2	6	607856	607861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974137
12017	NC_016843	GC	3	6	607901	607906	0 %	0 %	50 %	50 %	378974137
12018	NC_016843	GACA	2	8	607942	607949	50 %	0 %	25 %	25 %	378974137
12019	NC_016843	AC	3	6	607967	607972	50 %	0 %	0 %	50 %	378974137
12020	NC_016843	GCCCCT	2	12	607973	607984	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378974137
12021	NC_016843	ATG	2	6	608012	608017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974137
12022	NC_016843	GC	3	6	608047	608052	0 %	0 %	50 %	50 %	378974137
12023	NC_016843	CCGC	2	8	608149	608156	0 %	0 %	25 %	75 %	378974137
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12025	NC_016843	GTAC	2	8	608205	608212	25 %	25 %	25 %	25 %	378974137
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12027	NC_016843	CTG	2	6	608239	608244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974137
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12029	NC_016843	AGA	2	6	608335	608340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974137
12030	NC_016843	ACGC	2	8	608359	608366	25 %	0 %	25 %	50 %	378974137
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12035	NC_016843	CTG	2	6	608669	608674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974138
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12039	NC_016843	GCA	2	6	608918	608923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974138
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12043	NC_016843	AGCG	2	8	609003	609010	25 %	0 %	50 %	25 %	378974138
12044	NC_016843	TCT	2	6	609037	609042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974138
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12051	NC_016843	GACA	2	8	609407	609414	50 %	0 %	25 %	25 %	378974138
12052	NC_016843	AGCT	2	8	609420	609427	25 %	25 %	25 %	25 %	378974138
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12488	NC_016843	CG	3	6	630652	630657	0 %	0 %	50 %	50 %	378974155
12489	NC_016843	CGA	2	6	630687	630692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974155
12490	NC_016843	AGA	3	9	630696	630704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974155
12491	NC_016843	GAA	2	6	630709	630714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974155
12492	NC_016843	ACG	2	6	630765	630770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974156
12493	NC_016843	T	6	6	630805	630810	0 %	100 %	0 %	0 %	378974156
12494	NC_016843	GC	3	6	630812	630817	0 %	0 %	50 %	50 %	378974156
12495	NC_016843	GCT	2	6	630825	630830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974156
12496	NC_016843	AG	3	6	630861	630866	50 %	0 %	50 %	0 %	378974156
12497	NC_016843	CA	3	6	630873	630878	50 %	0 %	0 %	50 %	378974156
12498	NC_016843	CGC	2	6	630888	630893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974156
12499	NC_016843	GC	3	6	630892	630897	0 %	0 %	50 %	50 %	378974156
12500	NC_016843	CTG	2	6	631046	631051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974156

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