MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016843	CTA	2	6	532949	532954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10502	NC_016843	TTC	2	6	532976	532981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974069
10503	NC_016843	GGA	2	6	532989	532994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974069
10504	NC_016843	TAC	2	6	533078	533083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10505	NC_016843	GC	4	8	533097	533104	0 %	0 %	50 %	50 %	378974069
10506	NC_016843	GAA	2	6	533122	533127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974069
10507	NC_016843	GGC	2	6	533155	533160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974069
10508	NC_016843	TGC	2	6	533215	533220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974069
10509	NC_016843	CTA	2	6	533221	533226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10510	NC_016843	CG	3	6	533297	533302	0 %	0 %	50 %	50 %	378974069
10511	NC_016843	CTA	2	6	533359	533364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10512	NC_016843	TAC	2	6	533378	533383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10513	NC_016843	TGC	2	6	533668	533673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974069
10514	NC_016843	ATC	2	6	533763	533768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974069
10515	NC_016843	GCGG	2	8	533809	533816	0 %	0 %	75 %	25 %	378974069
10516	NC_016843	GGC	2	6	533820	533825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974069
10517	NC_016843	T	6	6	533900	533905	0 %	100 %	0 %	0 %	378974070
10518	NC_016843	CTG	2	6	533919	533924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974070
10519	NC_016843	GGAA	2	8	533968	533975	50 %	0 %	50 %	0 %	378974070
10520	NC_016843	GTC	2	6	533984	533989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974070
10521	NC_016843	TGG	2	6	534003	534008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974070
10522	NC_016843	AGT	2	6	534031	534036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974070
10523	NC_016843	TGT	2	6	534063	534068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974070
10524	NC_016843	TAC	2	6	534133	534138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974070
10525	NC_016843	GAT	2	6	534145	534150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974070
10526	NC_016843	GAG	2	6	534299	534304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974070
10527	NC_016843	TGC	2	6	534310	534315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974070
10528	NC_016843	AGA	2	6	534340	534345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974070
10529	NC_016843	GT	3	6	534362	534367	0 %	50 %	50 %	0 %	378974070
10530	NC_016843	G	8	8	534374	534381	0 %	0 %	100 %	0 %	378974070
10531	NC_016843	TGG	2	6	534417	534422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974070
10532	NC_016843	ATT	2	6	534500	534505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974070
10533	NC_016843	GAA	2	6	534680	534685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974070
10534	NC_016843	CCT	2	6	534710	534715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974070
10535	NC_016843	TCG	2	6	534732	534737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974070
10536	NC_016843	CT	3	6	534766	534771	0 %	50 %	0 %	50 %	378974070
10537	NC_016843	T	10	10	534947	534956	0 %	100 %	0 %	0 %	378974071
10538	NC_016843	TCT	2	6	535018	535023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974071
10539	NC_016843	AGG	2	6	535025	535030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974071
10540	NC_016843	T	7	7	535106	535112	0 %	100 %	0 %	0 %	378974071
10541	NC_016843	AAC	2	6	535180	535185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974071
10542	NC_016843	TTG	2	6	535339	535344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974071
10543	NC_016843	TGT	2	6	535385	535390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974071
10544	NC_016843	GTTG	2	8	535415	535422	0 %	50 %	50 %	0 %	378974071
10545	NC_016843	GTG	2	6	535428	535433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974071
10546	NC_016843	GATT	2	8	535522	535529	25 %	50 %	25 %	0 %	378974071
10547	NC_016843	G	6	6	535538	535543	0 %	0 %	100 %	0 %	378974071
10548	NC_016843	GAA	2	6	535574	535579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974071
10549	NC_016843	AAG	2	6	535780	535785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974071
10550	NC_016843	GAT	2	6	535795	535800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974071
10551	NC_016843	CTTTT	2	10	535830	535839	0 %	80 %	0 %	20 %	378974072
10552	NC_016843	GTA	2	6	535910	535915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974072
10553	NC_016843	GTG	2	6	535940	535945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974072
10554	NC_016843	ATT	2	6	535976	535981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974072
10555	NC_016843	TC	3	6	535998	536003	0 %	50 %	0 %	50 %	378974072
10556	NC_016843	TTCG	2	8	536017	536024	0 %	50 %	25 %	25 %	378974072
10557	NC_016843	CAC	2	6	536029	536034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974072
10558	NC_016843	ATATC	2	10	536068	536077	40 %	40 %	0 %	20 %	378974072
10559	NC_016843	GAG	2	6	536151	536156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974072
10560	NC_016843	TTC	2	6	536293	536298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974072
10561	NC_016843	TC	3	6	536315	536320	0 %	50 %	0 %	50 %	378974073
10562	NC_016843	TCG	2	6	536367	536372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974073
10563	NC_016843	TGT	2	6	536385	536390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974073
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10566	NC_016843	GTA	2	6	536466	536471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974073
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10570	NC_016843	CCG	2	6	536668	536673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974073
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10580	NC_016843	CGT	2	6	537422	537427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974073
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10583	NC_016843	TGGA	2	8	537615	537622	25 %	25 %	50 %	0 %	378974073
10584	NC_016843	GC	3	6	537835	537840	0 %	0 %	50 %	50 %	378974073
10585	NC_016843	CTC	2	6	537868	537873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974073
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10588	NC_016843	GGT	2	6	538003	538008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974073
10589	NC_016843	GAATGG	2	12	538037	538048	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974073
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10591	NC_016843	TTC	2	6	538260	538265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974074
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10599	NC_016843	TCC	2	6	538739	538744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974074
10600	NC_016843	T	7	7	538849	538855	0 %	100 %	0 %	0 %	378974074
10601	NC_016843	GGT	2	6	538881	538886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974074
10602	NC_016843	CT	3	6	538897	538902	0 %	50 %	0 %	50 %	378974074
10603	NC_016843	GAA	2	6	538904	538909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974074
10604	NC_016843	TAC	3	9	538912	538920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974074
10605	NC_016843	TTAC	2	8	538925	538932	25 %	50 %	0 %	25 %	378974074
10606	NC_016843	GCT	2	6	538968	538973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974074
10607	NC_016843	GAT	2	6	539001	539006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974074
10608	NC_016843	GCA	2	6	539151	539156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974074
10609	NC_016843	TTCT	2	8	539180	539187	0 %	75 %	0 %	25 %	378974074
10610	NC_016843	TTG	2	6	539201	539206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974074
10611	NC_016843	GTTTG	2	10	539220	539229	0 %	60 %	40 %	0 %	378974074
10612	NC_016843	TGT	2	6	539234	539239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974074
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10615	NC_016843	GT	3	6	539306	539311	0 %	50 %	50 %	0 %	378974074
10616	NC_016843	TGG	2	6	539403	539408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974074
10617	NC_016843	GAT	2	6	539427	539432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974074
10618	NC_016843	TGA	2	6	539447	539452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974074
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