MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016843	GACA	2	8	507646	507653	50 %	0 %	25 %	25 %	378974050
10003	NC_016843	ACACA	2	10	507776	507785	60 %	0 %	0 %	40 %	378974050
10004	NC_016843	T	7	7	507837	507843	0 %	100 %	0 %	0 %	378974050
10005	NC_016843	GC	3	6	507857	507862	0 %	0 %	50 %	50 %	378974050
10006	NC_016843	TTC	2	6	507916	507921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974050
10007	NC_016843	AGCT	2	8	507951	507958	25 %	25 %	25 %	25 %	378974050
10008	NC_016843	CTG	2	6	508140	508145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974050
10009	NC_016843	TGA	2	6	508224	508229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974050
10010	NC_016843	TC	3	6	508281	508286	0 %	50 %	0 %	50 %	378974050
10011	NC_016843	CCTG	2	8	508316	508323	0 %	25 %	25 %	50 %	378974050
10012	NC_016843	ATA	2	6	508427	508432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974050
10013	NC_016843	GCA	2	6	508536	508541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974051
10014	NC_016843	CAG	2	6	508550	508555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974051
10015	NC_016843	ACG	2	6	508656	508661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974051
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10017	NC_016843	ACG	2	6	508737	508742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974051
10018	NC_016843	GT	3	6	508794	508799	0 %	50 %	50 %	0 %	378974051
10019	NC_016843	GCACG	2	10	508835	508844	20 %	0 %	40 %	40 %	378974051
10020	NC_016843	GCG	2	6	508887	508892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974051
10021	NC_016843	TCT	2	6	508911	508916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974051
10022	NC_016843	ATTT	2	8	508943	508950	25 %	75 %	0 %	0 %	378974051
10023	NC_016843	G	6	6	509006	509011	0 %	0 %	100 %	0 %	378974051
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10027	NC_016843	CGC	2	6	509180	509185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974051
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10029	NC_016843	GGCA	2	8	509290	509297	25 %	0 %	50 %	25 %	378974052
10030	NC_016843	ATC	2	6	509300	509305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974052
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10033	NC_016843	GTC	2	6	509360	509365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974052
10034	NC_016843	TCG	2	6	509646	509651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974052
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10040	NC_016843	GCAG	2	8	509977	509984	25 %	0 %	50 %	25 %	378974052
10041	NC_016843	GAC	2	6	510013	510018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974052
10042	NC_016843	ACG	2	6	510027	510032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974052
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10044	NC_016843	GTA	2	6	510113	510118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974052
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10047	NC_016843	TGC	2	6	510318	510323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974052
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10050	NC_016843	ACGT	2	8	510501	510508	25 %	25 %	25 %	25 %	378974052
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10054	NC_016843	CG	3	6	510750	510755	0 %	0 %	50 %	50 %	378974052
10055	NC_016843	GCG	2	6	510793	510798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974052
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10058	NC_016843	CCA	2	6	511114	511119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974053
10059	NC_016843	GTC	2	6	511124	511129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974053
10060	NC_016843	AGCCC	2	10	511193	511202	20 %	0 %	20 %	60 %	378974053
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10063	NC_016843	T	6	6	511833	511838	0 %	100 %	0 %	0 %	378974054
10064	NC_016843	TTCG	2	8	511898	511905	0 %	50 %	25 %	25 %	378974054
10065	NC_016843	GC	3	6	512001	512006	0 %	0 %	50 %	50 %	378974054
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10094	NC_016843	GGC	2	6	513153	513158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974055
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10119	NC_016843	CGC	2	6	514234	514239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974055
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10245	NC_016843	CG	3	6	520016	520021	0 %	0 %	50 %	50 %	378974059
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10356	NC_016843	ATGA	2	8	525287	525294	50 %	25 %	25 %	0 %	378974061
10357	NC_016843	AGCA	2	8	525359	525366	50 %	0 %	25 %	25 %	378974061
10358	NC_016843	CAG	2	6	525373	525378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974061
10359	NC_016843	CGTG	2	8	525865	525872	0 %	25 %	50 %	25 %	378974062
10360	NC_016843	G	6	6	525882	525887	0 %	0 %	100 %	0 %	378974062
10361	NC_016843	CTGC	2	8	526013	526020	0 %	25 %	25 %	50 %	378974062
10362	NC_016843	TAC	2	6	526048	526053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974062
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