MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016843	AAT	2	6	559548	559553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974089
11003	NC_016843	ACT	2	6	559607	559612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974089
11004	NC_016843	GAAA	2	8	559632	559639	75 %	0 %	25 %	0 %	378974089
11005	NC_016843	AGA	2	6	559652	559657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974089
11006	NC_016843	AGT	2	6	559687	559692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974089
11007	NC_016843	TG	3	6	559695	559700	0 %	50 %	50 %	0 %	378974089
11008	NC_016843	CGG	2	6	559746	559751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974089
11009	NC_016843	CTG	2	6	559789	559794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974089
11010	NC_016843	ACT	2	6	559824	559829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974089
11011	NC_016843	GA	3	6	559852	559857	50 %	0 %	50 %	0 %	378974089
11012	NC_016843	AGC	2	6	559875	559880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974089
11013	NC_016843	CAA	2	6	559892	559897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974089
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11015	NC_016843	ACA	2	6	559990	559995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974090
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11017	NC_016843	T	6	6	560097	560102	0 %	100 %	0 %	0 %	378974090
11018	NC_016843	T	6	6	560128	560133	0 %	100 %	0 %	0 %	378974090
11019	NC_016843	TGT	2	6	560171	560176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974090
11020	NC_016843	AC	3	6	560213	560218	50 %	0 %	0 %	50 %	378974090
11021	NC_016843	AT	3	6	560278	560283	50 %	50 %	0 %	0 %	378974090
11022	NC_016843	GCA	2	6	560327	560332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974090
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11024	NC_016843	TGA	2	6	560518	560523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974091
11025	NC_016843	GCT	2	6	560601	560606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974091
11026	NC_016843	GAAA	3	12	560705	560716	75 %	0 %	25 %	0 %	378974091
11027	NC_016843	AAG	2	6	560717	560722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974091
11028	NC_016843	TAT	2	6	560723	560728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974091
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11031	NC_016843	CGA	2	6	560879	560884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974091
11032	NC_016843	TCG	2	6	560893	560898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974091
11033	NC_016843	TCAGTA	2	12	560932	560943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378974091
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11035	NC_016843	GCAG	2	8	561106	561113	25 %	0 %	50 %	25 %	378974091
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11038	NC_016843	TTA	2	6	561279	561284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974092
11039	NC_016843	GGA	2	6	561307	561312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974092
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11042	NC_016843	GA	3	6	561396	561401	50 %	0 %	50 %	0 %	378974092
11043	NC_016843	GTGCA	2	10	561494	561503	20 %	20 %	40 %	20 %	378974092
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11052	NC_016843	AGT	2	6	561783	561788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974092
11053	NC_016843	TACT	2	8	561805	561812	25 %	50 %	0 %	25 %	378974092
11054	NC_016843	TCA	2	6	561822	561827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974092
11055	NC_016843	AAG	2	6	561943	561948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974092
11056	NC_016843	TTAA	2	8	561960	561967	50 %	50 %	0 %	0 %	378974092
11057	NC_016843	GGC	2	6	562064	562069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974092
11058	NC_016843	T	6	6	562074	562079	0 %	100 %	0 %	0 %	378974092
11059	NC_016843	TTTG	2	8	562150	562157	0 %	75 %	25 %	0 %	378974092
11060	NC_016843	A	6	6	562248	562253	100 %	0 %	0 %	0 %	378974092
11061	NC_016843	AAT	2	6	562313	562318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974092
11062	NC_016843	GCA	2	6	562354	562359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974092
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11064	NC_016843	T	7	7	562512	562518	0 %	100 %	0 %	0 %	378974092
11065	NC_016843	CAT	2	6	562519	562524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974092
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11069	NC_016843	TG	3	6	563849	563854	0 %	50 %	50 %	0 %	378974093
11070	NC_016843	GGT	2	6	563886	563891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974093
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11072	NC_016843	A	6	6	563968	563973	100 %	0 %	0 %	0 %	378974093
11073	NC_016843	TACC	2	8	564026	564033	25 %	25 %	0 %	50 %	378974093
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11102	NC_016843	CG	3	6	565227	565232	0 %	0 %	50 %	50 %	378974094
11103	NC_016843	GGA	2	6	565257	565262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974094
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11105	NC_016843	AC	3	6	565338	565343	50 %	0 %	0 %	50 %	378974094
11106	NC_016843	CAA	2	6	565380	565385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974094
11107	NC_016843	CTG	2	6	565386	565391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974094
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11110	NC_016843	ATG	2	6	565466	565471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974094
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